More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1338 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1338  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
250 aa  486  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  89.2 
 
 
250 aa  443  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.299602  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8048  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.44 
 
 
247 aa  257  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540913  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  41.55 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6846  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.84 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763233  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.2 
 
 
260 aa  125  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.8 
 
 
255 aa  122  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.44 
 
 
264 aa  120  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.05 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.36 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  35.93 
 
 
255 aa  118  7e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  34.21 
 
 
257 aa  118  9e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  34.21 
 
 
257 aa  118  9e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  34.65 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.02 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.02 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  34.3 
 
 
257 aa  116  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 
258 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.33 
 
 
268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.04 
 
 
257 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.01 
 
 
261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.17 
 
 
258 aa  115  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.61 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.61 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6847  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.19 
 
 
268 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480531  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17850  enoyl-CoA hydratase  40.1 
 
 
265 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.79 
 
 
261 aa  112  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.57 
 
 
260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.61 
 
 
257 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.46 
 
 
266 aa  112  6e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  34.93 
 
 
257 aa  112  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  34.93 
 
 
257 aa  112  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  28.32 
 
 
259 aa  112  8.000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.09 
 
 
257 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3042  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.71 
 
 
259 aa  111  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  32.85 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.18 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  34.21 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.77 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1551  enoyl-CoA hydratase  38.79 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  39.23 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.45 
 
 
661 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  32.92 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.04 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09128  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G01210)  36 
 
 
271 aa  110  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  31.3 
 
 
258 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.3 
 
 
259 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.76 
 
 
262 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1430  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.62 
 
 
255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3949  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 
265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.10876  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  32.33 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  34.83 
 
 
260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.46 
 
 
260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.49 
 
 
260 aa  109  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  34.21 
 
 
260 aa  109  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.73 
 
 
258 aa  108  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1773  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.82 
 
 
256 aa  108  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  33.77 
 
 
257 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  34.11 
 
 
259 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
258 aa  108  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05916  enoyl-CoA hydratase (Eurofung)  35.61 
 
 
289 aa  108  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295699  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  36.62 
 
 
261 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.48 
 
 
255 aa  108  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  33.19 
 
 
258 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  35.68 
 
 
263 aa  108  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  34.31 
 
 
283 aa  107  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  33.77 
 
 
257 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  36.41 
 
 
260 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.33 
 
 
258 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.5 
 
 
258 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.46 
 
 
259 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
258 aa  107  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00100177  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2625  enoyl-CoA hydratase-isomerase  39.2 
 
 
257 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0860819 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  34.29 
 
 
260 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2090  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.42 
 
 
253 aa  106  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0323462  normal  0.4563 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2264  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 
264 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26690  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 
264 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54358  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4688  enoyl-CoA hydratase  36.15 
 
 
261 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.484689  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.01 
 
 
258 aa  106  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
258 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
259 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3677  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.18 
 
 
251 aa  105  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2749  enoyl-CoA hydratase  31.3 
 
 
258 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000689883  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  33.63 
 
 
259 aa  105  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.05 
 
 
662 aa  105  7e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
257 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  37.8 
 
 
264 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.37 
 
 
259 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
258 aa  105  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.64 
 
 
258 aa  105  8e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  37 
 
 
261 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  33.62 
 
 
261 aa  105  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.27 
 
 
257 aa  105  9e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  38.03 
 
 
264 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1417  enoyl-CoA hydratase  33.49 
 
 
258 aa  104  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.55 
 
 
259 aa  104  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.64 
 
 
256 aa  104  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.8 
 
 
261 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.18 
 
 
662 aa  104  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>