More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0167 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0167  glutamine amidotransferase class-II  100 
 
 
302 aa  622  1e-177  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5919  glutamine amidotransferase class-II  75.83 
 
 
302 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3033  glutamine amidotransferase, class-II  72.43 
 
 
302 aa  447  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0457  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  67.22 
 
 
298 aa  428  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.598323  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1699  glutamine amidotransferase class-II  61.33 
 
 
296 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2499  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  60.26 
 
 
305 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2583  glutamine amidotransferase, class-II protein  48.17 
 
 
306 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0230258  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2248  glutamine amidotransferase class-II  49.17 
 
 
301 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.280725 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2274  glutamine amidotransferase, class-II  47.51 
 
 
306 aa  299  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0107042 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3467  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  48.17 
 
 
299 aa  296  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.836717  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1346  glutamine amidotransferase, class-II  46.33 
 
 
299 aa  291  9e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4695  glutamine amidotransferase class-II  48.34 
 
 
299 aa  289  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.903048 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1942  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  48.68 
 
 
297 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1656  glutamine amidotransferase class-II  48.04 
 
 
311 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.670859  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1938  glutamine amidotransferase class-II  47.71 
 
 
311 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210707  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2632  glutamine amidotransferase class-II  49.17 
 
 
299 aa  280  3e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1575  glutamine amidotransferase class-II  46.38 
 
 
316 aa  279  5e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1870  putative glutamine amidotransferase  47.84 
 
 
308 aa  275  7e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117624  normal  0.828633 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3291  glutamine amidotransferase class-II  47.18 
 
 
301 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1138  glutamine amidotransferase, class-II  47.35 
 
 
298 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.16804 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5638  glutamine amidotransferase class-II  46.51 
 
 
301 aa  271  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.52916  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4810  glutamine amidotransferase class-II  47.02 
 
 
297 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  hitchhiker  0.00206329 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6008  glutamine amidotransferase class-II  46.18 
 
 
301 aa  269  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362161  decreased coverage  0.00354269 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5749  amidophosphoribosyltransferase  45.51 
 
 
301 aa  268  8.999999999999999e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6575  glutamine amidotransferase class-II  45.18 
 
 
302 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0505165 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3524  glutamine amidotransferase class-II  41.45 
 
 
302 aa  236  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0234475 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1299  glutamine amidotransferase, class-II  40.86 
 
 
302 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0375941  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4806  glutamine amidotransferase class-II  42.38 
 
 
298 aa  224  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5261  glutamine amidotransferase, class-II  39.87 
 
 
298 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.228434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4893  glutamine amidotransferase, class-II  39.87 
 
 
298 aa  222  6e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4982  glutamine amidotransferase, class-II  39.87 
 
 
298 aa  222  6e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5510  glutamine amidotransferase, class-II  39.54 
 
 
302 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623211  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00831  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  37.5 
 
 
610 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0468  amidophosphoribosyltransferase  27.66 
 
 
456 aa  79.3  0.00000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.350158  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2822  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  37.5 
 
 
610 aa  79  0.00000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4892  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  36.61 
 
 
609 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.664271  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1147  amidophosphoribosyltransferase  30.25 
 
 
478 aa  77.8  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218005  normal  0.314166 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0439  amidophosphoribosyltransferase  28.49 
 
 
459 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0396  amidophosphoribosyltransferase  27.96 
 
 
459 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1523  amidophosphoribosyltransferase  27.96 
 
 
459 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0119394  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4481  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  34.82 
 
 
609 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000322632 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0085  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  31.5 
 
 
611 aa  77  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.800313  normal  0.506708 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001643  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  34.82 
 
 
610 aa  76.6  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0244363  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4234  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  33.07 
 
 
609 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235934  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0309  amidophosphoribosyltransferase  28.88 
 
 
473 aa  75.5  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0008  amidophosphoribosyltransferase  31.65 
 
 
467 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  25.47 
 
 
488 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  33.04 
 
 
609 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  30.61 
 
 
494 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  30.61 
 
 
494 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  30.43 
 
 
469 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4305  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  33.04 
 
 
609 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.312496  hitchhiker  0.000000000243426 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01750  amidophosphoribosyltransferase  30.34 
 
 
482 aa  73.6  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.674101  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4125  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  33.04 
 
 
609 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.513895  normal  0.539293 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0428  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  31.33 
 
 
603 aa  73.2  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2426  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  39.8 
 
 
609 aa  73.2  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.184466  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4361  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  33.04 
 
 
609 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284496  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4502  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  33.04 
 
 
609 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.782513  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4360  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  33.04 
 
 
609 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  26.92 
 
 
474 aa  72.4  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0230  amidophosphoribosyltransferase  29.19 
 
 
463 aa  72.4  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0884272  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4602  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  31.39 
 
 
616 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3049  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  28.89 
 
 
604 aa  72.4  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.749851  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3061  amidophosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
629 aa  72  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  26.54 
 
 
471 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  32.28 
 
 
487 aa  72  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1038  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  31.93 
 
 
619 aa  72  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  27.33 
 
 
487 aa  72  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1357  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  29.88 
 
 
591 aa  71.2  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  31.72 
 
 
496 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  26.54 
 
 
471 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  26.54 
 
 
471 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  26.54 
 
 
471 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0980  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  28.24 
 
 
599 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1778  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  28.8 
 
 
602 aa  71.2  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.285931  normal  0.0291099 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1693  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  31.41 
 
 
600 aa  71.2  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.457589  normal  0.0574833 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  26.54 
 
 
471 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3302  D-fructose-6-phosphate amidotransferase  31.2 
 
 
608 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0039  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.92 
 
 
610 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  26.54 
 
 
471 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  26.54 
 
 
471 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1536  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.92 
 
 
610 aa  71.2  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3920  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  33.04 
 
 
609 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121785  normal  0.0336662 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3839  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  32.14 
 
 
609 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000251004 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  25.38 
 
 
659 aa  70.1  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0841  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  33.09 
 
 
608 aa  70.5  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.121546  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1419  amidophosphoribosyltransferase  28.14 
 
 
461 aa  70.1  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0127132  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2865  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  34.75 
 
 
610 aa  70.1  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0731  amidophosphoribosyltransferase  27.38 
 
 
478 aa  69.7  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1000  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  30.67 
 
 
602 aa  70.1  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3951  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  32.14 
 
 
609 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.101747  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  28.48 
 
 
465 aa  69.7  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0218  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  34.62 
 
 
603 aa  69.7  0.00000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0724  amidophosphoribosyltransferase  28.95 
 
 
500 aa  69.3  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00225283  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14994  glutamine-fructose-6-phosphate transaminase  35 
 
 
606 aa  69.3  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.703916  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  28 
 
 
553 aa  69.3  0.00000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3743  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  33.04 
 
 
609 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0507  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  36.45 
 
 
612 aa  69.3  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00435471 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0953  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.13 
 
 
599 aa  68.9  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.590452  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4012  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  32.14 
 
 
609 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0405163  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>