253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1622 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1622  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
482 aa  960    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2041  flagellar hook-associated protein FlgK  32.85 
 
 
463 aa  193  6e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0989  flagellar hook-associated protein FlgK  32.87 
 
 
482 aa  178  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100834  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3000  flagellar hook-associated protein FlgK  30.52 
 
 
472 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000379276 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31330  flagellar hook-associated protein FlgK  31.19 
 
 
475 aa  173  7.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2357  flagellar hook-associated protein FlgK  30.23 
 
 
459 aa  161  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  27.85 
 
 
463 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  27.15 
 
 
477 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  25.74 
 
 
471 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  23.31 
 
 
489 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  28.17 
 
 
477 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  28.82 
 
 
464 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  27.89 
 
 
456 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0013  flagellar hook-associated protein FlgK  25.59 
 
 
475 aa  121  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  26.98 
 
 
457 aa  120  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  27.18 
 
 
478 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0022  flagellar hook-associated protein FlgK  27.04 
 
 
443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  27.46 
 
 
465 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  26.9 
 
 
457 aa  114  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0095  flagellar hook-associated protein FlgK  24.91 
 
 
537 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  25.78 
 
 
486 aa  110  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1736  flagellar hook-associated protein FlgK  24.43 
 
 
432 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1526  flagellar hook-associated protein FlgK  24.22 
 
 
432 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0305654  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  34.39 
 
 
695 aa  109  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1515  flagellar hook-associated protein FlgK  24.02 
 
 
432 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1351  flagellar hook-associated protein FlgK  25.05 
 
 
440 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1551  flagellar hook-associated protein FlgK  24.02 
 
 
432 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.890668  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1669  flagellar hook-associated protein FlgK  24.02 
 
 
432 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  30.3 
 
 
640 aa  108  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  24.86 
 
 
858 aa  107  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0769  flagellar hook-associated protein FlgK  27.46 
 
 
466 aa  107  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  25.7 
 
 
847 aa  107  6e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  24.86 
 
 
858 aa  107  6e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  25.15 
 
 
457 aa  106  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  26.36 
 
 
457 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  29.6 
 
 
653 aa  105  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  31.58 
 
 
637 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  29.67 
 
 
583 aa  105  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0665  flagellar hook-associated protein FlgK  30.38 
 
 
858 aa  103  6e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  31.87 
 
 
638 aa  103  7e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1139  flagellar hook-associated protein FlgK  33.77 
 
 
614 aa  101  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  24.77 
 
 
531 aa  99.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0208  flagellar hook-associated protein FlgK  28.93 
 
 
462 aa  99.4  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.750314  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  32.64 
 
 
647 aa  99  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1555  flagellar hook-associated protein FlgK  23.76 
 
 
432 aa  98.2  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163445  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1704  flagellar hook-associated protein FlgK  24.07 
 
 
432 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1814  flagellar hook-associated protein FlgK  23.71 
 
 
432 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  32.09 
 
 
640 aa  97.8  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1758  flagellar hook-associated protein FlgK  23.71 
 
 
432 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3642  flagellar hook-associated protein FlgK  23.08 
 
 
432 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0181  flagellar hook-associated protein FlgK  28.87 
 
 
627 aa  95.9  1e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  27.4 
 
 
480 aa  95.5  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  25.96 
 
 
464 aa  95.5  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0248  flagellar hook-associated protein FlgK  29.25 
 
 
570 aa  95.1  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  31.1 
 
 
631 aa  95.1  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  25.39 
 
 
486 aa  95.9  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  30.59 
 
 
685 aa  95.5  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  28.61 
 
 
920 aa  95.1  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0391  flagellar hook-associated protein FlgK  26.46 
 
 
484 aa  94.7  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0799381  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  32.47 
 
 
688 aa  94.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  23.21 
 
 
846 aa  94.7  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3837  flagellar hook-associated protein FlgK  29.93 
 
 
691 aa  94.4  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1534  flagellar hook-associated protein FlgK  26.32 
 
 
551 aa  93.6  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  32.96 
 
 
644 aa  93.2  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  28.22 
 
 
696 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2563  flagellar hook-associated protein FlgK  24.7 
 
 
481 aa  91.7  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0215  flagellar hook-associated protein FlgK  26.75 
 
 
455 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727542  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0192  flagellar hook-associated protein-like protein  26.74 
 
 
838 aa  90.5  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  25.26 
 
 
457 aa  90.5  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0648  flagellar hook-associated protein FlgK  25.67 
 
 
453 aa  90.5  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  29.37 
 
 
623 aa  90.1  9e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0094  flagellar hook-associated protein FlgK  25.62 
 
 
708 aa  89.7  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4430  flagellar hook-associated protein FlgK  33.71 
 
 
642 aa  89.7  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.436802  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  24.64 
 
 
457 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1788  flagellar hook-associated protein FlgK  28.99 
 
 
532 aa  88.6  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3110  flagellar hook-associated protein FlgK  28.74 
 
 
672 aa  89  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293616  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  30.91 
 
 
645 aa  88.6  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  27.38 
 
 
525 aa  89  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2236  flagellar hook-associated protein FlgK  28.85 
 
 
568 aa  88.2  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215386 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3010  flagellar hook-associated protein FlgK  30.58 
 
 
659 aa  87.4  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0246  flagellar hook-associated protein FlgK  26.2 
 
 
452 aa  87.4  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  32.64 
 
 
680 aa  87  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  29.18 
 
 
676 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  32.1 
 
 
631 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2916  flagellar hook-associated protein  30.27 
 
 
441 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3031  flagellar hook-associated protein FlgK  26.77 
 
 
541 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1628  flagellar hook-associated protein FlgK  33.62 
 
 
629 aa  85.9  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.770281 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0602  flagellar hook-associated protein FlgK  29.53 
 
 
560 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  30.24 
 
 
642 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  27.95 
 
 
657 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0624  flagellar hook-associated protein FlgK  30.48 
 
 
642 aa  84.7  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  33.86 
 
 
645 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3839  flagellar hook-associated protein FlgK  27.11 
 
 
480 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0049763 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  32.13 
 
 
549 aa  84.7  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  26.87 
 
 
680 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  25.45 
 
 
454 aa  84.7  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  33.86 
 
 
645 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1506  flagellar hook-associated protein FlgK  30 
 
 
681 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  23.39 
 
 
637 aa  84  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2401  flagellar hook-associated protein FlgK  30.59 
 
 
643 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>