269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4074 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4074  phenazine biosynthesis protein PhzF family  100 
 
 
276 aa  535  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179647  normal  0.796679 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  58.67 
 
 
276 aa  290  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92488  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3886  phenazine biosynthesis protein PhzF family  55.43 
 
 
278 aa  278  6e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149446 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2623  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  54.61 
 
 
280 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00658693  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1510  phenazine biosynthesis protein PhzF family  57.82 
 
 
276 aa  275  5e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2310  PhzF family phenazine biosynthesis protein  58.82 
 
 
273 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2363  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  52.88 
 
 
280 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640546  normal  0.225365 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0187  PhzF family phenazine biosynthesis protein  55.88 
 
 
280 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696184  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0365  phenazine biosynthesis protein PhzF family  56.38 
 
 
279 aa  260  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3119  phenazine biosynthesis protein PhzF family  53.82 
 
 
291 aa  259  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46630  hypothetical protein  54.68 
 
 
278 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000930854  hitchhiker  0.00000437655 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4017  hypothetical protein  53.96 
 
 
278 aa  257  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3846  PhzF family phenazine biosynthesis protein  53.47 
 
 
291 aa  257  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22670  phenazine biosynthesis protein PhzF family  57.3 
 
 
304 aa  256  3e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1989  PhzF family phenazine biosynthesis protein  53.24 
 
 
279 aa  255  6e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.797447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0741  phenazine biosynthesis protein PhzF family  50.82 
 
 
311 aa  252  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3538  PhzF family phenazine biosynthesis protein  54.18 
 
 
283 aa  248  7e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00577442 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4322  phenazine biosynthesis protein PhzF family  51.28 
 
 
280 aa  246  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.283976 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4439  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.03 
 
 
294 aa  246  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.746932 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0325  PhzF family phenazine biosynthesis protein  52.92 
 
 
279 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00679482  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10910  phenazine biosynthesis protein PhzF family  54.23 
 
 
285 aa  242  5e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.928492 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0680  phenazine biosynthesis protein PhzF family  53.6 
 
 
283 aa  241  7.999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000121985 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6090  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  51.48 
 
 
281 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.196506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1987  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.48 
 
 
281 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1043  PhzF family phenazine biosynthesis protein  53.09 
 
 
278 aa  240  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.760247  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50.75 
 
 
340 aa  238  6.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3018  phenazine biosynthesis protein PhzF family  54.15 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.37138  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5876  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50.55 
 
 
279 aa  232  6e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.201483 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0400  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.67 
 
 
310 aa  231  8.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6782  putative phenazine biosynthesis protein  48.58 
 
 
278 aa  231  8.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0835253 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4242  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  46.2 
 
 
331 aa  231  9e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1987  PhzF family phenazine biosynthesis protein  53.85 
 
 
276 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.3632  normal  0.520518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1741  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  49.83 
 
 
294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2353  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.83 
 
 
294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2271  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.55 
 
 
293 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5692  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  48.95 
 
 
293 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3731  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  42.59 
 
 
318 aa  218  7e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2119  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.71 
 
 
296 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.0423877 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2374  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.83 
 
 
294 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3334  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  47.81 
 
 
305 aa  216  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379921 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1963  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  53.33 
 
 
239 aa  214  9e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2389  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.48 
 
 
293 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1211  phenazine biosynthesis protein PhzF family  48.97 
 
 
296 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0949  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  48.41 
 
 
298 aa  209  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1152  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.74 
 
 
299 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2073  putative phenazine biosynthesis protein phzF  47.39 
 
 
299 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152658  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2222  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  47.39 
 
 
299 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.96967  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0707  putative phenazine biosynthesis protein phzF  47.39 
 
 
299 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2541  putative phenazine biosynthesis protein phzF  47.39 
 
 
299 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1312  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.39 
 
 
299 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.39 
 
 
299 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0926  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.5 
 
 
293 aa  202  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.591994 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1408  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.73 
 
 
293 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.586675  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2754  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.07 
 
 
298 aa  189  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0592  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.05 
 
 
319 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574326  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2536  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.48 
 
 
293 aa  186  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1516  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.32 
 
 
298 aa  185  9e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1010  phenazine biosynthesis protein PhzF family  45.7 
 
 
290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55048  predicted protein  39.39 
 
 
296 aa  181  1e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.413471  normal  0.129308 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.34 
 
 
292 aa  171  9e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5621  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.34 
 
 
292 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409041  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.71 
 
 
292 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46420  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF-like protein  38.51 
 
 
292 aa  168  8e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6454  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.64 
 
 
292 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0855729  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1448  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.24 
 
 
291 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959683  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1009  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.1 
 
 
292 aa  139  7e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02007  phenazine biosynthesis PhzF family protein  37.41 
 
 
293 aa  136  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3592  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.44 
 
 
302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1135  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.99 
 
 
289 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125748  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3243  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.44 
 
 
307 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0718  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40 
 
 
289 aa  104  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186354 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3359  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  31.58 
 
 
302 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1499  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.23 
 
 
306 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.172905  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  31.45 
 
 
300 aa  104  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2594  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.86 
 
 
302 aa  103  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6912  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  35 
 
 
285 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1456  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  35.92 
 
 
286 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6372  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.92 
 
 
286 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7039  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.21 
 
 
286 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0837  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  34.38 
 
 
286 aa  99.8  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0665  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.06 
 
 
289 aa  98.2  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449662  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2745  uncharacterized isomerase  41.01 
 
 
286 aa  97.8  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0223122 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1331  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.01 
 
 
299 aa  97.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3540  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.13 
 
 
307 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1932  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.72 
 
 
305 aa  95.9  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2532  hypothetical protein  29.76 
 
 
301 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.371026  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2898  phenazine biosynthesis protein PhzF family  57.83 
 
 
309 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.270248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2671  PhzF family phenazine biosynthesis protein  57.83 
 
 
309 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.192851 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1819  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.83 
 
 
308 aa  92.4  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0884  phenazine biosynthesis protein  38.55 
 
 
278 aa  92  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.01 
 
 
309 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0750  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.91 
 
 
306 aa  92  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.707799 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3380  phenazine biosynthesis protein  38.55 
 
 
278 aa  92  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1138  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  33.22 
 
 
288 aa  91.3  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144521  normal  0.235936 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09420  phenazine biosynthesis protein  39.55 
 
 
278 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39890  phenazine biosynthesis protein  39.55 
 
 
278 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4191  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.59 
 
 
313 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4230  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.59 
 
 
313 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825535 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.07 
 
 
278 aa  90.9  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2730  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.62 
 
 
303 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372142  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>