More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3374 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3374  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 189 aa  366  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.0226984 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  48 
 
 		 194 aa  115  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20020  fructose-2,6-bisphosphatase  40.35 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.286624  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0069  broad-specificity phosphatase PhoE  46.29 
 
 		 197 aa  111  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  43.64 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0300  Phosphoglycerate mutase  44.57 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  42.78 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3761  phosphoglycerate mutase  35.59 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.300708  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 		 190 aa  105  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2637  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 190 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00707522  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4049  phosphoglycerate mutase family protein  35.03 
 
 		 192 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00510516  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3949  phosphoglycerate mutase family protein  35.03 
 
 		 192 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3981  phosphoglycerate mutase family protein  35.03 
 
 		 192 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181997  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3694  phosphoglycerate mutase family protein  35.03 
 
 		 192 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0148524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1203  phosphoglycerate mutase  34.46 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3846  phosphoglycerate mutase family protein  35.03 
 
 		 192 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000331625  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3677  phosphoglycerate mutase family protein  35.03 
 
 		 192 aa  102  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4144  phosphoglycerate mutase family protein  35.03 
 
 		 192 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  35.9 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  45.6 
 
 		 205 aa  99  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  38.8 
 
 		 240 aa  97.8  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  45.08 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2906  Phosphoglycerate mutase  34.64 
 
 		 191 aa  95.1  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0508336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  36.96 
 
 		 213 aa  94.7  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  39.52 
 
 		 210 aa  94.4  8e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  35.45 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  38.66 
 
 		 209 aa  94  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  40.61 
 
 		 237 aa  92.4  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  37.5 
 
 		 229 aa  90.9  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  41.36 
 
 		 251 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  41.29 
 
 		 227 aa  90.5  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  39.13 
 
 		 202 aa  89.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  39.57 
 
 		 207 aa  89  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  35.93 
 
 		 209 aa  88.6  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  39.68 
 
 		 214 aa  87.8  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  31.69 
 
 		 213 aa  87.8  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  36.5 
 
 		 229 aa  87.8  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  36.5 
 
 		 229 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  36.5 
 
 		 220 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  36.5 
 
 		 220 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  36.5 
 
 		 220 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  36.5 
 
 		 220 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  36.5 
 
 		 220 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  52.58 
 
 		 224 aa  86.3  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  38.69 
 
 		 192 aa  84.7  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  42.47 
 
 		 198 aa  84.7  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  38.22 
 
 		 223 aa  84.7  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  42.21 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  42.21 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  36.17 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  37.7 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  34.38 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  39.57 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  36.2 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  37.06 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  33.85 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 		 188 aa  80.9  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  37.82 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  38.5 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  34.9 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  38.22 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  34.18 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  40.13 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  32.29 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  38.32 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  38.32 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  33.52 
 
 		 447 aa  78.2  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  39.82 
 
 		 442 aa  78.2  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  38.92 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  30.05 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  36 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  37.72 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  43.64 
 
 		 459 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  38.36 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  42.76 
 
 		 363 aa  77.4  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  31.38 
 
 		 448 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  37.63 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  39.76 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  38.94 
 
 		 442 aa  76.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  37.72 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.57 
 
 		 442 aa  76.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  44.44 
 
 		 445 aa  76.6  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  30.98 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  38.32 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  30.98 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35.52 
 
 		 444 aa  76.3  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  37.13 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0540  phosphoglycerate mutase  37.99 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.803779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  37.02 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  39.74 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.42 
 
 		 442 aa  76.3  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 		 402 aa  75.5  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13280  fructose-2,6-bisphosphatase  39.86 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>