More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1306 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3231  DnaK-related protein  47.7 
 
 
929 aa  671    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.717764  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02520  hypothetical protein  45.77 
 
 
941 aa  841    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1306  DnaK-related protein  100 
 
 
951 aa  1891    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5107  molecular chaperone-like protein  53.47 
 
 
918 aa  860    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0059  DnaK-related protein  51.91 
 
 
942 aa  827    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3945  molecular chaperone-like protein  53.25 
 
 
918 aa  864    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.922254 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003559  DnaK-related protein  45.46 
 
 
936 aa  837    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5719  DnaK-related protein  45.67 
 
 
951 aa  716    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.376499 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0986  hypothetical protein  46.36 
 
 
948 aa  822    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1753  putative chaperone heat-shock protein  51.51 
 
 
926 aa  892    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.277549  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1458  DnaK-related protein  52.13 
 
 
935 aa  847    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.103212  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2135  putative chaperone protein, HscA/DnaK  50.62 
 
 
961 aa  871    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0047  heat shock protein 70  52.02 
 
 
935 aa  844    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3740  putative chaperone heat-shock protein  48.39 
 
 
952 aa  784    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.207113 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2544  molecular chaperone-like  53.27 
 
 
914 aa  855    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.374028  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3698  DnaK-related protein  45.47 
 
 
956 aa  744    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.900724 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1319  DnaK-related protein  52.99 
 
 
931 aa  844    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.981392  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3032  DnaK-related protein  47.86 
 
 
925 aa  664    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192124  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1827  putative chaperone heat-shock protein  45.33 
 
 
938 aa  842    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.276059  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2123  putative chaperone protein, HscA/DnaK  49.85 
 
 
986 aa  876    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1233  chaperone DnaK-related protein  48.83 
 
 
939 aa  884    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0953918 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3130  DnaK-related protein  47.81 
 
 
929 aa  656    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5541  DnaK-related protein  51.27 
 
 
949 aa  874    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0176695 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3676  putative chaperone protein, HscA/DnaK  50.99 
 
 
966 aa  839    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.771726  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0495  DnaK-related protein  45.61 
 
 
951 aa  744    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0799575  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1546  DnaK-related protein  51.91 
 
 
935 aa  844    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5309  molecular chaperone-like protein  52.71 
 
 
918 aa  844    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3575  molecular chaperone-like protein  53.48 
 
 
918 aa  865    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0471148  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3490  molecular chaperone-like protein  52.61 
 
 
918 aa  850    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0310238 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3012  DnaK-related protein  45.83 
 
 
936 aa  623  1e-177  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.791103  normal  0.506034 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0343  DnaK-related protein  41.56 
 
 
971 aa  598  1e-169  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.87364 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2055  molecular chaperone  39.2 
 
 
906 aa  587  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.421939  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0152  Heat shock protein 70  41.28 
 
 
987 aa  575  1.0000000000000001e-162  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0625  DnaK-related protein  36.61 
 
 
961 aa  515  1e-144  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3013  putative heat-shock chaperone protein  45.8 
 
 
620 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1232  chaperone DnaK-related protein  40.91 
 
 
643 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0436867 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3232  putative heat-shock chaperone protein  44.89 
 
 
627 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.838749  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3131  putative heat-shock chaperone protein  45.05 
 
 
627 aa  415  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1305  DnaK-related protein  43.72 
 
 
658 aa  410  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0497  putative heat-shock chaperone protein  44.36 
 
 
636 aa  405  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271462  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5720  putative heat-shock chaperone protein  43.2 
 
 
621 aa  403  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.531884 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0151  molecular chaperone  43.92 
 
 
622 aa  402  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1826  putative heat-shock chaperone protein  38.75 
 
 
606 aa  398  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0143123  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3033  putative heat-shock chaperone protein  44.86 
 
 
631 aa  399  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3696  putative heat-shock chaperone protein  43.95 
 
 
636 aa  399  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.297588  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0058  DnaK-related protein  42.97 
 
 
615 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3677  putative molecular chaperone protein HspA/DnaK  41.88 
 
 
637 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.786071  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5540  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  41.96 
 
 
619 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218183  normal  0.0196967 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003558  DnaK-related protein  39.14 
 
 
651 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00228279  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02519  molecular chaperone  39.3 
 
