237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf815 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf815  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 
218 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  39.91 
 
 
222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  38.79 
 
 
226 aa  160  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  38.32 
 
 
226 aa  159  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  38.25 
 
 
222 aa  159  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2831  uracil-DNA glycosylase  40.19 
 
 
221 aa  157  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00406873  normal  0.934783 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  40.19 
 
 
218 aa  155  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  38.97 
 
 
220 aa  154  8e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  37.73 
 
 
224 aa  154  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3577  uracil-DNA glycosylase  36.28 
 
 
222 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0613  uracil-DNA glycosylase  38.86 
 
 
222 aa  153  2e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  37.16 
 
 
228 aa  153  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  35.65 
 
 
226 aa  152  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3988  uracil-DNA glycosylase  37.21 
 
 
222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.409874 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  40.22 
 
 
241 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  36.7 
 
 
228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3065  uracil-DNA glycosylase  36.87 
 
 
229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.550581  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2912  uracil-DNA glycosylase  38.71 
 
 
221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0496469  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  37.09 
 
 
225 aa  152  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  35.35 
 
 
243 aa  151  8e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3688  uracil-DNA glycosylase  39.07 
 
 
222 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0897  uracil-DNA glycosylase  39.35 
 
 
229 aa  150  1e-35  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1938  uracil-DNA glycosylase  36.7 
 
 
226 aa  150  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104572  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4548  uracil-DNA glycosylase  36.32 
 
 
225 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  36.7 
 
 
228 aa  149  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  35.48 
 
 
227 aa  149  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  35.94 
 
 
240 aa  149  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321985  hitchhiker  0.00000000131635 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  36.92 
 
 
223 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  36.7 
 
 
228 aa  148  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3314  uracil-DNA glycosylase  35.81 
 
 
222 aa  148  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.518113  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2033  uracil-DNA glycosylase  39.73 
 
 
221 aa  148  7e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2757  uracil-DNA glycosylase  35.94 
 
 
229 aa  148  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00257883  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  37.8 
 
 
225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  37.8 
 
 
225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  37.8 
 
 
225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2841  uracil-DNA glycosylase  35.48 
 
 
229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.619436  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2863  uracil-DNA glycosylase  35.48 
 
 
229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal  0.345403 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2733  uracil-DNA glycosylase  35.65 
 
 
229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00800854  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2859  uracil-DNA glycosylase  35.48 
 
 
229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2975  uracil-DNA glycosylase  35.48 
 
 
229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3817  uracil-DNA glycosylase  35.65 
 
 
229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.01333  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  37.85 
 
 
224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2867  uracil-DNA glycosylase  35.65 
 
 
229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0155178  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2929  uracil-DNA glycosylase  38.81 
 
 
219 aa  145  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000416129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  38.28 
 
 
225 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1088  uracil-DNA glycosylase  35.19 
 
 
229 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0467841  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1097  uracil-DNA glycosylase  35.19 
 
 
229 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00580941  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  38.14 
 
 
231 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2956  uracil-DNA glycosylase  35.19 
 
 
229 aa  144  8.000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0497126  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2737  uracil-DNA glycosylase  35.19 
 
 
229 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000100069  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  35.19 
 
 
229 aa  144  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0237  uracil-DNA glycosylase  36.92 
 
 
222 aa  144  9e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  35.19 
 
 
229 aa  144  9e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  38.28 
 
 
225 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0126  uracil-DNA glycosylase  40.28 
 
 
229 aa  144  1e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.560482  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0198  uracil-DNA glycosylase  37.38 
 
 
221 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  0.174961 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  37.44 
 
 
221 aa  144  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  37.8 
 
 
225 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  36.62 
 
 
225 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  38.14 
 
 
231 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  35.51 
 
 
232 aa  143  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  38.57 
 
 
225 aa  143  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3670  uracil-DNA glycosylase  34.42 
 
 
237 aa  143  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.769625  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  36.57 
 
 
231 aa  143  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5430  uracil-DNA glycosylase  37.32 
 
 
225 aa  142  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  35.05 
 
 
233 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0474  uracil-DNA glycosylase  41.75 
 
 
218 aa  142  4e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3740  uracil-DNA glycosylase  41.62 
 
 
216 aa  142  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000022896  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  35.19 
 
 
223 aa  141  6e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  33.49 
 
 
253 aa  141  7e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1283  uracil-DNA glycosylase  37.04 
 
 
216 aa  141  7e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0138995  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2152  uracil-DNA glycosylase  33.49 
 
 
253 aa  141  7e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.957234  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1173  uracil-DNA glycosylase  36.41 
 
 
228 aa  141  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0255291  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3595  uracil-DNA glycosylase  36.41 
 
 
228 aa  141  8e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1121  uracil-DNA glycosylase  36.41 
 
 
228 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0977602  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  34.58 
 
 
235 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  35.98 
 
 
229 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0362  uracil-DNA glycosylase  39.53 
 
 
232 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0490386  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0054  uracil-DNA glycosylase  39.53 
 
 
223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  34.88 
 
 
230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  35.51 
 
 
230 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0922  uracil-DNA glycosylase  36.45 
 
 
226 aa  139  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000179843  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  34.42 
 
 
233 aa  139  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  36.04 
 
 
229 aa  139  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0224  uracil-DNA glycosylase  39.89 
 
 
211 aa  139  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4288  uracil-DNA glycosylase  34.88 
 
 
225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0081  uracil-DNA glycosylase  38.79 
 
 
231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.110525  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  35.62 
 
 
225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  34.42 
 
 
230 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0977  uracil-DNA glycosylase  35.29 
 
 
221 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00168707  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  34.42 
 
 
230 aa  138  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  37.32 
 
 
225 aa  138  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  37.32 
 
 
225 aa  138  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1067  uracil-DNA glycosylase  35.02 
 
 
221 aa  138  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000655251  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  35.62 
 
 
225 aa  138  7.999999999999999e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0121  uracil-DNA glycosylase  38.79 
 
 
231 aa  138  7.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0965  uracil-DNA glycosylase  35.02 
 
 
221 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0201981  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1034  uracil-DNA glycosylase  35.02 
 
 
221 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000379797  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3325  uracil-DNA glycosylase  35.02 
 
 
221 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00364236  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  34.58 
 
 
230 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>