93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0596 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0596  RNA-binding S4 domain-containing protein  100 
 
 		 261 aa  538  9.999999999999999e-153  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000430784  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1489  cell division protein  40.62 
 
 		 265 aa  221  9.999999999999999e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1037  RNA-binding S4 domain protein  37.8 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000298489  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2546  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.28 
 
 		 257 aa  202  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0803565  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1907  RNA-binding S4 domain protein  37.55 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1250  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.43 
 
 		 268 aa  187  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000129333  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1275  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.43 
 
 		 268 aa  187  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000253973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3911  S4 domain protein  38.13 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000445845 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3942  S4 domain-containing protein  38.13 
 
 		 255 aa  185  6e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131052  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3656  S4 domain-containing protein  37.11 
 
 		 255 aa  185  8e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4036  s4 domain-containing protein  37.74 
 
 		 255 aa  185  8e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00128697  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3748  S4 domain-containing protein  37.74 
 
 		 255 aa  185  8e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.125171  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3949  S4 domain protein  38.13 
 
 		 255 aa  184  9e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000108737  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3724  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.13 
 
 		 255 aa  184  9e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0195579  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3639  S4 domain-containing protein  37.74 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000680133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1243  S4 domain protein  37.35 
 
 		 255 aa  183  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000893019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2058  cell division protein  34.62 
 
 		 263 aa  175  8e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3998  S4 domain protein  36.48 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000894164  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0483  ylmH protein  35.02 
 
 		 262 aa  162  6e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0781  cell division protein  32.68 
 
 		 266 aa  155  6e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0824201  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1198  cell division protein  36.19 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0756  ylmH protein  37.21 
 
 		 220 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.031626  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0715  RNA-binding S4 domain-containing protein  31.02 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.369549  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1140  cell division protein  30.68 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1889  RNA-binding S4 domain-containing protein  33.05 
 
 		 248 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000373186  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1086  RNA-binding S4 domain protein  30.86 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000637661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1318  RNA-binding S4 domain protein  30.18 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.210837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5081  photosystem II S4 domain-containing protein  34.02 
 
 		 259 aa  126  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.673535  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09250  RNA-binding S4 domain protein  29.51 
 
 		 262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0028436  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1012  RNA-binding S4  33.2 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865709 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1503  RNA-binding S4  33.2 
 
 		 259 aa  122  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4198  RNA-binding S4  33.33 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1347  RNA-binding S4 domain protein  32.37 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000348222  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0599  RNA-binding S4 domain protein  32.13 
 
 		 260 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000013354  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4774  photosystem II S4 domain protein  31.73 
 
 		 259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.789019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2321  photosystem II S4 domain protein  31.54 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0789  RNA-binding S4  32.74 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446217  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1296  hypothetical protein  31.35 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3250  photosystem II S4 domain protein  30.8 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2846  photosystem II S4 domain protein  30.8 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41009  predicted protein  27.08 
 
 		 303 aa  98.2  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.106009  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4044  RNA-binding S4 domain protein  29.11 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223229  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0920  RNA-binding S4 domain protein  28.44 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000818747  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2360  RNA-binding S4 domain-containing protein  28.03 
 
 		 263 aa  89.4  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000894269  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1264  RNA-binding S4 domain protein  26.44 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1087  RNA-binding S4 domain protein  27.85 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1820  S4 domain-containing protein  24.5 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000243371  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2152  RNA-binding S4  25.4 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.224826  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15421  S4-like domain-containing protein  26.18 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0340616  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2106  S4 domain-containing protein  24 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00816123  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15571  S4-like domain-containing protein  25.65 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1454  RNA-binding S4  25.65 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17841  S4-like domain-containing protein  24.21 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.348814  normal  0.852292 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0928  RNA-binding S4  24.79 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.618898  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0525  RNA-binding S4  24.68 
 
 		 261 aa  62  0.000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14111  hypothetical protein  23.67 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.531857  normal  0.068656 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15171  S4-like domain-containing protein  23.56 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05221  S4-like domain-containing protein  23.23 
 
 		 295 aa  52  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  45.1 
 
 		 202 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0953  RNA-binding S4 domain protein  25.68 
 
 		 259 aa  49.7  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4480  ribosomal protein S4  38.71 
 
 		 208 aa  49.7  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131718  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1254  SSU ribosomal protein S4P  42.59 
 
 		 209 aa  48.5  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119667  normal  0.172003 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1111  30S ribosomal protein S4  44.44 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000499385  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4287  30S ribosomal protein S4  34.29 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360056 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3896  30S ribosomal protein S4  34.29 
 
 		 208 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1117  30S ribosomal protein S4  42.59 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2020  RNA-binding S4  24.9 
 
 		 262 aa  46.6  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  36.23 
 
 		 206 aa  45.4  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  42.59 
 
 		 206 aa  45.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0333  30S ribosomal protein S4  42.59 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0897396  decreased coverage  0.000428085 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0877  RNA-binding S4 domain protein  24.79 
 
 		 231 aa  45.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2261  ribosomal protein S4  44.9 
 
 		 201 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000352752  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  35.21 
 
 		 203 aa  45.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  35.21 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0237  30S ribosomal protein S4  40 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0862147  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0252  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.43 
 
 		 208 aa  44.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000365501  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0592  30S ribosomal protein S4  42.59 
 
 		 208 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1171  30S ribosomal protein S4  44 
 
 		 201 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4291  ribosomal protein S4  44 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1216  30S ribosomal protein S4  38.1 
 
 		 208 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0261994 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0353  ribosomal protein S4  33.33 
 
 		 208 aa  43.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.152733  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0523  ribosomal protein S4  33.33 
 
 		 208 aa  43.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645379  unclonable  0.0000000000198285 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0318  ribosomal protein S4  37.04 
 
 		 206 aa  43.1  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.665336  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  40.74 
 
 		 208 aa  42.7  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6023  30S ribosomal protein S4  38.78 
 
 		 209 aa  42.7  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0705  30S ribosomal protein S4  42.59 
 
 		 208 aa  42.7  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000946412  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0609  30S ribosomal protein S4  40.82 
 
 		 209 aa  42.7  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.19344  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  42 
 
 		 201 aa  42.4  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0980  30S ribosomal protein S4  36.11 
 
 		 209 aa  42.4  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.40186  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  42 
 
 		 202 aa  42  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1861  ribosomal protein S4  40 
 
 		 208 aa  42.4  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl586  30S ribosomal protein S4  40 
 
 		 208 aa  42  0.009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000352215  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20600  30S ribosomal protein S4  32.86 
 
 		 202 aa  42  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.725693  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>