More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0426 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0426  GMP synthase subunit B  100 
 
 
305 aa  610  9.999999999999999e-175  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628115  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1394  GMP synthase subunit B  90.82 
 
 
305 aa  555  1e-157  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.216363 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2593  GMP synthase subunit B  83.93 
 
 
305 aa  524  1e-148  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2718  GMP synthase, large subunit  87.87 
 
 
305 aa  515  1.0000000000000001e-145  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0761  GMP synthase, large subunit  85.57 
 
 
305 aa  512  1e-144  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0058  GMP synthase subunit B  67.97 
 
 
304 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1178  GMP synthase subunit B  67.32 
 
 
305 aa  412  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0226  GMP synthase subunit B  66.78 
 
 
302 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.612389  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0069  GMP synthase subunit B  64.71 
 
 
305 aa  386  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2527  GMP synthase subunit B  62.75 
 
 
305 aa  384  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1900  GMP synthase subunit B  63.73 
 
 
305 aa  384  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2139  GMP synthase subunit B  63.07 
 
 
305 aa  382  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0027  GMP synthase subunit B  57.37 
 
 
310 aa  324  1e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0586295  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0173  GMP synthase subunit B  56.41 
 
 
310 aa  323  2e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.768744  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1761  GMP synthase subunit B  57.37 
 
 
310 aa  318  5e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247758  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0142  GMP synthase subunit B  57.69 
 
 
310 aa  318  9e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal  0.0356304 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0702  GMP synthase subunit B  57.05 
 
 
310 aa  317  2e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28782  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  53.53 
 
 
511 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0460  GMP synthase, large subunit  53.67 
 
 
517 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.797387  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  51.24 
 
 
575 aa  302  4.0000000000000003e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0486  GMP synthase, large subunit  52.22 
 
 
312 aa  301  7.000000000000001e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  50.64 
 
 
511 aa  301  1e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  50.64 
 
 
511 aa  299  5e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  50.8 
 
 
510 aa  296  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  49.38 
 
 
528 aa  296  3e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  50.79 
 
 
516 aa  296  3e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  51.43 
 
 
512 aa  295  4e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00451  GMP synthase  49.69 
 
 
528 aa  296  4e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  49.07 
 
 
528 aa  295  5e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  48.76 
 
 
528 aa  295  6e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00371  GMP synthase  49.38 
 
 
548 aa  295  6e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.280363  normal  0.275334 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  49.68 
 
 
510 aa  294  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  49.07 
 
 
537 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  49.07 
 
 
542 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00351  GMP synthase  48.75 
 
 
528 aa  292  5e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00361  GMP synthase  48.45 
 
 
528 aa  292  5e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819005  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  51.9 
 
 
509 aa  292  6e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00361  GMP synthase  48.45 
 
 
528 aa  291  7e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0422  GMP synthase  49.37 
 
 
516 aa  291  8e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  50 
 
 
513 aa  291  1e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  48.14 
 
 
528 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04770  GMP synthase  51.95 
 
 
514 aa  291  1e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  50.32 
 
 
510 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1506  GMP synthase  49.69 
 
 
523 aa  290  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2551  GMP synthase, large subunit  50.62 
 
 
533 aa  290  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1363  GMP synthase  48.44 
 
 
528 aa  290  3e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4445  GMP synthase, large subunit  52.08 
 
 
520 aa  290  3e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  50.48 
 
 
507 aa  290  3e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6529  GMP synthase  51.3 
 
 
519 aa  289  5.0000000000000004e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413067  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  48.41 
 
 
517 aa  288  5.0000000000000004e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  48.44 
 
 
540 aa  288  6e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1096  GMP synthase large subunit  49.84 
 
 
516 aa  288  6e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602354  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1001  GMP synthase  51.28 
 
 
501 aa  288  6e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1105  GMP synthase  51.28 
 
 
501 aa  288  6e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  50.16 
 
 
513 aa  288  9e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  47.52 
 
 
575 aa  287  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0629  GMP synthase large subunit  52.12 
 
 
517 aa  288  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.522683 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  49.36 
 
 
516 aa  287  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  50 
 
 
510 aa  286  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  49.04 
 
 
516 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  47.83 
 
 
542 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  47.83 
 
 
542 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  50.16 
 
 
534 aa  286  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0702  GMP synthase  47.38 
 
 
520 aa  286  4e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0123  GMP synthase  46.63 
 
 
526 aa  285  5e-76  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1516  GMP synthase  50 
 
 
522 aa  285  5e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.464629 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  50 
 
 
527 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  50.16 
 
 
556 aa  285  5.999999999999999e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07680  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  49.69 
 
 
527 aa  285  8e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130273  normal  0.713681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4006  GMP synthase, large subunit  50.49 
 
 
526 aa  285  9e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13431  GMP synthase  50.81 
 
 
525 aa  285  9e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.774143 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  49.84 
 
 
528 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  49.04 
 
 
510 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3038  GMP synthase, large subunit  49.38 
 
 
515 aa  284  1.0000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60036  hitchhiker  0.00129396 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0749  GMP synthase  50 
 
 
547 aa  284  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  49.68 
 
 
509 aa  284  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  47.13 
 
 
517 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0705  GMP synthase, large subunit  50.48 
 
 
524 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  49.68 
 
 
509 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  48.89 
 
 
512 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0550  GMP synthase  51.62 
 
 
540 aa  283  3.0000000000000004e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  49.05 
 
 
514 aa  282  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  49.05 
 
 
514 aa  282  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  50.48 
 
 
506 aa  282  5.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  47.96 
 
 
522 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0645  GMP synthase, large subunit  46.03 
 
 
507 aa  281  7.000000000000001e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000665212  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2143  GMP synthase  50.47 
 
 
535 aa  281  8.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188131  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  47.78 
 
 
512 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  50.32 
 
 
531 aa  281  9e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4903  GMP synthase  49.36 
 
 
522 aa  281  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.137023  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28370  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  49.21 
 
 
526 aa  281  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  49.68 
 
 
518 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  47.13 
 
 
511 aa  281  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16720  GMP synthase, glutamine-hydrolyzing, C-terminal domain or B subunit  49.51 
 
 
327 aa  280  2e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.48578 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1250  GMP synthase, large subunit  48.6 
 
 
523 aa  280  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026459  normal  0.348745 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  50.32 
 
 
526 aa  280  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3833  GMP synthase  48.75 
 
 
517 aa  280  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.587274  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  47.77 
 
 
508 aa  280  2e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  47.15 
 
 
515 aa  280  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0634  GMP synthase  50.32 
 
 
537 aa  279  3e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.324774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>