46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0144 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0144  protein of unknown function DUF1275  100 
 
 		 229 aa  417  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1053  protein of unknown function DUF1275  58.22 
 
 		 239 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3838  protein of unknown function DUF1275  54.88 
 
 		 238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.036999  normal  0.190043 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0326  protein of unknown function DUF1275  52.68 
 
 		 234 aa  161  7e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1320  hypothetical protein  48.99 
 
 		 231 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0804  hypothetical protein  43.93 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0137  hypothetical protein  39.23 
 
 		 224 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.242525 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0128  hypothetical protein  39.23 
 
 		 224 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0118  hypothetical protein  37.5 
 
 		 224 aa  91.7  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19360  predicted membrane protein  38.32 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0604968  normal  0.138211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7507  protein of unknown function DUF1275  39.34 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1257  hypothetical protein  33.33 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1998  protein of unknown function DUF1275  34.15 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2058  protein of unknown function DUF1275  56.76 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0018845  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2153  membrane protein-like protein  35.58 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4228  hypothetical protein  32.05 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468664  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06861  DUF1275 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G13060)  28.12 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000108871  hitchhiker  0.00598939 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2773  protein of unknown function DUF1275  34.75 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3843  protein of unknown function DUF1275  48.15 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4285  hypothetical protein  33.14 
 
 		 289 aa  49.7  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.108694  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4207  protein of unknown function DUF1275  48.08 
 
 		 231 aa  49.3  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.249514  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2954  hypothetical protein  35.17 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.626632  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2290  protein of unknown function DUF1275  33.33 
 
 		 249 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  0.347075 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  27.68 
 
 		 241 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4098  hypothetical protein  47.5 
 
 		 236 aa  45.1  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6355  hypothetical protein  35.16 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.286548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2335  hypothetical protein  33.72 
 
 		 249 aa  44.3  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.000447759  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3053  hypothetical protein  36.26 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04855  DUF1275 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07550)  26.79 
 
 		 331 aa  43.9  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3028  hypothetical protein  36.26 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3003  hypothetical protein  35.16 
 
 		 236 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3009  hypothetical protein  36.26 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0287  hypothetical protein  32.97 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2395  hypothetical protein  36.26 
 
 		 248 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.844909  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3343  hypothetical protein  32.97 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3012  hypothetical protein  32.97 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3335  hypothetical protein  32.97 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0258  hypothetical protein  34.02 
 
 		 246 aa  43.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2081  hypothetical protein  32.97 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0483  hypothetical protein  32.97 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2614  protein of unknown function DUF1275  34.15 
 
 		 224 aa  43.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2918  hypothetical protein  35.16 
 
 		 273 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4851  hypothetical protein  29.41 
 
 		 240 aa  42.7  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5622  protein of unknown function DUF1275  34.52 
 
 		 264 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368186  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0190  hypothetical protein  31.76 
 
 		 196 aa  42  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0735535 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0299  hypothetical protein  31.87 
 
 		 246 aa  42  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>