276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2900 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2900  prophage MuMc02, DNA methyltransferase  100 
 
 
265 aa  554  1e-157  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470723  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1409  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.89 
 
 
243 aa  171  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0420  site-specific DNA-methyltransferase  39.92 
 
 
243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1423  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.48 
 
 
237 aa  162  6e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1486  site-specific DNA-methyltransferase  38.46 
 
 
243 aa  161  1e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1338  site-specific DNA-methyltransferase  38.79 
 
 
258 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.287201  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0186  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.72 
 
 
249 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4855  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.5 
 
 
249 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.862856  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1300  adenine specific DNA methyltransferase, putative  37.76 
 
 
247 aa  149  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01365  DNA methylase  36.97 
 
 
236 aa  148  8e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.255281  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1308  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.91 
 
 
253 aa  142  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169451 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2741  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.73 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0701  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.55 
 
 
238 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2104  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.12 
 
 
269 aa  134  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.636734  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0913  site-specific DNA-methyltransferase  43.04 
 
 
173 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2608  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.96 
 
 
265 aa  125  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000327193 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3651  DNA methylase  38.46 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.061929  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3667  DNA methylase  39.01 
 
 
138 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.22 
 
 
419 aa  85.5  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.24 
 
 
239 aa  85.1  0.000000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  30.8 
 
 
304 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0702  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.52 
 
 
367 aa  77.4  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0606262  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  27.82 
 
 
311 aa  76.6  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4367  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.76 
 
 
358 aa  75.9  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0050  putative methylase  26.29 
 
 
227 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000518664  normal  0.980078 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0965  DNA methylase N-4/N-6  27.04 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0043  putative methylase  26.26 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.181539  normal  0.0471117 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2855  DNA methylase N-4/N-6  28.78 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0194641  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0013  putative methylase  26.74 
 
 
227 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0132  putative methylase  24.57 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000100441 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3343  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.89 
 
 
369 aa  72.4  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  hitchhiker  0.00000416126 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0009  putative methylase  25.84 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0988  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.57 
 
 
225 aa  72  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0151076  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3043  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.69 
 
 
375 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00264807  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0541  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.27 
 
 
398 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336098  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1474  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.63 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3036  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.41 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0660763  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2942  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.41 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361147  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.13 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2231  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.86 
 
 
369 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0921492  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3008  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.29 
 
 
370 aa  70.1  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.367581 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3289  DNA methylase N-4/N-6  28.02 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.39 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0821  haemagglutinin associated protein  27.47 
 
 
230 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.893321  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.12 
 
 
359 aa  68.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.27 
 
 
377 aa  68.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.220402  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3296  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.08 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.912166  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0491  modification methylase BabI  27.24 
 
 
377 aa  67.4  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0941  DNA methylase  28.81 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0495  modification methylase BabI  27.24 
 
 
386 aa  67.4  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.84 
 
 
327 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2784  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.89 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0534146  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.32 
 
 
370 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1449  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.99 
 
 
360 aa  67  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.103238  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0763  DNA adenine methylase CcrM  27.47 
 
 
372 aa  66.6  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3210  DNA methylase N-4/N-6  26.62 
 
 
367 aa  66.2  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0413  modification methylase CcrMI  25.57 
 
 
378 aa  66.2  0.0000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1840  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.95 
 
 
284 aa  65.5  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291507  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2136  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.97 
 
 
273 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0024  adenine-specific methyltransferase  27.64 
 
 
368 aa  65.1  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109862  normal  0.210092 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1080  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  25.18 
 
 
305 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  28.11 
 
 
436 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0710  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.69 
 
 
396 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.256759 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3164  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.5 
 
 
225 aa  65.1  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0356148  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1173  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.82 
 
 
389 aa  64.3  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1982  DNA-methyltransferase (DNA-modification methylase) protein  27.24 
 
 
270 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0159066 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1611  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.31 
 
 
226 aa  64.3  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0124  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  23.62 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3157  DNA methylase N-4/N-6  26.91 
 
 
266 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0569  DNA methylase N-4/N-6  26.64 
 
 
215 aa  63.5  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1084  cell cycle regulated site-specific DNA-methyltransferase protein  26.03 
 
 
377 aa  63.9  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1070  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.94 
 
 
223 aa  63.9  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1597  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.05 
 
 
379 aa  62.8  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111041 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1812  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.59 
 
 
273 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.91 
 
 
380 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0878  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.11 
 
 
464 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643395  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4621  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.2 
 
 
283 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0315645  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3505  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.88 
 
 
398 aa  62  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.602417 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0501  haemagglutinin associated protein  24.79 
 
 
230 aa  62  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0486042  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3854  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.67 
 
 
283 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3181  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.88 
 
 
398 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4408  DNA methylase N-4/N-6  25.67 
 
 
283 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3844  DNA methylase N-4/N-6  26.98 
 
 
276 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3349  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.67 
 
 
283 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206831  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3569  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.67 
 
 
283 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3959  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.67 
 
 
283 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135356  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3376  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.88 
 
 
370 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.91 
 
 
379 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2607  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.58 
 
 
237 aa  61.6  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000328335 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.96 
 
 
382 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2124  DNA methylase N-4/N-6  25.67 
 
 
283 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775437  normal  0.0115493 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1840  DNA methylase N-4/N-6  24.41 
 
 
380 aa  61.2  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0373756  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2101  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.29 
 
 
376 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.528087 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0392  DNA methylase N-4/N-6  26.56 
 
 
367 aa  60.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.723409 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.71 
 
 
305 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0355  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  26.94 
 
 
289 aa  60.1  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2649  DNA methylase N-4/N-6  27.2 
 
 
389 aa  60.1  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0120  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.64 
 
 
225 aa  60.1  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0225106 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3357  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.07 
 
 
225 aa  59.7  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0682  DNA methylase N-4/N-6  27.67 
 
 
230 aa  59.7  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>