71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1043 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1043  uridine phosphorylase  100 
 
 
233 aa  484  1e-136  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0551  phosphorylase, Pnp/Udp family  42.8 
 
 
269 aa  206  2e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000889574 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0955  phosphorylase, Pnp/Udp family  43.17 
 
 
254 aa  204  8e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0510178  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1115  purine or other phosphorylase family 1  42.67 
 
 
258 aa  194  7e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000837521  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0591  phosphorylase, Pnp/Udp family, putative  34.93 
 
 
256 aa  148  7e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000246027  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0281  purine phosphorylase family 1  32.44 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00127495  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2578  purine or other phosphorylase family 1  32.6 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0020  purine phosphorylase family 1  36.99 
 
 
248 aa  92  6e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4070  purine or other phosphorylase family 1  29.76 
 
 
265 aa  91.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1429  purine phosphorylases family protein 1  31.88 
 
 
264 aa  91.3  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000543791  normal  0.161681 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0414  hypothetical protein  29.66 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1714  purine phosphorylase family 1  35.51 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41980  phosphorylase  29.63 
 
 
244 aa  80.1  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2731  purine or other phosphorylase family 1  34.15 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.036458  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1269  purine phosphorylase family 1  36.51 
 
 
273 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4378  purine phosphorylases family protein 1  36.21 
 
 
268 aa  74.7  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.340466  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4539  purine phosphorylases family protein 1  36.21 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0773482  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4454  purine phosphorylase family 1  29.68 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.637484 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0965  purine phosphorylase family 1  27.81 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.470514  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3654  uridine phosphorylase  31.51 
 
 
243 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0963  purine or other phosphorylase family 1  30.07 
 
 
271 aa  68.6  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4297  uridine phosphorylase, putative  25.61 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0545  purine phosphorylase family 1  29.37 
 
 
244 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0544  purine or other phosphorylase family 1  26.83 
 
 
248 aa  63.9  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000334  N-Ribosylnicotinamide phosphorylase  26.62 
 
 
243 aa  63.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00958039  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3794  purine phosphorylases family protein 1  29.37 
 
 
244 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0550  purine or other phosphorylase family 1  29.37 
 
 
244 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06138  hypothetical protein  23.9 
 
 
243 aa  62.8  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0520  purine or other phosphorylase family 1  27.78 
 
 
236 aa  61.6  0.000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3914  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0754  uridine phosphorylase  27.27 
 
 
250 aa  61.2  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0818347  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1527  S-methyl-5-thioadenosine phosphorylase  33.33 
 
 
241 aa  60.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0004  uridine phosphorylase  22.73 
 
 
243 aa  58.9  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000523211  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3488  purine phosphorylase family protein 1  23.78 
 
 
241 aa  58.9  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0567  Purine-nucleoside phosphorylase  30.19 
 
 
242 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0814  purine phosphorylase family protein 1  25.61 
 
 
221 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0603  purine phosphorylase family 1  26.35 
 
 
222 aa  54.3  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1572  purine phosphorylases family protein 1  24.55 
 
 
222 aa  53.5  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2962  Purine-nucleoside phosphorylase  28.48 
 
 
242 aa  52  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266203  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2318  purine or other phosphorylase family 1  28.57 
 
 
241 aa  52  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0375  uridine phosphorylase  23.64 
 
 
261 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2504  uridine phosphorylase  25.32 
 
 
259 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0370  uridine phosphorylase  23.73 
 
 
261 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0295  purine nucleoside phosphorylase  27.33 
 
 
232 aa  50.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0910  purine or other phosphorylase family 1  28.67 
 
 
260 aa  48.9  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.303015  normal  0.357288 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0062  purine phosphorylases family protein 1  26.14 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0304  purine phosphorylase family 1  24.09 
 
 
262 aa  46.6  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0060  purine phosphorylases family protein 1  23.18 
 
 
239 aa  46.6  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1178  purine nucleoside phosphorylase  24.05 
 
 
236 aa  46.2  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1344  purine nucleoside phosphorylase  26.03 
 
 
235 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1588  purine nucleoside phosphorylase  26.03 
 
 
235 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0326912  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1555  purine nucleoside phosphorylase  26.03 
 
 
235 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000650002 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1518  purine nucleoside phosphorylase  26.03 
 
 
235 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3827  purine nucleoside phosphorylase  26.03 
 
 
235 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000284162 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1624  purine nucleoside phosphorylase  26.03 
 
 
235 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1386  purine nucleoside phosphorylase  26.03 
 
 
235 aa  45.4  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0392  uridine phosphorylase  29.47 
 
 
275 aa  45.4  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0403718  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1187  purine nucleoside phosphorylase  26.03 
 
 
235 aa  45.4  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.562168  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1372  purine nucleoside phosphorylase  26.03 
 
 
235 aa  45.4  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.896759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1345  purine nucleoside phosphorylase  26.03 
 
 
235 aa  45.4  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1483  purine nucleoside phosphorylase  26.03 
 
 
235 aa  45.4  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1578  purine phosphorylase family 1  21.74 
 
 
238 aa  45.4  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00464289 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1546  purine phosphorylase family 1  24.54 
 
 
238 aa  44.7  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0539686  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0126  purine phosphorylases family protein 1  25.49 
 
 
242 aa  44.7  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1081  purine or other phosphorylase family 1  21.79 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1675  purine or other phosphorylase family 1  25.78 
 
 
247 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2072  purine or other phosphorylase family 1  22.6 
 
 
240 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1978  purine nucleoside phosphorylase  24.84 
 
 
234 aa  43.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331725  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2738  purine or other phosphorylase family 1  21.71 
 
 
272 aa  42.7  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1072  purine nucleoside phosphorylase  23.9 
 
 
236 aa  42.4  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.79397  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0938  purine or other phosphorylase family 1  21.92 
 
 
275 aa  42.4  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.686275 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0092  purine nucleoside phosphorylase  25.4 
 
 
236 aa  42  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>