 
654 aa  388  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0045  heat shock protein 70  43.5 
 
 
615 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1320  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  42.72 
 
 
615 aa  385  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2124  putative molecular chaperone protein HspA/DnaK  42.46 
 
 
622 aa  385  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1545  putative chaperone protein  43.5 
 
 
615 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.166713  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2545  molecular chaperone-like  41.95 
 
 
613 aa  382  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173516  normal  0.908818 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5108  molecular chaperone-like protein  42.14 
 
 
613 aa  383  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.968057  normal  0.0457936 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1457  putative chaperone protein  43.18 
 
 
615 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3946  molecular chaperone-like protein  41.82 
 
 
613 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537274  normal  0.958876 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1752  putative heat-shock chaperone protein  43.02 
 
 
614 aa  378  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3489  molecular chaperone-like protein  41.3 
 
 
613 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00629635 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3922  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  41.15 
 
 
596 aa  377  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3574  molecular chaperone-like protein  42.14 
 
 
613 aa  379  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0682429  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3739  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  41.56 
 
 
610 aa  376  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.676013  normal  0.253359 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5308  molecular chaperone-like protein  41.3 
 
 
613 aa  376  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2134  putative molecular chaperone protein HspA/DnaK  41.82 
 
 
619 aa  362  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.660367  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2054  heat shock protein 70  38.94 
 
 
592 aa  360  7e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.462167  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0987  hypothetical protein  37.23 
 
 
513 aa  298  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1481  chaperone protein HscA  26.96 
 
 
625 aa  102  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0290356 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1660  chaperone protein HscA  27.6 
 
 
625 aa  100  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072963 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1043  chaperone protein HscA  30.58 
 
 
621 aa  95.1  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1242  Fe-S protein assembly chaperone HscA  28.43 
 
 
622 aa  93.6  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1024  chaperone protein HscA  30.8 
 
 
621 aa  92  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.662352  normal  0.182467 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0804  Fe-S protein assembly chaperone HscA  27.96 
 
 
622 aa  92.4  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.428496  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0876  chaperone protein HscA  30.23 
 
 
620 aa  92  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.70427  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2032  chaperone protein HscA  29.82 
 
 
622 aa  91.7  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2139  chaperone protein HscA  29.43 
 
 
622 aa  91.3  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.64076 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1633  chaperone protein HscA  30.94 
 
 
650 aa  91.3  9e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.898669  hitchhiker  0.000131814 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0846  chaperone protein HscA  30 
 
 
620 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0889  chaperone protein HscA  30.23 
 
 
620 aa  90.1  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000727661 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1136  chaperone protein HscA  30.31 
 
 
620 aa  89  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1148  chaperone protein HscA  29.19 
 
 
622 aa  88.6  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.505415  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5955  chaperone protein HscA  28.97 
 
 
622 aa  88.2  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2122  chaperone protein HscA  28.97 
 
 
622 aa  88.2  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3808  molecular chaperone DnaK  30 
 
 
622 aa  87.8  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5428  chaperone protein HscA  29.36 
 
 
622 aa  87.8  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266474  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1364  Fe-S protein assembly chaperone HscA  31.25 
 
 
636 aa  87.8  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3507  chaperone protein HscA  33.58 
 
 
621 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4608  chaperone protein HscA  32.33 
 
 
621 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.317931  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4332  chaperone protein HscA  30 
 
 
620 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000366602 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2159  chaperone protein HscA  29.75 
 
 
622 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.265898  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1241  chaperone protein HscA  32.25 
 
 
620 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0622  chaperone protein HscA  31.64 
 
 
625 aa  85.9  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.199695  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14780  chaperone protein HscA  33.96 
 
 
619 aa  86.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0406  heat shock protein Hsp70  27.89 
 
 
618 aa  85.9  0.000000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0440  chaperone protein DnaK  29.77 
 
 
618 aa  85.1  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1303  chaperone protein HscA  33.58 
 
 
619 aa  84.7  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323166  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04420  chaperone protein DnaK  30.56 
 
 
619 aa  84.7  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.21875 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1029  2-alkenal reductase  26.98 
 
 
527 aa  84.7  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.777286  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1454  chaperone protein HscA  29.89 
 
 
623 aa  84.7  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2377  chaperone protein HscA  29.53 
 
 
622 aa  84.7  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.750622  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>