114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1014 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1014  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  234  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.250849  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0699  hypothetical protein  64.04 
 
 
126 aa  152  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0928683  normal  0.0143499 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1261  hypothetical protein  61.47 
 
 
124 aa  133  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39512  predicted protein  36.61 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0377472 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0454  protein of unknown function UPF0029  34.51 
 
 
119 aa  59.7  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01590  regulation of amino acid metabolism-related protein, putative  50 
 
 
450 aa  58.9  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0433818  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48866  predicted protein  33.33 
 
 
327 aa  58.9  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  36.52 
 
 
208 aa  58.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  40 
 
 
214 aa  54.7  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  37.86 
 
 
208 aa  54.3  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1849  protein of unknown function UPF0029  40.3 
 
 
206 aa  53.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1211  protein of unknown function UPF0029  36.36 
 
 
212 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  42.42 
 
 
216 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0586  hypothetical protein  38.46 
 
 
125 aa  51.2  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.101078  decreased coverage  0.000251226 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  44.12 
 
 
212 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  40.96 
 
 
211 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  31.82 
 
 
206 aa  50.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2179  protein of unknown function UPF0029  37.62 
 
 
204 aa  50.8  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.509167  normal  0.553697 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  40 
 
 
213 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  30.1 
 
 
206 aa  50.1  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  44.12 
 
 
211 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  44.12 
 
 
211 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  44.12 
 
 
211 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  44.12 
 
 
211 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  44.12 
 
 
211 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  42.86 
 
 
203 aa  49.7  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  44.12 
 
 
211 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1450  hypothetical protein  38.27 
 
 
198 aa  50.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60871  predicted protein  45.83 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  44.12 
 
 
211 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  44.12 
 
 
211 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2223  protein of unknown function UPF0029  36.17 
 
 
200 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238524  normal  0.0468847 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  34.02 
 
 
203 aa  50.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03580  expressed protein  37.5 
 
 
309 aa  48.9  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.805406  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1989  protein of unknown function UPF0029  44.62 
 
 
212 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  40.54 
 
 
211 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  34.29 
 
 
195 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0770  hypothetical protein  33.71 
 
 
197 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl056  putative proline dipeptidase  31.18 
 
 
232 aa  48.5  0.00003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0682  hypothetical protein  33.71 
 
 
193 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000348018  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  41.54 
 
 
205 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1413  hypothetical protein  37.84 
 
 
205 aa  48.5  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.533633  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0674  hypothetical protein  33.71 
 
 
197 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1716  hypothetical protein  34.52 
 
 
206 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  39.24 
 
 
219 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  39.39 
 
 
207 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  44.12 
 
 
211 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01194  thymidylate synthase  39.06 
 
 
212 aa  47.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.43796  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0638  hypothetical protein  35.96 
 
 
194 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134379 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  38.37 
 
 
209 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  37.93 
 
 
204 aa  47  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0593  hypothetical protein  35.96 
 
 
194 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.195431  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  36.76 
 
 
198 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0633  hypothetical protein  35.96 
 
 
194 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000102941  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0314  hypothetical protein  34.41 
 
 
205 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.55405 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0903  protein of unknown function UPF0029  34.07 
 
 
213 aa  46.6  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.30398 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1608  protein of unknown function UPF0029  42.37 
 
 
201 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0874  hypothetical protein  45.1 
 
 
229 aa  45.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  35.11 
 
 
219 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  35.16 
 
 
209 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3700  hypothetical protein  45.61 
 
 
194 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0820  hypothetical protein  45.1 
 
 
229 aa  45.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1598  hypothetical protein  33.33 
 
 
205 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000468439  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4570  hypothetical protein  35.96 
 
 
194 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000582787  normal  0.0106541 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1554  protein of unknown function UPF0029  35.38 
 
 
211 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  38.2 
 
 
210 aa  45.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2729  hypothetical protein  33.33 
 
 
206 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  32.63 
 
 
211 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0004  protein of unknown function UPF0029  33.33 
 
 
210 aa  45.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  33.33 
 
 
213 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  35.29 
 
 
198 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  32.26 
 
 
210 aa  44.7  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1444  hypothetical protein  43.4 
 
 
216 aa  44.7  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1121  hypothetical protein  46.67 
 
 
192 aa  44.7  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.490437  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2969  hypothetical protein  39.13 
 
 
200 aa  44.7  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  42.65 
 
 
211 aa  44.7  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37283  predicted protein  41.43 
 
 
239 aa  44.3  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0118938  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1009  hypothetical protein  46.67 
 
 
191 aa  44.7  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0286427  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3312  hypothetical protein  45.1 
 
 
209 aa  44.3  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1690  hypothetical protein  35.37 
 
 
172 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.296344  normal  0.209957 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  28.57 
 
 
205 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2485  hypothetical protein  36.36 
 
 
122 aa  43.9  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0533  hypothetical protein  34.41 
 
 
205 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00814053  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  34.41 
 
 
221 aa  43.9  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0383  hypothetical protein  40.58 
 
 
208 aa  43.9  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.46169  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4327  hypothetical protein  38.71 
 
 
199 aa  43.9  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  32.38 
 
 
198 aa  43.5  0.0009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  41.18 
 
 
211 aa  43.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  43.86 
 
 
225 aa  42.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  33.82 
 
 
198 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1820  hypothetical protein  40.85 
 
 
198 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0596118  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  34.04 
 
 
274 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0046  hypothetical protein  29.47 
 
 
191 aa  42.4  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  31.62 
 
 
194 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0111  protein of unknown function UPF0029  32.67 
 
 
216 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02100  hypothetical protein  41.38 
 
 
196 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  34.44 
 
 
290 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  31.62 
 
 
239 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5286  protein of unknown function UPF0029  32.5 
 
 
196 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  30.17 
 
 
213 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>