252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0814 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0814  purine phosphorylase family protein 1  100 
 
 
221 aa  440  1e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0603  purine phosphorylase family 1  76.26 
 
 
222 aa  335  5e-91  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1572  purine phosphorylases family protein 1  74.43 
 
 
222 aa  332  3e-90  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0610  purine phosphorylases family protein 1  72.81 
 
 
244 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.807102  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1578  purine phosphorylase family 1  47.06 
 
 
238 aa  168  7e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00464289 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0520  purine or other phosphorylase family 1  45.41 
 
 
236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3914  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1546  purine phosphorylase family 1  41.67 
 
 
238 aa  151  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0539686  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0060  purine phosphorylases family protein 1  43.9 
 
 
239 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0062  purine phosphorylases family protein 1  43.41 
 
 
237 aa  132  3e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0126  purine phosphorylases family protein 1  41.23 
 
 
242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2318  purine or other phosphorylase family 1  33.63 
 
 
241 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000334  N-Ribosylnicotinamide phosphorylase  34.48 
 
 
243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00958039  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0606  purine-nucleoside phosphorylase  40.18 
 
 
236 aa  109  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2962  Purine-nucleoside phosphorylase  33.67 
 
 
242 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266203  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06138  hypothetical protein  34.3 
 
 
243 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4122  uridine phosphorylase  36.32 
 
 
247 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4137  uridine phosphorylase  36.32 
 
 
247 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1527  S-methyl-5-thioadenosine phosphorylase  33.17 
 
 
241 aa  105  7e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0545  purine phosphorylase family 1  34.98 
 
 
244 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0567  Purine-nucleoside phosphorylase  32.66 
 
 
242 aa  103  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2072  purine or other phosphorylase family 1  36.4 
 
 
240 aa  102  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3654  uridine phosphorylase  34.98 
 
 
243 aa  101  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0962  purine or other phosphorylase family 1  30.77 
 
 
263 aa  100  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0754  uridine phosphorylase  32.37 
 
 
250 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0818347  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2504  uridine phosphorylase  32.2 
 
 
259 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3794  purine phosphorylases family protein 1  34.65 
 
 
244 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0550  purine or other phosphorylase family 1  34.65 
 
 
244 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0963  purine or other phosphorylase family 1  34.42 
 
 
271 aa  99.4  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0004  uridine phosphorylase  32.11 
 
 
243 aa  99  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000523211  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0304  purine phosphorylase family 1  34.34 
 
 
262 aa  97.8  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0295  purine nucleoside phosphorylase  33.92 
 
 
232 aa  97.8  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0544  purine or other phosphorylase family 1  30.97 
 
 
248 aa  96.3  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0370  uridine phosphorylase  32.59 
 
 
261 aa  95.9  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0375  uridine phosphorylase  33.04 
 
 
261 aa  95.5  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2947  purine nucleoside phosphorylase  33.48 
 
 
232 aa  95.5  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2072  uridine phosphorylase  34.42 
 
 
259 aa  95.5  6e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00214406  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1318  purine nucleoside phosphorylase  31.76 
 
 
233 aa  93.2  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000021408  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0752  purine nucleoside phosphorylase  31.58 
 
 
238 aa  92.8  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1863  purine nucleoside phosphorylase  34.63 
 
 
235 aa  92.4  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1596  purine phosphorylases family protein 1  33.17 
 
 
238 aa  91.7  7e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4352  uridine phosphorylase  33.02 
 
 
253 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5272  uridine phosphorylase  33.02 
 
 
253 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.25692  normal  0.111968 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4303  uridine phosphorylase  33.02 
 
 
253 aa  91.3  9e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4177  uridine phosphorylase  33.02 
 
 
253 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0246384 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03718  uridine phosphorylase  33.02 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4148  uridine phosphorylase  33.02 
 
 
253 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4055  uridine phosphorylase  33.02 
 
 
253 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4208  uridine phosphorylase  33.02 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000492697 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0900  uridine phosphorylase  32.34 
 
 
238 aa  91.3  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.768164  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0244  uridine phosphorylase  32.55 
 
