More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02465 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  100 
 
 		 309 aa  631  1e-180  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  32.05 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  30.29 
 
 		 337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2354  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 		 297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.358669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  34.06 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  34.03 
 
 		 528 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  30.63 
 
 		 301 aa  112  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 		 325 aa  97.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4143  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 		 291 aa  97.4  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89997 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 		 322 aa  96.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  30.39 
 
 		 312 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 		 344 aa  93.6  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 		 344 aa  93.6  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  31.03 
 
 		 792 aa  93.6  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 		 315 aa  92.8  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  29.15 
 
 		 2401 aa  90.5  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 		 311 aa  89.4  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5246  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 		 348 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0170348 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3347  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2989  family 2 glycosyl transferase  29.24 
 
 		 322 aa  87.4  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 		 753 aa  85.9  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07881  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 		 310 aa  85.9  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  30.21 
 
 		 324 aa  85.9  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 		 924 aa  85.9  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  27.3 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  27.05 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3182  glycosyl transferase family 2  26.55 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 		 477 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  28.43 
 
 		 311 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  26.89 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  25.82 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 		 988 aa  81.6  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  27.41 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0760  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  30.05 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1813  glycosyl transferase family protein  27.93 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  25.95 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  31.11 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  25.95 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  28.83 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.35 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.95 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.95 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 		 1035 aa  79.3  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 337 aa  79.3  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08131  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  27.36 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 		 322 aa  79  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2971  glycosyl transferase family 2  25.5 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  28.57 
 
 		 700 aa  79  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 		 346 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0883  glycosyl transferase family protein  38.83 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 		 597 aa  77  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  30.81 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08121  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 		 470 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4024  glycosyl transferase family protein  24.41 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  24.44 
 
 		 549 aa  76.3  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  24.72 
 
 		 1115 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1376  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.73 
 
 		 369 aa  75.9  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 		 1509 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 		 1739 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  39.81 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  26.09 
 
 		 422 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  24.72 
 
 		 927 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  24.72 
 
 		 1115 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  24.72 
 
 		 1119 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1987  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.5 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1298  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.5 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.472979  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  28.31 
 
 		 403 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1386  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.5 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.343804  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3039  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.5 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  23.99 
 
 		 872 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1850  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 362 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  29.24 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2274  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.5 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102891  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2680  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3168  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.5 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1010  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.5 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.374388  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6038  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 		 457 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 		 470 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0628268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>