More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1435 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1435  transcriptional regulator  100 
 
 		 244 aa  499  1e-140  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.851115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 232 aa  118  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  31.22 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 236 aa  109  5e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4157  GntR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  28.57 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  30.3 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  34.2 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  27 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3593  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 239 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 255 aa  99.8  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 249 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  27 
 
 		 256 aa  99.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  27 
 
 		 256 aa  99.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 232 aa  99  6e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  27 
 
 		 256 aa  99  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  30.67 
 
 		 237 aa  99  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 258 aa  99  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 249 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 249 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 235 aa  97.4  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  30.25 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  28.44 
 
 		 233 aa  96.3  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 248 aa  95.9  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  30.47 
 
 		 247 aa  95.5  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  26.47 
 
 		 261 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  26.47 
 
 		 261 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0020  transcriptional regulator, GntR family  25.85 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5116  transcriptional regulator, GntR family  25.85 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3895  GntR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  31.72 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1647  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0019  GntR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0513  transcriptional regulator, GntR family  26.18 
 
 		 288 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204845 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4049  GntR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.855147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4235  transcriptional regulator, GntR family  25.85 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 286 aa  93.2  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4192  GntR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 238 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3827  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000115432  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3644  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000015219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3534  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000363382  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3805  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78065e-19 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3552  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000156327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3928  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000328023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3840  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0698  trehalose operon transcriptional repressor  27.27 
 
 		 236 aa  89  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  24.48 
 
 		 237 aa  88.6  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  25.62 
 
 		 235 aa  88.6  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2444  GntR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 241 aa  88.2  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1408  transcriptional regulator, GntR family  28.33 
 
 		 241 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000166649  hitchhiker  0.000517226 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3891  transcriptional regulator, GntR family  28.81 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0191  transcriptional regulator  25.94 
 
 		 241 aa  87.8  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.168496 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  29.34 
 
 		 238 aa  86.7  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0527  trehalose operon transcriptional repressor  28.39 
 
 		 235 aa  86.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  30.22 
 
 		 254 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1175  transcriptional regulator, GntR family  27.62 
 
 		 243 aa  86.3  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336656  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 248 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 		 254 aa  86.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0685  trehalose operon repressor  26.86 
 
 		 236 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.327487 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.04 
 
 		 255 aa  85.1  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0759  trehalose operon repressor  26.45 
 
 		 236 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2067  transcriptional regulator, GntR family  27.59 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  28.99 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0597  trehalose operon transcriptional repressor  26.86 
 
 		 236 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.464881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0630  trehalose operon transcriptional repressor  26.86 
 
 		 236 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0543  trehalose operon repressor  27.97 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  27.32 
 
 		 195 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  28.57 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3563  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0541  trehalose operon transcriptional repressor  26.86 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  28.57 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0541  trehalose operon transcriptional repressor  26.86 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  27.06 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0543  GntR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0422  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207613  normal  0.0264294 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  28.57 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  28.57 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  27.32 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2751  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.74 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  28.57 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  26.83 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2552  transcriptional regulator, GntR family  29.28 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>