More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0891 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0891  copper/potassium-transporting ATPase  100 
 
 
720 aa  1455    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0213981  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  44.01 
 
 
815 aa  556  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  42.59 
 
 
743 aa  544  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  40.78 
 
 
740 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  41.6 
 
 
794 aa  520  1e-146  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  41.55 
 
 
835 aa  521  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  41.28 
 
 
803 aa  521  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  40.35 
 
 
790 aa  513  1e-144  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0316  cation-transporting ATPase membrane protein  40.88 
 
 
1063 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1755  copper-translocating P-type ATPase  40.88 
 
 
1061 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55306  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3217  heavy metal translocating P-type ATPase  40.43 
 
 
741 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  41.34 
 
 
798 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1851  copper-translocating P-type ATPase  40.88 
 
 
1061 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.845444  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  41.36 
 
 
797 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  40.05 
 
 
802 aa  507  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1144  copper-translocating P-type ATPase  40.88 
 
 
1063 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2168  copper-translocating P-type ATPase  40.29 
 
 
971 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  40.05 
 
 
802 aa  507  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0854  copper-translocating P-type ATPase  40.88 
 
 
1061 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0405  cation-transporting ATPase membrane protein  40.75 
 
 
1061 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  40.57 
 
 
794 aa  504  1e-141  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  40.62 
 
 
797 aa  503  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  39.71 
 
 
1021 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  40.38 
 
 
799 aa  497  1e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  40.6 
 
 
946 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  39.71 
 
 
1021 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  38.93 
 
 
817 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3348  cation-transporting ATPase transmembrane protein  39.65 
 
 
748 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  37.19 
 
 
753 aa  492  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  39.84 
 
 
1040 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1952  putative cation-transporting ATPase membrane protein  41.08 
 
 
724 aa  492  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.51624  normal  0.45395 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5373  heavy metal translocating P-type ATPase  40.1 
 
 
937 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  40.03 
 
 
872 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  39.53 
 
 
1013 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  39.95 
 
 
1182 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  39.66 
 
 
804 aa  495  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  40.16 
 
 
805 aa  492  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  39.76 
 
 
797 aa  491  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2938  copper-translocating P-type ATPase  39.24 
 
 
795 aa  491  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  38.38 
 
 
752 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  38.98 
 
 
800 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4872  heavy metal translocating P-type ATPase  40.73 
 
 
816 aa  486  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  39.7 
 
 
793 aa  488  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  38.84 
 
 
799 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0654  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 
732 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3691  heavy metal translocating P-type ATPase  39.33 
 
 
793 aa  484  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  39.54 
 
 
799 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0750  copper-translocating P-type ATPase  39.01 
 
 
732 aa  481  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  40.92 
 
 
798 aa  482  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  38.58 
 
 
799 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0821  heavy metal translocating P-type ATPase  39.54 
 
 
790 aa  481  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  40.92 
 
 
798 aa  482  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1786  copper-translocating P-type ATPase  40.38 
 
 
789 aa  479  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.143553  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  40.69 
 
 
806 aa  476  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  40.85 
 
 
806 aa  476  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  39.38 
 
 
813 aa  478  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  40.27 
 
 
821 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  38.76 
 
 
792 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  37.25 
 
 
750 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  38.49 
 
 
792 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  40.4 
 
 
805 aa  474  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  38.05 
 
 
836 aa  473  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  40.51 
 
 
796 aa  474  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  40 
 
 
805 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3376  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  38.96 
 
 
819 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0019  heavy metal translocating P-type ATPase  36.72 
 
 
782 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0938  heavy metal translocating P-type ATPase  39.57 
 
 
730 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.485974 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  39.57 
 
 
730 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3524  heavy metal translocating P-type ATPase  40.32 
 
 
813 aa  472  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  40.13 
 
 
805 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  37.11 
 
 
759 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  37.11 
 
 
759 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  39.87 
 
 
805 aa  469  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  39.89 
 
 
805 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  39.87 
 
 
805 aa  469  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2276  heavy metal translocating P-type ATPase  40.96 
 
 
801 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0037  heavy metal translocating P-type ATPase  36.34 
 
 
782 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.374671  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1340  copper-translocating P-type ATPase  38.67 
 
 
796 aa  467  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  39.65 
 
 
817 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1051  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  39.94 
 
 
735 aa  466  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  39.66 
 
 
806 aa  465  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  38.91 
 
 
894 aa  462  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  37.56 
 
 
828 aa  462  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0024  heavy metal translocating P-type ATPase  38.04 
 
 
757 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1407  heavy metal translocating P-type ATPase  38.74 
 
 
758 aa  461  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.688507  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6890  copper-translocating P-type ATPase  37.25 
 
 
754 aa  461  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1916  copper-translocating P-type ATPase  37.35 
 
 
791 aa  457  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  36.52 
 
 
885 aa  456  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  37.19 
 
 
828 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0034  heavy metal translocating P-type ATPase  37.04 
 
 
767 aa  449  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  36.92 
 
 
828 aa  450  1e-125  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00260  putative copper transport-related membrane protein  38.34 
 
 
741 aa  451  1e-125  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348825  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0205  heavy metal translocating P-type ATPase  37.83 
 
 
823 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3535  copper-translocating P-type ATPase  38.46 
 
 
739 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.253095  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  36.57 
 
 
748 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.972303  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6644  copper-translocating P-type ATPase  37.22 
 
 
753 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.935468  normal  0.257295 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  36.95 
 
 
747 aa  444  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  37.99 
 
 
837 aa  444  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3238  heavy metal translocating P-type ATPase  39.15 
 
 
831 aa  442  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.141164  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  35.39 
 
 
759 aa  442  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>