134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_24940 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_24940  methanol dehydrogenase  100 
 
 		 301 aa  603  1.0000000000000001e-171  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2277  hypothetical protein  40.43 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000559255  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1228  protein of unknown function DUF477  36.84 
 
 		 315 aa  96.7  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1259  protein of unknown function DUF477  37.41 
 
 		 315 aa  93.6  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.642039  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1372  hypothetical protein  37.66 
 
 		 290 aa  93.2  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740234  hitchhiker  0.000166638 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0414  protein of unknown function DUF477  37.06 
 
 		 246 aa  90.5  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1419  protein of unknown function DUF477  35.77 
 
 		 315 aa  90.1  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2422  protein of unknown function DUF477  35.33 
 
 		 287 aa  89.7  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2026  protein of unknown function DUF477  35.53 
 
 		 260 aa  89.4  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.903181 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1773  hypothetical protein  34.75 
 
 		 256 aa  89  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.61154  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2033  hypothetical protein  32.88 
 
 		 285 aa  88.2  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1795  protein of unknown function DUF477  34 
 
 		 288 aa  86.3  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.039663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1392  hypothetical protein  35.97 
 
 		 166 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2527  hypothetical protein  34.03 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00024916  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3227  hypothetical protein  34.72 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2363  protein of unknown function DUF477  30.43 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.116241  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0394  hypothetical protein  34.39 
 
 		 259 aa  83.2  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.729327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3992  hypothetical protein  34.13 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.222479 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2118  hypothetical protein  33.96 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04780  hypothetical protein  30.77 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.746137  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0812  hypothetical protein  32.24 
 
 		 260 aa  82  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1478  hypothetical protein  34.42 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47040  hypothetical protein  33.57 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4334  protein of unknown function DUF477  29.88 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.82734 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2021  hypothetical protein  33.1 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000021885  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1082  hypothetical protein  32.43 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3875  hypothetical protein  30.23 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.063736 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2296  protein of unknown function DUF477  34.23 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00760531 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2019  hypothetical protein  35.51 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0878  hypothetical protein  36.96 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236831  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3453  hypothetical protein  34.9 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.529474  normal  0.0920314 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3401  hypothetical protein  30.72 
 
 		 288 aa  79  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0956  hypothetical protein  33.08 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1334  hypothetical protein  33.82 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1823  protein of unknown function DUF477  33.59 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0387884  normal  0.867329 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1981  protein of unknown function DUF477  33.33 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_002950  PG0361  hypothetical protein  35.38 
 
 		 435 aa  77  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.343727 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1186  hypothetical protein  32.89 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0460603  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1889  hypothetical protein  26.67 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1255  protein of unknown function DUF477  35.14 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0178341  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0990  hypothetical protein  34.09 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6688  hypothetical protein  29.11 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0102145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3955  hypothetical protein  29.76 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1073  hypothetical protein  32.88 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3481  hypothetical protein  31.85 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3082  hypothetical protein  31.54 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000317552  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4747  hypothetical protein  30.23 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_004310  BR1821  hypothetical protein  28.99 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1720  hypothetical protein  30.35 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1753  hypothetical protein  28.99 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2520  protein of unknown function DUF477  34.48 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2627  hypothetical protein  31.9 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1222  protein of unknown function DUF477  31.51 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1510  hypothetical protein  32.94 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.402719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6373  hypothetical protein  32.19 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0774641  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4289  hypothetical protein  32.88 
 
 		 205 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0868  hypothetical protein  35.2 
 
 		 260 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0146  hypothetical protein  31.39 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1230  protein of unknown function DUF477  29.3 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0298184 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1762  protein of unknown function DUF477  32.84 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.485399  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0917  protein of unknown function DUF477  43.93 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.016886  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0913  protein of unknown function DUF477  43.93 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2920  hypothetical protein  30.77 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.83358e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0934  hypothetical protein  30.77 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000566742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45700  hypothetical protein  36.8 
 
 		 453 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02623  hypothetical protein  30.77 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000105105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0910  protein of unknown function DUF477  30.77 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203504  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6199  hypothetical protein  29.37 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02585  hypothetical protein  30.77 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000156395  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1299  hypothetical protein  27.45 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0218065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0258  hypothetical protein  29.92 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.734577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4854  protein of unknown function DUF477  28.99 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4038  hypothetical protein  31.25 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000052611  normal  0.949055 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2915  hypothetical protein  31.39 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0386021  normal  0.901055 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0327  putative lipoprotein  26.99 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0103  hypothetical protein  27.94 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.504217  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1670  hypothetical protein  36.27 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.946532  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0424  hypothetical protein  31.13 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3371  putative lipoprotein  26.38 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0509  putative lipoprotein  26.38 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3041  putative lipoprotein  26.38 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2051  putative lipoprotein  26.38 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2233  putative lipoprotein  26.38 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3713  hypothetical protein  31.69 
 
 		 301 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3702  hypothetical protein  26.63 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83448  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0314  putative lipoprotein  27.66 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3876  glycine rich protein  34.71 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2913  hypothetical protein  26.26 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00131763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2047  hypothetical protein  27.27 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.976247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0639  hypothetical protein  29.85 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1903  putative glycine rich membrane protein  25.93 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1189  hypothetical protein  28.67 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0875  protein of unknown function DUF477  29.09 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000594367  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0606  protein of unknown function DUF477  30.57 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0285  putative lipoprotein  27.66 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1787  hypothetical protein  32.88 
 
 		 238 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000129243  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0034  protein of unknown function DUF477  30.49 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0925  hypothetical protein  41.44 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.295329 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1830  hypothetical protein  32.85 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00424727  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0416  hypothetical protein  31.33 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>