62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1086 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1086  RNA-binding S4 domain protein  100 
 
 
267 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000637661  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0715  RNA-binding S4 domain-containing protein  51.19 
 
 
255 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.369549  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1318  RNA-binding S4 domain protein  40.75 
 
 
265 aa  206  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.210837  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09250  RNA-binding S4 domain protein  38.93 
 
 
262 aa  198  7.999999999999999e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0028436  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0789  RNA-binding S4  37.88 
 
 
263 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446217  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3250  photosystem II S4 domain protein  39.69 
 
 
259 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2846  photosystem II S4 domain protein  39.69 
 
 
259 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4774  photosystem II S4 domain protein  37.45 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.789019 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1889  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.35 
 
 
248 aa  162  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000373186  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1012  RNA-binding S4  37.26 
 
 
259 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865709 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0599  RNA-binding S4 domain protein  33.46 
 
 
260 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000013354  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4198  RNA-binding S4  35.36 
 
 
259 aa  149  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113928  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5081  photosystem II S4 domain-containing protein  35.82 
 
 
259 aa  149  6e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.673535  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2321  photosystem II S4 domain protein  35.8 
 
 
259 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41009  predicted protein  29.96 
 
 
303 aa  145  6e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.106009  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1503  RNA-binding S4  34.54 
 
 
259 aa  142  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2546  RNA-binding S4 domain-containing protein  32.23 
 
 
257 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0803565  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1037  RNA-binding S4 domain protein  33.61 
 
 
257 aa  135  9e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000298489  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1243  S4 domain protein  31.95 
 
 
255 aa  132  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000893019  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3656  S4 domain-containing protein  31.12 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3724  RNA-binding S4 domain-containing protein  31.8 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0195579  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3942  S4 domain-containing protein  30.71 
 
 
255 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131052  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3998  S4 domain protein  33.18 
 
 
241 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000894164  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3639  S4 domain-containing protein  31.12 
 
 
255 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000680133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3748  S4 domain-containing protein  31.54 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.125171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4036  s4 domain-containing protein  31.54 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00128697  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3949  S4 domain protein  30.71 
 
 
255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000108737  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3911  S4 domain protein  30.71 
 
 
255 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000445845 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0596  RNA-binding S4 domain-containing protein  30.86 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000430784  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1907  RNA-binding S4 domain protein  29.34 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2360  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.86 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000894269  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4044  RNA-binding S4 domain protein  32.81 
 
 
265 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223229  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0483  ylmH protein  27.92 
 
 
262 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1347  RNA-binding S4 domain protein  33.46 
 
 
260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000348222  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0756  ylmH protein  33.5 
 
 
220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.031626  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1275  RNA-binding S4 domain-containing protein  30.61 
 
 
268 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000253973  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1250  RNA-binding S4 domain-containing protein  30.61 
 
 
268 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000129333  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1087  RNA-binding S4 domain protein  36.04 
 
 
255 aa  108  9.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0781  cell division protein  27.45 
 
 
266 aa  106  4e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0824201  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2106  S4 domain-containing protein  30.84 
 
 
253 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00816123  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1820  S4 domain-containing protein  30.4 
 
 
253 aa  99.4  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000243371  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1198  cell division protein  31.8 
 
 
265 aa  94.4  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0920  RNA-binding S4 domain protein  31.14 
 
 
255 aa  93.6  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000818747  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1489  cell division protein  26.23 
 
 
265 aa  91.7  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1264  RNA-binding S4 domain protein  28.43 
 
 
245 aa  89  7e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1140  cell division protein  22.59 
 
 
256 aa  89  8e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14111  hypothetical protein  37.81 
 
 
262 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.531857  normal  0.068656 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2058  cell division protein  26.14 
 
 
263 aa  86.7  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2152  RNA-binding S4  27.65 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.224826  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1296  hypothetical protein  29.48 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17841  S4-like domain-containing protein  28.43 
 
 
262 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.348814  normal  0.852292 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0928  RNA-binding S4  28.92 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.618898  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0525  RNA-binding S4  28.46 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05221  S4-like domain-containing protein  26.92 
 
 
295 aa  65.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2020  RNA-binding S4  27.45 
 
 
262 aa  64.7  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2761  RNA-binding S4 domain-containing protein  28.57 
 
 
227 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1454  RNA-binding S4  25.2 
 
 
263 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0877  RNA-binding S4 domain protein  28 
 
 
231 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15571  S4-like domain-containing protein  25.94 
 
 
263 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15421  S4-like domain-containing protein  25.47 
 
 
263 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0340616  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15171  S4-like domain-containing protein  25 
 
 
263 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0953  RNA-binding S4 domain protein  23.24 
 
 
259 aa  49.7  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>