53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2104 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2104  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  384  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.707478  decreased coverage  0.00974706 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1072  protein of unknown function DUF1185  92.71 
 
 		 192 aa  357  6e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4213  hypothetical protein  62.3 
 
 		 194 aa  238  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.199933 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3662  hypothetical protein  61.38 
 
 		 194 aa  233  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353198  normal  0.0552159 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4066  hypothetical protein  56.81 
 
 		 213 aa  230  9e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00119297  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0855  hypothetical protein  52.47 
 
 		 223 aa  222  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1665  hypothetical protein  58.12 
 
 		 194 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0180  protein of unknown function DUF1185  53.52 
 
 		 213 aa  214  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4325  protein of unknown function DUF1185  56.12 
 
 		 196 aa  209  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.532972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0656  hypothetical protein  56.12 
 
 		 196 aa  209  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5715  protein of unknown function DUF1185  48.96 
 
 		 192 aa  186  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2129  hypothetical protein  50 
 
 		 193 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.613913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1664  hypothetical protein  48.69 
 
 		 194 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1430  hypothetical protein  43.75 
 
 		 193 aa  167  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0657  hypothetical protein  45.31 
 
 		 194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4326  protein of unknown function DUF1185  45.31 
 
 		 194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2427  hypothetical protein  45.79 
 
 		 194 aa  158  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2145  protein of unknown function DUF1185  43.75 
 
 		 194 aa  156  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0856  hypothetical protein  46.84 
 
 		 194 aa  156  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0181  protein of unknown function DUF1185  41.88 
 
 		 194 aa  154  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885926  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4214  hypothetical protein  45.55 
 
 		 194 aa  150  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4065  hypothetical protein  44.74 
 
 		 194 aa  149  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00340638  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6489  hypothetical protein  39.9 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6724  hypothetical protein  39.9 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.855191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0082  protein of unknown function DUF1185  42.46 
 
 		 221 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2527  protein of unknown function DUF1185  35.2 
 
 		 182 aa  115  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4153  hypothetical protein  41.01 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.428897 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1060  protein of unknown function DUF1185  39.78 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3814  hypothetical protein  37.85 
 
 		 181 aa  111  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2086  hypothetical protein  38.46 
 
 		 198 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234769  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2264  hypothetical protein  38.46 
 
 		 198 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.966939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2259  hypothetical protein  38.46 
 
 		 198 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.128222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0369  hypothetical protein  37.36 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.555873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2480  hypothetical protein  38.33 
 
 		 199 aa  105  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2409  hypothetical protein  37.84 
 
 		 196 aa  104  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.408733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3437  hypothetical protein  36.81 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503031  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2675  hypothetical protein  37.36 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0368454  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1966  hypothetical protein  37.57 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0987839  normal  0.289885 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4326  hypothetical protein  38.12 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.0725647 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2217  peptide synthase  36.46 
 
 		 195 aa  99.8  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0532152  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3231  hypothetical protein  36.26 
 
 		 196 aa  99  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0083  protein of unknown function DUF1185  36.07 
 
 		 183 aa  95.9  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6119  hypothetical protein  35.68 
 
 		 200 aa  95.9  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.205354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2521  hypothetical protein  36.87 
 
 		 196 aa  95.9  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0152  protein of unknown function DUF1185  45.9 
 
 		 181 aa  94.4  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2287  hypothetical protein  36.96 
 
 		 196 aa  94.4  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0119695 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6550  protein of unknown function DUF1185  35.56 
 
 		 200 aa  92.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0260848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5583  protein of unknown function DUF1185  35 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.565377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0437  hypothetical protein  35.96 
 
 		 181 aa  89.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.480916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4259  hypothetical protein  35.59 
 
 		 181 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090692  hitchhiker  0.000156871 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5502  protein of unknown function DUF1185  37.08 
 
 		 200 aa  88.6  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106646 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6255  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  88.6  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6083  hypothetical protein  35.91 
 
 		 200 aa  86.3  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>