 
253 aa  90.9  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.104641 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03667  hypothetical protein  33.02 
 
 
253 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0598  uridine phosphorylase  30.09 
 
 
275 aa  91.3  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1391  purine nucleoside phosphorylase  31.33 
 
 
235 aa  90.1  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000867516  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1793  purine nucleoside phosphorylase  32.61 
 
 
232 aa  89.7  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000806796  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf237  purine nucleoside phosphorylase  33.62 
 
 
238 aa  89.7  3e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000189156  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3962  uridine phosphorylase  32.55 
 
 
253 aa  89.4  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1652  purine nucleoside phosphorylase  30.9 
 
 
235 aa  89  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000543003  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2212  purine nucleoside phosphorylase  32.89 
 
 
236 aa  88.6  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2174  purine nucleoside phosphorylase  32.89 
 
 
236 aa  88.6  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3074  uridine phosphorylase  32.67 
 
 
252 aa  88.6  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0126681  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0510  purine nucleoside phosphorylase  35.36 
 
 
236 aa  88.6  7e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1187  purine nucleoside phosphorylase  31.3 
 
 
235 aa  88.2  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.562168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1344  purine nucleoside phosphorylase  31.3 
 
 
235 aa  88.2  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2420  purine nucleoside phosphorylase  34.63 
 
 
236 aa  88.2  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4199  uridine phosphorylase  32.55 
 
 
253 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1588  purine nucleoside phosphorylase  31.3 
 
 
235 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0326912  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3827  purine nucleoside phosphorylase  31.3 
 
 
235 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000284162 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1372  purine nucleoside phosphorylase  31.3 
 
 
235 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.896759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1345  purine nucleoside phosphorylase  31.3 
 
 
235 aa  87.8  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1483  purine nucleoside phosphorylase  31.3 
 
 
235 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0266  uridine phosphorylase  32.55 
 
 
253 aa  87.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4248  uridine phosphorylase  32.55 
 
 
253 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4355  uridine phosphorylase  32.55 
 
 
253 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597183  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4176  uridine phosphorylase  32.55 
 
 
253 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.82731  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1555  purine nucleoside phosphorylase  31.3 
 
 
235 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000650002 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1624  purine nucleoside phosphorylase  31.3 
 
 
235 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3646  uridine phosphorylase  32.55 
 
 
253 aa  87.4  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1386  purine nucleoside phosphorylase  31.3 
 
 
235 aa  87.8  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3950  uridine phosphorylase  32.55 
 
 
253 aa  87.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4295  uridine phosphorylase  32.55 
 
 
253 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0463  purine nucleoside phosphorylase  34.63 
 
 
233 aa  87  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0259121  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1747  purine nucleoside phosphorylase  31.58 
 
 
236 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3381  purine nucleoside phosphorylase  29.69 
 
 
235 aa  87  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.336963  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3932  uridine phosphorylase  32.55 
 
 
253 aa  87  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1518  purine nucleoside phosphorylase  30.87 
 
 
235 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4297  uridine phosphorylase, putative  30.54 
 
 
241 aa  85.9  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3403  uridine phosphorylase  31.19 
 
 
252 aa  86.3  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1240  uridine phosphorylase  32.89 
 
 
290 aa  86.3  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.719216  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4352  uridine phosphorylase  31.6 
 
 
256 aa  85.9  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3063  purine or other phosphorylase family 1  31.43 
 
 
255 aa  85.1  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.592926  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4067  uridine phosphorylase  31.6 
 
 
256 aa  85.1  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1831  uridine phosphorylase  27.36 
 
 
252 aa  84.7  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0461  uridine phosphorylase  30.2 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.137715  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3449  purine nucleoside phosphorylase  31.58 
 
 
241 aa  83.6  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0828  purine-nucleoside phosphorylase  32.71 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3330  purine nucleoside phosphorylase  31.14 
 
 
241 aa  83.6  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0817178  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0460  uridine phosphorylase  30.2 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3488  purine phosphorylase family protein 1  29.06 
 
 
241 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3375  purine nucleoside phosphorylase  33.77 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.284651 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004006  uridine phosphorylase  28.77 
 
 
252 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>