48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2208 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2208  permease, cadmium resistance protein  100 
 
 		 203 aa  388  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2221  cadmium resistance family protein  44.61 
 
 		 205 aa  183  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.242988  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2796  cadmium resistance transporter CadD  43.63 
 
 		 205 aa  179  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2753  cadmium resistance transporter CadD  43.63 
 
 		 205 aa  179  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0956067  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1370  cadmium resistance family protein  42.5 
 
 		 205 aa  170  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.128389  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1265  cadmium resistance transporter, putative  35.92 
 
 		 206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00419797  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4210  cadmium resistance transporter  31.25 
 
 		 199 aa  97.8  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4310  cadmium resistance transporter  31.25 
 
 		 199 aa  97.8  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103075  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4479  cadmium resistance transporter  31.25 
 
 		 199 aa  97.8  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0699  cadmium resistance transporter, CadD family  39.2 
 
 		 201 aa  89.4  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000313403  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0853  cadmium resistance transporter  31.72 
 
 		 199 aa  84.7  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0347  cadmium resistance transporter  29.17 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0184  cadmium resistance transporter, putative  28.79 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2848  cadmium resistance transporter  28.43 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.551645 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1136  permease, cadmium resistance protein  33.01 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000632381  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2457  cadmium resistance transporter  28.91 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000531137  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5023  cadmium resistance transporter  29.29 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257452  normal  0.407908 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2866  cadmium resistance transporter  29.69 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000609266  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2696  putative transport protein  28.91 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000223261 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0350  cadmium resistance transporter  31.03 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1820  permease cadmium resistance protein-like protein  27.69 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135691  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1438  cadmium resistance transporter CadD  26.47 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799585  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4661  quaternary amine transporter  27.14 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4400  cadmium resistance transporter  32.68 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4410  cadmium resistance transporter  26.22 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4473  cadmium resistance transporter  26.22 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25750  predicted permease, cadmium resistance protein  28.65 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4404  cadmium resistance transporter  26.7 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2497  quaternary ammonium compound-resistance protein, C-terminal  32.09 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2849  cadmium resistance transporter  28.71 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2659  cadmium resistance transporter  26.37 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5025  cadmium resistance transporter  30.34 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0241386  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4463  cadmium resistance transporter  34.08 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00350576  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2868  cadmium resistance transporter  27.27 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3180  cadmium resistance transporter  28.42 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00474254  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20660  predicted permease, cadmium resistance protein  25 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25690  predicted permease, cadmium resistance protein  25 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3241  cadmium resistance transporter  24.73 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2205  cadmium resistance transporter  28.72 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4997  cadmium resistance transporter  25 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000622218  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4467  cadmium resistance transporter  28.57 
 
 		 232 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000272706  normal  0.331556 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3211  permease cadmium resistance protein-like protein  26.14 
 
 		 255 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0284266  normal  0.131465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3642  cadmium resistance transporter  24.04 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4076  cadmium transporter  30.95 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.999785  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0610  cadmium resistance transporter  29.46 
 
 		 139 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4068  cadmium transporter  26.12 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446991  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5227  cadmium resistance transporter  22.61 
 
 		 218 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1729  hypothetical protein  28.48 
 
 		 185 aa  42  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>