More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1211 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1211  Sec-independent protein translocase TatC  100 
 
 
299 aa  596  1e-169  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1345  sec-independent protein translocase  60.46 
 
 
346 aa  354  1e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.634552  normal  0.127965 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1795  Sec-independent protein translocase TatC  62.72 
 
 
296 aa  348  8e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0386851  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0909  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  59.11 
 
 
280 aa  310  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12711  normal  0.120321 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1981  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  53.29 
 
 
287 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.437038  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2541  twin-arginine translocation system protein, TatC  53.07 
 
 
289 aa  287  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1201  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  53.07 
 
 
289 aa  287  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0527172 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.93 
 
 
268 aa  234  9e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1804  Sec-independent protein translocase TatC  45.76 
 
 
288 aa  217  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226534  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2343  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.69 
 
 
274 aa  216  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0131452  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1771  Sec-independent protein translocase TatC  43.12 
 
 
323 aa  214  9e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3029  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.85 
 
 
272 aa  211  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.244306  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4405  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.54 
 
 
269 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.632551  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0884  Sec-independent protein translocase protein TatC  44.57 
 
 
274 aa  211  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0875  twin arginine-targeting protein translocase TatC  44.57 
 
 
274 aa  211  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.965079  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  45.17 
 
 
254 aa  208  7e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.114268  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1489  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.18 
 
 
275 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299654  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2666  SEC-independent protein translocase protein  40 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341088  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1687  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.09 
 
 
275 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1166  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.48 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1617  Sec-independent protein translocase TatC  43.85 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.050313  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2703  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.3 
 
 
263 aa  191  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0587  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.41 
 
 
262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.851675 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3592  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.07 
 
 
266 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2185  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.66 
 
 
264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248674  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3401  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.71 
 
 
266 aa  182  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3710  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.71 
 
 
266 aa  182  6e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.365386  normal  0.172298 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0470  twin-arginine translocating C- subunit  40.08 
 
 
250 aa  182  8.000000000000001e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.018127  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1777  sec-independent periplasmic protein translocase  39.26 
 
 
269 aa  181  9.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0307477  decreased coverage  0.00398359 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2762  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.7 
 
 
266 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0340743  normal  0.092649 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0560  Sec-independent protein translocase protein TatC  40.23 
 
 
249 aa  181  2e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0570842  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0452  MttB family protein  40.23 
 
 
253 aa  179  4.999999999999999e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2487  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.73 
 
 
263 aa  178  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2743  Sec-independent protein translocase TatC  40.75 
 
 
272 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.225218  normal  0.269843 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2788  Sec-independent protein translocase TatC  38.65 
 
 
267 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23913  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1790  Sec-independent protein translocase TatC  38.2 
 
 
282 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804208  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3117  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.57 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.443277  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4415  putative Sec-independent protein translocase protein TatC  37.22 
 
 
271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.941523 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2608  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37 
 
 
263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.31 
 
 
259 aa  172  5e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1145  Sec-independent protein translocase TatC  39.5 
 
 
269 aa  172  7.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0127  Sec-independent protein translocase TatC  37.55 
 
 
263 aa  167  2.9999999999999998e-40  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.32 
 
 
468 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38 
 
 
257 aa  166  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3187  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.83 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.600412  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2515  Sec-independent protein translocase TatC  39.02 
 
 
271 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106541  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1096  Sec-independent protein translocase TatC  40 
 
 
279 aa  163  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1907  Sec-independent protein translocase TatC  38.04 
 
 
271 aa  163  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775947  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.69 
 
 
264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1453  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.04 
 
 
253 aa  162  6e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.381621  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.41 
 
 
324 aa  157  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  35.16 
 
 
251 aa  154  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3928  Sec-independent protein translocase TatC  40 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4215  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.6 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2494  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.04 
 
 
252 aa  153  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2610  Sec-independent protein translocase TatC  35.14 
 
 
262 aa  152  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  34.77 
 
 
241 aa  152  7e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0692  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.11 
 
 
257 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.299574  normal  0.13691 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1952  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.68 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1468  Sec-independent protein translocase TatC  33.71 
 
 
368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0443024  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  32.85 
 
 
269 aa  146  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3422  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.63 
 
 
260 aa  145  8.000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1575  twin arginine-targeting protein translocase TatC  33.33 
 
 
247 aa  143  3e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3050  Sec-independent protein translocase TatC  33.6 
 
 
268 aa  142  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2659  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.6 
 
 
268 aa  142  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0318  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.21 
 
 
258 aa  142  6e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3226  hypothetical protein  31.88 
 
 
257 aa  142  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.849662  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0253  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.46 
 
 
256 aa  142  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.3231 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  34.22 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.22 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  34.22 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  34.22 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  34.22 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  32.48 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  34.22 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0260  Sec-independent protein translocase TatC  33.46 
 
 
244 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0872197  hitchhiker  0.00458614 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0456  Sec-independent protein translocase TatC  31.39 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  34.22 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  34.22 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  34.22 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3758  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  32.57 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428108  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3043  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  31.87 
 
 
252 aa  140  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3940  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  32.72 
 
 
258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0276  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  32.72 
 
 
258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4204  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  32.96 
 
 
249 aa  139  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3797  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.18 
 
 
253 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3636  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  32.35 
 
 
258 aa  137  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2958  Sec-independent protein translocase TatC  32.73 
 
 
263 aa  138  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.666331  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3987  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.02 
 
 
249 aa  137  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0400  Sec-independent protein translocase TatC  35.86 
 
 
249 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  31.9 
 
 
267 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0663  Sec-independent protein secretion pathway component TatC  33.08 
 
 
247 aa  137  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00562  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  31.45 
 
 
251 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4051  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.46 
 
 
250 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1119  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.17 
 
 
241 aa  137  2e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45480  twin arginine-targeting protein translocase  34.7 
 
 
265 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3556  Sec-independent protein translocase TatC  32.96 
 
 
249 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3910  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.09 
 
 
255 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  31.6 
 
 
266 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2002  Sec-independent protein translocase TatC  31.94 
 
 
278 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.4915  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>