130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0812 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0812  putative effector of murein hydrolase LrgA  100 
 
 
134 aa  264  2.9999999999999995e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000547644  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1147  hypothetical protein  52.54 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000363842  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0158  LrgA family protein  46.3 
 
 
117 aa  105  3e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1483  putative effector of murein hydrolase LrgA  53.39 
 
 
124 aa  101  4e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000434709  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0706  LrgA family protein  41.18 
 
 
131 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156699  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1358  LrgA family protein  31.53 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290916  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1793  LrgA  32.03 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  30.1 
 
 
121 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  30.1 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  30.1 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  30.1 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1414  LrgA family protein  36.94 
 
 
116 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.375061  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1939  LrgA  32.04 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  30.1 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  30.1 
 
 
121 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  29.13 
 
 
121 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2794  LrgA  42.35 
 
 
130 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1205  LrgA  37.63 
 
 
122 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00283313  normal  0.0677491 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  29.13 
 
 
121 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  29.13 
 
 
121 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  29.13 
 
 
121 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  28.16 
 
 
121 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2669  hypothetical protein  40.23 
 
 
125 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293278  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  33.33 
 
 
116 aa  60.5  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0197927 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1950  LrgA family protein  36.54 
 
 
119 aa  60.5  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000107186  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00870  putative effector of murein hydrolase LrgA  41.79 
 
 
248 aa  60.5  0.000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2967  hypothetical protein  36.27 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2542  hypothetical protein  30.16 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2930  LrgA  40 
 
 
128 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5535  murein hydrolase regulator LrgA  29.41 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2447  hypothetical protein  30.28 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5572  murein hydrolase regulator LrgA  29.41 
 
 
170 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5385  murein hydrolase regulator LrgA  29.41 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.655957 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5294  murein hydrolase regulator LrgA  29.41 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5121  murein hydrolase regulator LrgA  29.41 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5136  murein hydrolase regulator LrgA  29.41 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3105  LrgA  34.62 
 
 
119 aa  58.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3200  hypothetical protein  28.45 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370954  normal  0.0153861 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5690  murein hydrolase regulator LrgA  29.41 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0820  LrgA family protein  28.12 
 
 
148 aa  58.9  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743787  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5564  murein hydrolase regulator LrgA  29.41 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1498  hypothetical protein  35.23 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0432  LrgA  30.95 
 
 
123 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  30.89 
 
 
125 aa  58.2  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1947  lrgA family protein  31.71 
 
 
125 aa  58.2  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5620  murein hydrolase regulator LrgA  29.46 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0714  LrgA family protein  29.25 
 
 
118 aa  57  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00234079  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3750  LrgA family protein  32.69 
 
 
113 aa  56.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5233  murein hydrolase regulator LrgA  27.68 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0129  LrgA family protein  23.93 
 
 
121 aa  56.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0247  murein hydrolase regulator LrgA  24.6 
 
 
145 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0253  murein hydrolase regulator LrgA  24.6 
 
 
145 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0020  LrgA family protein  33.04 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2905  LrgA family protein  35.9 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1570  hypothetical protein  31.96 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2499  LrgA family protein  36.11 
 
 
129 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.694502 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1269  LrgA family protein  35.62 
 
 
121 aa  55.1  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1066  LrgA family protein  34.91 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3994  LrgA family protein  40.28 
 
 
119 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.626323  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3957  murein hydrolase regulator LrgA  26.79 
 
 
143 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02070  hypothetical protein  30 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1517  LrgA family protein  30 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02029  hypothetical protein  30 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2744  hypothetical protein  30.91 
 
 
132 aa  52.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0211  LrgA family protein  34.69 
 
 
129 aa  52  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2275  hypothetical protein  30 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2436  hypothetical protein  30.91 
 
 
132 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1507  hypothetical protein  30 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2288  hypothetical protein  30 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00796393 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0830  hypothetical protein  30 
 
 
132 aa  52.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3273  hypothetical protein  30.91 
 
 
132 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.502581 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2026  murein hydrolase regulator LrgA  34.25 
 
 
152 aa  52  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3599  holin-like protein  30 
 
 
118 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.348579  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3885  holin-like protein  30 
 
 
118 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3766  holin-like protein  30 
 
 
118 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000368627 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3767  LrgA family protein  33.71 
 
 
124 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.0600127 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02118  hypothetical protein  33.77 
 
 
124 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2298  LrgA family protein  33.33 
 
 
133 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2371  hypothetical protein  32 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2416  hypothetical protein  32 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2420  hypothetical protein  32 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2327  hypothetical protein  32 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2528  hypothetical protein  32 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0775  LrgA  34.92 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.186274  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1681  inner membrane protein, LrgA family  37.84 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.575173  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2682  putative murein hydrolase exporter LrgA(holin) like  27.08 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3065  LrgA family protein  33.71 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.348494  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0292  LrgA family protein  35.8 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3525  holin-like protein  29 
 
 
118 aa  48.9  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1576  LrgA family protein  30.77 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000178738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1317  LrgA family protein  26.55 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09912e-21 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2460  hypothetical protein  26.5 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3025  hypothetical protein  26.5 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318626  normal  0.0401094 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2559  hypothetical protein  26.5 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.22344  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1237  LrgA family protein  28.57 
 
 
138 aa  47.4  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.783024  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1443  holin-like protein  28 
 
 
118 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.58028  hitchhiker  0.00000036945 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2564  LrgA family protein  32.35 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2617  LrgA family protein  32.35 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1009  LrgA family protein  28.83 
 
 
118 aa  46.2  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0073  LrgA family protein  27.1 
 
 
114 aa  46.2  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>