More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0770 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0770  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  100 
 
 
451 aa  919    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0473  O-succinylbenzoate-CoA ligase  47.54 
 
 
453 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0829722  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  37.5 
 
 
481 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  37.29 
 
 
481 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4965  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  37.31 
 
 
482 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4585  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  37.1 
 
 
482 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4747  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  37.1 
 
 
482 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5108  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  37.1 
 
 
481 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  36.89 
 
 
482 aa  300  4e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4607  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  37.31 
 
 
482 aa  298  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  36.86 
 
 
482 aa  298  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  36.46 
 
 
481 aa  296  4e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  38.4 
 
 
490 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  38.91 
 
 
492 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3490  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.5 
 
 
481 aa  280  5e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.77 
 
 
486 aa  276  6e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1920  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.16 
 
 
510 aa  273  6e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0888  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.08 
 
 
473 aa  272  8.000000000000001e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2021  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.73 
 
 
479 aa  256  8e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0280  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  35.16 
 
 
484 aa  249  6e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1847  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.99 
 
 
492 aa  248  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1883  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.99 
 
 
492 aa  248  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1358  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.26 
 
 
474 aa  242  9e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0273591  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1229  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.26 
 
 
500 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4219  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.76 
 
 
491 aa  238  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1774  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.48 
 
 
528 aa  232  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0023  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.88 
 
 
494 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692894  normal  0.83419 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  31.19 
 
 
508 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2248  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.52 
 
 
513 aa  220  3e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.2585 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 
508 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  30.28 
 
 
499 aa  213  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  29.86 
 
 
508 aa  210  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  28.6 
 
 
561 aa  209  5e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.779432  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.76 
 
 
514 aa  206  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1821  AMP-binding protein  29.92 
 
 
500 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.133341 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3473  AMP-binding protein  28.78 
 
 
488 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3220  AMP-binding protein  28.78 
 
 
500 aa  199  7e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.530837  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3439  AMP-binding protein  28.78 
 
 
500 aa  199  7e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3198  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.78 
 
 
497 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.335021  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3453  AMP-binding protein  28.78 
 
 
500 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3426  AMP-binding protein  29.21 
 
 
500 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.473482  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3127  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.78 
 
 
500 aa  197  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3436  AMP-binding protein  29.27 
 
 
499 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3117  AMP-dependent synthetase and ligase  28.78 
 
 
500 aa  195  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  31.82 
 
 
506 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2327  AMP-dependent synthetase and ligase  27.61 
 
 
496 aa  194  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.940747  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  27.86 
 
 
505 aa  193  6e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  29.3 
 
 
496 aa  192  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  28.12 
 
 
520 aa  192  8e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  30.77 
 
 
485 aa  192  8e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  29.35 
 
 
496 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4263  AMP-dependent synthetase and ligase  28.75 
 
 
502 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.427818 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  29.3 
 
 
496 aa  192  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  29.3 
 
 
496 aa  192  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0392  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.39 
 
 
498 aa  189  7e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172525  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2822  AMP-dependent synthetase and ligase  33.13 
 
 
430 aa  187  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.6 
 
 
529 aa  187  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0737  AMP-dependent synthetase and ligase  28.84 
 
 
522 aa  186  9e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188702  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  27.6 
 
 
516 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.63 
 
 
491 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  30.22 
 
 
526 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.28 
 
 
524 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  30.7 
 
 
502 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.25 
 
 
519 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  31.1 
 
 
506 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  29.31 
 
 
518 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 
512 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  27.63 
 
 
530 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2046  AMP-dependent synthetase and ligase  29.86 
 
 
495 aa  183  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.920452  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  28.66 
 
 
504 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.14 
 
 
517 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.14 
 
 
517 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.14 
 
 
517 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  30.85 
 
 
620 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.784497  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  28.11 
 
 
503 aa  182  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.82 
 
 
579 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4129  AMP-dependent synthetase and ligase  27.98 
 
 
497 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.706043 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  29.34 
 
 
520 aa  180  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  28.71 
 
 
530 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  31 
 
 
503 aa  179  7e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  28.85 
 
 
530 aa  179  8e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.866447  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  28.63 
 
 
509 aa  179  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2385  AMP-dependent synthetase and ligase  28.92 
 
 
502 aa  179  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10167  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.55 
 
 
554 aa  178  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2202  AMP-dependent synthetase and ligase  31.1 
 
 
525 aa  177  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4613  AMP-dependent synthetase and ligase  27.49 
 
 
512 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  27.24 
 
 
515 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.93 
 
 
525 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1497  AMP-dependent synthetase and ligase  28.48 
 
 
690 aa  176  5e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  28.47 
 
 
536 aa  176  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4968  AMP-dependent synthetase and ligase  29.91 
 
 
489 aa  176  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  30.36 
 
 
490 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  28.48 
 
 
502 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  27.07 
 
 
501 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  27.8 
 
 
518 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.17 
 
 
525 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.42 
 
 
526 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  28.37 
 
 
513 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  32.7 
 
 
521 aa  174  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1609  AMP-dependent synthetase and ligase  28.3 
 
 
527 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>