More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4071 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_4071  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 301 aa  604  9.999999999999999e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0957932 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2541  LysR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49110  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 296 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000474321 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3250  transcriptional regulator, LysR family  36.03 
 
 		 314 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0083  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.9 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363159  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1268  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 317 aa  139  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4195  transcriptional regulator  34.83 
 
 		 296 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.140218  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2879  LysR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 305 aa  136  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105069 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6233  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.56 
 
 		 328 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4773  transcriptional regulator, LysR family  33.78 
 
 		 295 aa  135  9e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2900  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.89 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2275  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.89 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2890  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.89 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1165  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.711876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2586  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 305 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0519  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 305 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3606  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 305 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.613812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2802  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.56 
 
 		 323 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2940  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.56 
 
 		 328 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0414  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.56 
 
 		 348 aa  132  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0376293  normal  0.0295817 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0565  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0491  LysR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.978551 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0383  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.89 
 
 		 320 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4030  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0481  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4008  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1463  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 306 aa  126  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2331  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 305 aa  126  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0724376  normal  0.145615 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1915  LysR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0423  LysR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 305 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5786  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 330 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6151  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 330 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410647  normal  0.467276 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7705  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 317 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.728095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5711  transcriptional regulator, LysR family  32.47 
 
 		 310 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.831574  normal  0.349345 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3137  transcriptional regulator, LysR family  35.86 
 
 		 287 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2214  LysR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 308 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0669  transcriptional regulator, LysR family  32.71 
 
 		 309 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0501  DNA-binding transcriptional activator GcvA  30.9 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0370633 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6631  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0055  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.89 
 
 		 321 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0623  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.89 
 
 		 321 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3189  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.89 
 
 		 321 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1372  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.89 
 
 		 321 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0221  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.89 
 
 		 321 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1385  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 311 aa  123  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.765137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0449  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 305 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.038969  normal  0.109175 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3270  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 318 aa  123  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.321515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0441  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.89 
 
 		 321 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0461  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.89 
 
 		 321 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796194  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2215  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 317 aa  122  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.230967  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002638  putative transcriptional regulator LysR family  31.35 
 
 		 316 aa  122  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0120713  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4608  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 332 aa  122  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.960011  normal  0.108983 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0058  DNA-binding transcriptional activator GcvA  42.38 
 
 		 297 aa  122  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1265  putative transcriptional regulator  33.22 
 
 		 298 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6082  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 329 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0909  LysR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6398  LysR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0800  transcriptional regulator, LysR family  30.64 
 
 		 295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1431  LysR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53118  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3624  transcriptional regulator, LysR family  32.68 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2272  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565879  normal  0.046421 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3319  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14280  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.560719  normal  0.445591 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2973  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2861  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.147603  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2952  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00119284  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5808  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0381  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2338  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152044  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01684  DNA-binding transcriptional activator GcvA  30.13 
 
 		 313 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0214  DNA-binding transcriptional activator GcvA  30.23 
 
 		 334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1699  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00239277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5146  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.981039 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0348  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.425258 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6304  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3737  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.79 
 
 		 312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4622  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 284 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2113  LysR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 296 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0181  DNA-binding transcriptional activator GcvA  41.72 
 
 		 320 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4215  DNA-binding transcriptional activator GcvA  30.23 
 
 		 322 aa  118  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0325  DNA-binding transcriptional activator GcvA  41.72 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0244  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4735  transcriptional regulator  30.98 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4145  LysR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.323905 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3451  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.353033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4301  transcriptional regulator, LysR family  30.21 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0418  DNA-binding transcriptional activator GcvA  30.23 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171121  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4611  LysR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1691  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.279189  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0039  transcriptional regulator TrpI  34.63 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2385  transcriptional regulator, LysR family  34.11 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.297689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2483  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 287 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3540  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6038  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 330 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.904291  normal  0.627469 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3327  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0906  transcriptional regulator, LysR family  30.27 
 
 		 298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150508 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2946  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2176  LysR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 328 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2329  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 288 aa  115  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0927  DNA-binding transcriptional activator GcvA  30.89 
 
 		 307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00141405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>