151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0611 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0611  mercuric ion binding protein, putative  100 
 
 
68 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.259599  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0206  Heavy metal transport/detoxification protein  50.77 
 
 
69 aa  67  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.855434  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  44.78 
 
 
68 aa  60.5  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  44.62 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  42.19 
 
 
70 aa  58.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0334  heavy metal-binding domain-containing protein  46.77 
 
 
68 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000340547  normal  0.151356 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  41.27 
 
 
942 aa  54.7  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3683  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 
791 aa  52.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00270096  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2045  Heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 
68 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0135722  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  38.46 
 
 
67 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  38.46 
 
 
67 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  36.36 
 
 
811 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  36.36 
 
 
811 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2086  heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 
68 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000331725  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2405  heavy metal transport/detoxification protein  32.84 
 
 
68 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  40.3 
 
 
75 aa  51.6  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  38.81 
 
 
71 aa  51.2  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 
67 aa  51.6  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  38.1 
 
 
91 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  38.71 
 
 
68 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1925  copper-translocating P-type ATPase  41.79 
 
 
838 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.715176  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  35.38 
 
 
868 aa  50.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3058  copper-translocating P-type ATPase  38.1 
 
 
740 aa  50.4  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84044  copper-transporting ATPase (Cu(2+)-ATPase)  34.92 
 
 
1196 aa  49.3  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00231928  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  36.92 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4541  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
75 aa  48.1  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  34.43 
 
 
976 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  30.77 
 
 
743 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1802  heavy metal transport/detoxification protein  32.31 
 
 
71 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.125467  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0468  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 
820 aa  47.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  35.94 
 
 
821 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2770  protein of unknown function DUF182  40 
 
 
345 aa  47.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0315  hypothetical protein  42.31 
 
 
113 aa  47  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2514  heavy metal translocating P-type ATPase  35.94 
 
 
845 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.229137  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  35.94 
 
 
839 aa  47  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2185  heavy metal translocating P-type ATPase  35.94 
 
 
754 aa  47  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  37.88 
 
 
69 aa  47  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0720  Heavy metal transport/detoxification protein  35 
 
 
76 aa  46.2  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000178805 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  35.94 
 
 
885 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  41.18 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0577  heavy metal translocating P-type ATPase  32.79 
 
 
842 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.951619  normal  0.619407 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2449  Heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 
64 aa  45.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228051  normal  0.0680079 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  33.87 
 
 
818 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0243  heavy metal translocating P-type ATPase  35.94 
 
 
833 aa  45.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3052  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 
866 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2409  heavy metal translocating P-type ATPase  34.38 
 
 
816 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.876205 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  32.84 
 
 
77 aa  45.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  37.1 
 
 
751 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  33.85 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  38.33 
 
 
77 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1663  PBP/HMA domain-containing protein  34.92 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140862  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  35.48 
 
 
68 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  35.48 
 
 
68 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2844  Heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 
68 aa  45.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  35.38 
 
 
938 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  34.38 
 
 
954 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  28.79 
 
 
753 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  42.65 
 
 
68 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0021  copper ion binding protein  37.1 
 
 
70 aa  44.7  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00208737  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  31.75 
 
 
805 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  31.75 
 
 
805 aa  44.7  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  31.75 
 
 
805 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  31.75 
 
 
805 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3375  heavy metal translocating P-type ATPase  38.33 
 
 
779 aa  44.7  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1849  heavy metal transport/detoxification protein  34.92 
 
 
499 aa  44.3  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3411  hypothetical protein  34.38 
 
 
803 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11673  probable copper-transporting ATPase  31.34 
 
 
195 aa  44.7  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2692  heavy metal translocating P-type ATPase  43.08 
 
 
887 aa  44.3  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0975857 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  33.87 
 
 
797 aa  44.7  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  28.57 
 
 
837 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  31.75 
 
 
805 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  31.75 
 
 
805 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  31.75 
 
 
805 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2277  heavy metal transport/detoxification protein  35.09 
 
 
59 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.938593  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0745  Heavy metal transport/detoxification protein  35.48 
 
 
471 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1856  copper-translocating P-type ATPase  39.06 
 
 
890 aa  43.9  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01501  putative P-type ATPase transporter for copper  33.85 
 
 
764 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  30.77 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1149  copper ion binding protein  35.38 
 
 
74 aa  43.9  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  26.98 
 
 
831 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2452  copper-translocating P-type ATPase  31.34 
 
 
797 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.7313  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2902  mercuric transport protein periplasmic component  36.51 
 
 
98 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
849 aa  43.9  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 
812 aa  43.5  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  37.31 
 
 
68 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  37.31 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6742  Heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 
196 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.685267 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4950  copper-translocating P-type ATPase  31.03 
 
 
748 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.113213 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  34.92 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0905  heavy metal translocating P-type ATPase  35 
 
 
802 aa  43.5  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.631984  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  34.92 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3089  heavy metal transport/detoxification protein  31.75 
 
 
199 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  25.4 
 
 
806 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2989  Heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2923  heavy metal translocating P-type ATPase  32.84 
 
 
795 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000167439  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  37.31 
 
 
68 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  30.16 
 
 
806 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  37.31 
 
 
68 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  37.31 
 
 
68 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  25.4 
 
 
806 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>