More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0201 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  100 
 
 		 492 aa  956    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1541  Na+/solute symporter  63.62 
 
 		 524 aa  594  1e-168  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3259  Na+/solute symporter  68.28 
 
 		 494 aa  583  1.0000000000000001e-165  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1232  Na+/solute symporter  69.41 
 
 		 494 aa  578  1e-164  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2133  Na+/solute symporter  64.34 
 
 		 494 aa  520  1e-146  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.829597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2845  Na+/solute symporter  36.06 
 
 		 474 aa  249  9e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1525  Na+/solute symporter  36.2 
 
 		 479 aa  227  4e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  30.65 
 
 		 507 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0238  Na+/solute symporter  32.17 
 
 		 489 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.758968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  30.74 
 
 		 491 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  25.57 
 
 		 482 aa  149  9e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  28.6 
 
 		 503 aa  147  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  28.06 
 
 		 487 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  28.18 
 
 		 483 aa  140  7e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  28.6 
 
 		 483 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  28.6 
 
 		 483 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.433126 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  28.6 
 
 		 483 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  28.6 
 
 		 483 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  29.52 
 
 		 497 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3742  sodium/panthothenate symporter  28.6 
 
 		 483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.133198 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  27.68 
 
 		 494 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3255  sodium/panthothenate symporter  28.34 
 
 		 477 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.344037  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  29.5 
 
 		 484 aa  134  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  29.5 
 
 		 484 aa  134  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  29.5 
 
 		 484 aa  134  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3567  sodium/panthothenate symporter  29.13 
 
 		 477 aa  133  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3346  sodium/panthothenate symporter  28.9 
 
 		 479 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000197319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3607  sodium/panthothenate symporter  28.9 
 
 		 479 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.258245  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3311  sodium/panthothenate symporter  28.9 
 
 		 479 aa  133  9e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3560  sodium/panthothenate symporter  28.9 
 
 		 479 aa  133  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000874922 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  28.14 
 
 		 518 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3261  sodium/panthothenate symporter  28.9 
 
 		 479 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0182263  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3570  sodium/panthothenate symporter  28.9 
 
 		 477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3660  sodium/panthothenate symporter  28.34 
 
 		 477 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  28.76 
 
 		 481 aa  130  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1657  sodium/panthothenate symporter  28.34 
 
 		 477 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343419 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  27.99 
 
 		 483 aa  130  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  27.99 
 
 		 483 aa  130  8.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  27.99 
 
 		 483 aa  130  8.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  27.99 
 
 		 483 aa  130  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  27.99 
 
 		 483 aa  129  8.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  27.99 
 
 		 483 aa  130  8.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  27.99 
 
 		 483 aa  130  8.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  27.99 
 
 		 483 aa  130  8.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  27.05 
 
 		 483 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  27.66 
 
 		 483 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  27.33 
 
 		 495 aa  128  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2953  Na+/solute symporter  24.53 
 
 		 486 aa  126  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2874  sodium/panthothenate symporter  29.55 
 
 		 495 aa  126  7e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  28.31 
 
 		 492 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  26.86 
 
 		 483 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  28.3 
 
 		 510 aa  125  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2227  sodium/panthothenate symporter  27.19 
 
 		 477 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0585956  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5313  Na+/solute symporter  26.76 
 
 		 490 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0567  sodium/panthothenate symporter  27.71 
 
 		 480 aa  121  3e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.868181  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0036  Na+ symporter  28.45 
 
 		 537 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  28.83 
 
 		 498 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  27.08 
 
 		 500 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  28.11 
 
 		 493 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  27.65 
 
 		 483 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  26.61 
 
 		 493 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  27.47 
 
 		 513 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0244  sodium/panthothenate symporter  27.94 
 
 		 483 aa  119  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0240  sodium/panthothenate symporter  27.94 
 
 		 483 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0817  proline permease  28.82 
 
 		 498 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2476  Na+/solute symporter  24.52 
 
 		 492 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  26.31 
 
 		 492 aa  117  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11200  sodium/panthothenate symporter  27.25 
 
 		 540 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.356279 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1072  Na+/solute symporter  25.83 
 
 		 527 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0387059  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  26.89 
 
 		 492 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  26.89 
 
 		 492 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4936  Na+/solute symporter  25.71 
 
 		 486 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0902202  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  26.89 
 
 		 492 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  26.89 
 
 		 492 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  29.49 
 
 		 482 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  26.69 
 
 		 492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1295  SSS family Na(+)/monocarboxylate symporter  25.86 
 
 		 490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0157462  normal  0.364511 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  26.69 
 
 		 492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  30.5 
 
 		 496 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  29.02 
 
 		 497 aa  115  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  25.93 
 
 		 492 aa  114  3e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  27.98 
 
 		 488 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  28.77 
 
 		 499 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3138  Na+/solute symporter  25.45 
 
 		 492 aa  114  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2389  Na+/solute symporter  25.15 
 
 		 492 aa  114  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0742  sodium/solute symporter family protein  26.25 
 
 		 490 aa  113  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  27.38 
 
 		 492 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  28.92 
 
 		 492 aa  113  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  27.68 
 
 		 484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0596  Na+ symporter  25.25 
 
 		 490 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0623  Na+/solute symporter  27.74 
 
 		 490 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0674  sodium/solute symporter family protein  28.21 
 
 		 490 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0708  sodium/solute symporter family protein  28.21 
 
 		 490 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0767  Na+ symporter  24.4 
 
 		 492 aa  111  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  26.69 
 
 		 492 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  27.52 
 
 		 483 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  28.51 
 
 		 483 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  28.12 
 
 		 486 aa  110  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  28.51 
 
 		 483 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  28.51 
 
 		 483 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>