More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3974 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3024  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  76.92 
 
 
437 aa  663    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243461  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2904  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  78.03 
 
 
434 aa  676    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.507246  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1369  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  76.42 
 
 
436 aa  656    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.119941  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1133  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  78.22 
 
 
442 aa  683    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0808727  normal  0.150983 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4629  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  75.17 
 
 
431 aa  647    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3974  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  100 
 
 
437 aa  884    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403447 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3193  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  83.81 
 
 
436 aa  721    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.108936  normal  0.174369 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0898  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  77.52 
 
 
437 aa  678    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3357  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  77.26 
 
 
442 aa  681    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.249572  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3581  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  77.8 
 
 
434 aa  674    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.103702 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1569  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  71.1 
 
 
438 aa  623  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.44899 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3098  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  65.43 
 
 
427 aa  584  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0896  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  65.43 
 
 
427 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2625  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  64.68 
 
 
429 aa  569  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0666  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  63.27 
 
 
433 aa  566  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0558  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  63.72 
 
 
433 aa  568  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.245798  normal  0.655288 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0610  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  63.04 
 
 
433 aa  565  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0622  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  65.35 
 
 
426 aa  566  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0667  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  63.87 
 
 
430 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139196  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2557  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  63.66 
 
 
425 aa  559  1e-158  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4065  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  66.27 
 
 
427 aa  558  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.149414  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1543  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  67.92 
 
 
427 aa  559  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2436  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  66.75 
 
 
427 aa  560  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0831  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  66.03 
 
 
427 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0923  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  66.03 
 
 
427 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477129  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0482  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  66.03 
 
 
427 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0822  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  65.8 
 
 
427 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0961  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  66.03 
 
 
427 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3064  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  67.45 
 
 
427 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2142  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  67.45 
 
 
427 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2012  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  67.45 
 
 
514 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3099  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  67.45 
 
 
569 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2601  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  67.45 
 
 
427 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0768  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  67.45 
 
 
502 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3011  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  67.22 
 
 
480 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2664  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.68 
 
 
428 aa  543  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.940231  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3683  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.4 
 
 
427 aa  537  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.59 
 
 
434 aa  533  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.346757  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3902  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  62.47 
 
 
427 aa  531  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2629  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.51 
 
 
425 aa  534  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0261  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.27 
 
 
433 aa  531  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2421  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.56 
 
 
428 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.23384  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1570  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  55.68 
 
 
426 aa  509  1e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00197478  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1328  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  55.68 
 
 
427 aa  502  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0353724  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0827  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.08 
 
 
423 aa  503  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.215136  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12390  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.08 
 
 
427 aa  501  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1131  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.08 
 
 
427 aa  501  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0974  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.57 
 
 
429 aa  496  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1171  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.97 
 
 
428 aa  494  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.154612  hitchhiker  0.0000102166 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0171  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.69 
 
 
433 aa  495  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1229  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.52 
 
 
432 aa  496  1e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00808664  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00153  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.24 
 
 
426 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00257803  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0054  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  57.75 
 
 
426 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00152  hypothetical protein  57.24 
 
 
426 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00215275  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0158  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.24 
 
 
426 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1491  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.7 
 
 
428 aa  491  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0161  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.23 
 
 
433 aa  493  9.999999999999999e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000316043 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3505  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.24 
 
 
426 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0155655  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0164  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.24 
 
 
426 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0159  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.24 
 
 
426 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0166  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.24 
 
 
426 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0223  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.01 
 
 
426 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.01485  normal  0.360359 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0636  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.38 
 
 
427 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0564968  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0330  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.76 
 
 
442 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000011434 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.24 
 
 
426 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.280272  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1239  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  55.56 
 
 
426 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0686  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.63 
 
 
426 aa  491  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3448  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  57.01 
 
 
426 aa  491  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4784  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.92 
 
 
427 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0445996 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4629  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.27 
 
 
427 aa  490  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0221  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.01 
 
 
426 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00426685  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1492  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.7 
 
 
429 aa  490  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.78 
 
 
426 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00212628  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4838  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.92 
 
 
427 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0224  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.01 
 
 
426 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0146  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.78 
 
 
426 aa  490  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1088  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.86 
 
 
428 aa  491  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.80886  normal  0.019309 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00484  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.34 
 
 
438 aa  489  1e-137  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4660  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.15 
 
 
427 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333765  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0839  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.52 
 
 
427 aa  489  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1012  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.31 
 
 
428 aa  490  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000957306  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3774  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.21 
 
 
429 aa  490  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0848252 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02277  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.05 
 
 
441 aa  485  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3303  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.82 
 
 
430 aa  487  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1119  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.65 
 
 
430 aa  485  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4342  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.68 
 
 
427 aa  488  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4947  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.38 
 
 
427 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2901  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.82 
 
 
430 aa  487  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0920757  hitchhiker  0.00771881 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0495  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.76 
 
 
431 aa  486  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2980  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.05 
 
 
428 aa  485  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.823832  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0694  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.61 
 
 
426 aa  483  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1300  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.88 
 
 
430 aa  483  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0995  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.07 
 
 
426 aa  483  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03417  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.48 
 
 
445 aa  484  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3459  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.07 
 
 
426 aa  482  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3330  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.07 
 
 
426 aa  482  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2893  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.13 
 
 
430 aa  481  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000688047 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2975  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.12 
 
 
430 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3071  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.65 
 
 
430 aa  481  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.049853  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09260  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.92 
 
 
429 aa  483  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>