66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1019 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1019  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  173  8e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1470  hypothetical protein  59.09 
 
 
112 aa  105  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.461191  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0944  hypothetical protein  50 
 
 
90 aa  92  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14440  hypothetical protein  46.07 
 
 
89 aa  89.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0156  hypothetical protein  51.14 
 
 
88 aa  87.8  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.936337  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2117  hypothetical protein  42.7 
 
 
90 aa  87.8  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0409  hypothetical protein  43.82 
 
 
89 aa  87.4  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.168136  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3182  hypothetical protein  44.32 
 
 
92 aa  87.4  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  hitchhiker  0.00106731 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1723  hypothetical protein  43.82 
 
 
89 aa  85.5  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1534  hypothetical protein  51.16 
 
 
90 aa  85.5  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1683  hypothetical protein  51.16 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1378  hypothetical protein  43.18 
 
 
93 aa  84.3  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000129759  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1181  hypothetical protein  48.86 
 
 
92 aa  84  7e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.254415  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2075  ACT domain-containing protein  40.91 
 
 
114 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0918  hypothetical protein  50 
 
 
90 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0844317  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0970  hypothetical protein  44.32 
 
 
90 aa  81.6  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05450  hypothetical protein  43.18 
 
 
90 aa  81.6  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.670978  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2118  hypothetical protein  45.45 
 
 
92 aa  80.5  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2798  hypothetical protein  46.59 
 
 
90 aa  80.5  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019428  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1017  ACT domain-containing protein  44.19 
 
 
95 aa  79.3  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.890596  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0230  hypothetical protein  50 
 
 
90 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.867874  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1174  ACT domain protein  44.94 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.440111 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4121  ACT domain-containing protein  49.44 
 
 
92 aa  79  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0861831  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1747  hypothetical protein  45.65 
 
 
89 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0169419  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0941  ACT domain-containing protein  43.18 
 
 
88 aa  77.4  0.00000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0440922  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1499  ACT domain-containing protein  39.77 
 
 
90 aa  76.6  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1354  hypothetical protein  42.05 
 
 
93 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2268  hypothetical protein  40.91 
 
 
90 aa  75.9  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1126  hypothetical protein  38.2 
 
 
100 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000365501  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0612  hypothetical protein  39.77 
 
 
92 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287518  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0342  ACT domain-containing protein  43.68 
 
 
90 aa  73.9  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2658  hypothetical protein  40.91 
 
 
90 aa  73.9  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1031  hypothetical protein  40.91 
 
 
90 aa  73.6  0.0000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3283  hypothetical protein  42.05 
 
 
99 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0122  ACT domain-containing protein  43.82 
 
 
89 aa  73.2  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1270  hypothetical protein  38.64 
 
 
94 aa  71.6  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0829  hypothetical protein  44.32 
 
 
92 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1671  hypothetical protein  38.64 
 
 
100 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313942  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0758  hypothetical protein  40.23 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.140436 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0587  hypothetical protein  37.5 
 
 
90 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1034  hypothetical protein  40.7 
 
 
90 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11620  ACT domain-containing protein  40.45 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0439  ACT domain-containing protein  33.71 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2005  hypothetical protein  47.06 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.388818 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0912  hypothetical protein  45.61 
 
 
90 aa  55.5  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.187165 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0479  ACT domain-containing protein  45.65 
 
 
183 aa  50.8  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0527  amino acid-binding ACT domain protein  46.94 
 
 
185 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2199  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27.4 
 
 
175 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0596072  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2949  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.34 
 
 
183 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3703  glycine cleavage system regulatory protein-like  41.3 
 
 
183 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0654  formyl transferase domain protein  32.43 
 
 
316 aa  43.9  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0052  glycine cleavage system transcriptional repressor  34.25 
 
 
179 aa  43.9  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.824677  normal  0.630988 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0493  amino acid-binding ACT domain protein  29.73 
 
 
165 aa  43.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3457  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  32.94 
 
 
185 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1421  formyl transferase domain protein  35.14 
 
 
324 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3514  amino acid-binding ACT domain-containing protein  37.31 
 
 
186 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.160997  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3969  amino acid-binding ACT domain protein  33.33 
 
 
188 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100488  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8574  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  39.29 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4055  amino acid-binding ACT domain protein  36.84 
 
 
188 aa  41.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4711  formyl transferase domain protein  32.47 
 
 
325 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00446668  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1251  formyl transferase domain protein  36.84 
 
 
327 aa  41.2  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3554  amino acid-binding ACT  43.18 
 
 
189 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0217681  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2645  formyl transferase domain protein  32.43 
 
 
316 aa  40.4  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0437  ACT domain protein  30.26 
 
 
173 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0599  amino acid-binding ACT domain protein  30.26 
 
 
173 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  26.76 
 
 
400 aa  40  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>