More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0314 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0314  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 		 121 aa  222  1e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000853139  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1416  50S ribosomal protein L12P  80.99 
 
 		 121 aa  149  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000264913  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0272  50S ribosomal protein L7/L12  73.55 
 
 		 121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.079724  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0362  50S ribosomal protein L7/L12  71.07 
 
 		 120 aa  125  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00344046  hitchhiker  0.0000691271 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1301  50S ribosomal protein L7/L12  68.6 
 
 		 121 aa  122  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0017753  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1386  50S ribosomal protein L7/L12  65.29 
 
 		 121 aa  122  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000070815  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0568  50S ribosomal protein L7/L12  65.57 
 
 		 122 aa  113  6.9999999999999995e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.166247  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0563  50S ribosomal protein L7/L12  65 
 
 		 122 aa  107  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000998366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0577  50S ribosomal protein L7/L12  65 
 
 		 122 aa  107  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000019471  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0181  50S ribosomal protein L7/L12  62.5 
 
 		 122 aa  107  7.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.563708  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0094  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 		 119 aa  100  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0095  50S ribosomal protein L7/L12  57.98 
 
 		 119 aa  98.2  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000523808  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  48.41 
 
 		 126 aa  97.8  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  48.41 
 
 		 126 aa  97.8  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3690  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 		 120 aa  97.4  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100711  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4532  50S ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 		 126 aa  97.4  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0509  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 		 125 aa  97.1  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0041  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 		 125 aa  96.7  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0709556  hitchhiker  0.00000000000056539 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  52.8 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3593  50S ribosomal protein L7/L12  55.28 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100169  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4443  50S ribosomal protein L7/L12  59.2 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2723  50S ribosomal protein L7/L12  57.85 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2409  50S ribosomal protein L7/L12  57.85 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267042  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  46.28 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3641  50S ribosomal protein L7/L12  56 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.180921 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4017  ribosomal protein L7/L12  49.59 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.712821  normal  0.474419 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 		 124 aa  94.4  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2263  50S ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 		 124 aa  93.6  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  56.2 
 
 		 122 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl601  50S ribosomal protein L7/L12  54.1 
 
 		 122 aa  92.4  2e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3868  50S ribosomal protein L7/L12  52.42 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3247  50S ribosomal protein L7/L12  51.59 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  46.72 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  55.93 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  47.97 
 
 		 125 aa  91.7  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3179  50S ribosomal protein L7/L12  57.26 
 
 		 124 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000124958  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2642  50S ribosomal protein L7/L12  57.26 
 
 		 124 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3787  50S ribosomal protein L7/L12  57.26 
 
 		 124 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229849  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3755  50S ribosomal protein L7/L12  57.26 
 
 		 124 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.062938  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3468  50S ribosomal protein L7/L12  57.26 
 
 		 124 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108927  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3817  50S ribosomal protein L7/L12  57.26 
 
 		 124 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  54.92 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  48.78 
 
 		 128 aa  91.7  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1913  50S ribosomal protein L7/L12  57.26 
 
 		 124 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000803393  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2950  ribosomal protein L7/L12  52.85 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.223203  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1888  50S ribosomal protein L7/L12  52.03 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000229099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  52.8 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  48.39 
 
 		 121 aa  91.3  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3898  50S ribosomal protein L7/L12  50.79 
 
 		 126 aa  90.9  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  55.28 
 
 		 128 aa  90.5  7e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2178  50S ribosomal protein L7/L12  52.03 
 
 		 123 aa  90.5  7e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.900268  normal  0.0233119 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  49.21 
 
 		 126 aa  90.5  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0045  50S ribosomal protein L7/L12  54.84 
 
 		 124 aa  90.1  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000441674  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0587  50S ribosomal protein L7/L12  56.8 
 
 		 125 aa  90.1  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  52.71 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  45.6 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2332  50S ribosomal protein L7/L12  48 
 
 		 125 aa  89.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.140458  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  45.6 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2723  50S ribosomal protein L12P  52.07 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000110024  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0480  ribosomal protein L7/L12  50 
 
 		 121 aa  89.4  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2107  50S ribosomal protein L7/L12  50.41 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000324258  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  47.15 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  45.97 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2197  50S ribosomal protein L7/L12  51.22 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000379347  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  51.22 
 
 		 125 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0011  50S ribosomal protein L7/L12  54.78 
 
 		 121 aa  88.2  3e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.492576  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3452  50S ribosomal protein L7/L12  56 
 
 		 125 aa  88.2  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175537  normal  0.439399 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0311  50S ribosomal protein L7/L12  52.85 
 
 		 123 aa  87.8  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0425822  normal  0.0243223 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0068  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 		 122 aa  87.4  5e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  55.65 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1144  ribosomal protein L7/L12  54.24 
 
 		 127 aa  86.7  9e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000177036  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1065  50S ribosomal protein L7/L12  51.2 
 
 		 125 aa  86.3  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00323205  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06160  50S ribosomal protein L7/L12  49.18 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  55.56 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3190  50S ribosomal protein L7/L12  54.84 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.603289  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0267  50S ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.597405 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0233  ribosomal protein L7/L12  52.8 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.643135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0214  ribosomal protein L7/L12  50 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0258  50S ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0109491  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3886  ribosomal protein L7/L12  51.24 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.449029  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  52.8 
 
 		 125 aa  85.1  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  50.4 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2343  ribosomal protein L7/L12  50.42 
 
 		 125 aa  85.1  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00477548  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  52.03 
 
 		 123 aa  85.1  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  46.4 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5087  50S ribosomal protein L7/L12  44.63 
 
 		 121 aa  84  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167617  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0240  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 		 124 aa  84  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0216202 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  47.2 
 
 		 124 aa  84  6e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0923  50S ribosomal protein L7/L12  53.17 
 
 		 126 aa  84  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000276114  hitchhiker  0.0000101769 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  38.84 
 
 		 121 aa  84  7e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0866  50S ribosomal protein L7/L12  48.44 
 
 		 128 aa  84  7e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2037  50S ribosomal protein L7/L12  49.6 
 
 		 125 aa  84  7e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0646478  normal  0.703058 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  46.83 
 
 		 125 aa  83.6  8e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  48 
 
 		 125 aa  83.6  9e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  42.64 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3077  50S ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0479  50S ribosomal protein L7/L12  44.63 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00592833  hitchhiker  0.00479203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>