47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0160 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0160  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
471 aa  937    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0726185  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  26.64 
 
 
431 aa  91.7  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  27.76 
 
 
450 aa  76.6  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  25.05 
 
 
463 aa  70.1  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  27.62 
 
 
382 aa  63.5  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  27.45 
 
 
901 aa  63.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  27.78 
 
 
365 aa  60.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  28.93 
 
 
383 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1740  Pyrrolo-quinoline quinone  26.03 
 
 
451 aa  55.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1327  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  26.86 
 
 
423 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  26 
 
 
1682 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2693  Pyrrolo-quinoline quinone  29.5 
 
 
451 aa  54.7  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  24.86 
 
 
432 aa  54.3  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  23 
 
 
423 aa  54.3  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  24.58 
 
 
387 aa  53.5  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.47 
 
 
392 aa  53.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1270  Pyrrolo-quinoline quinone  27.61 
 
 
426 aa  52.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.48567  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  24.66 
 
 
795 aa  51.2  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3240  Pyrrolo-quinoline quinone  24.69 
 
 
425 aa  51.2  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.613624  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  26.1 
 
 
415 aa  50.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  28.5 
 
 
963 aa  50.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3493  Pyrrolo-quinoline quinone  26.49 
 
 
461 aa  50.4  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.546086 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  26.49 
 
 
402 aa  50.4  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.76 
 
 
386 aa  50.1  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  24.35 
 
 
324 aa  50.1  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3619  Pyrrolo-quinoline quinone  29.45 
 
 
581 aa  49.7  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  24.56 
 
 
352 aa  48.9  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  23.26 
 
 
809 aa  48.5  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1796  outer membrane protein  24.42 
 
 
497 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000580169  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  26.25 
 
 
457 aa  47.4  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  22.68 
 
 
322 aa  47  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2069  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  25 
 
 
407 aa  46.6  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.213316  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1500  Pyrrolo-quinoline quinone  24.8 
 
 
407 aa  46.6  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0717216  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5302  Pyrrolo-quinoline quinone  26.9 
 
 
721 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178096  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  25.34 
 
 
439 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  24.87 
 
 
1328 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1209  WD40-like protein repeat-like protein  32.67 
 
 
446 aa  45.8  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.415141  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  25 
 
 
1241 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  23.5 
 
 
445 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  29.02 
 
 
1454 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  21.51 
 
 
445 aa  44.7  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1817  Pyrrolo-quinoline quinone  25.48 
 
 
400 aa  44.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.216395  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.57 
 
 
1383 aa  44.3  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  25.82 
 
 
546 aa  44.3  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  28.22 
 
 
475 aa  43.9  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3735  cell surface protein  22.6 
 
 
430 aa  43.5  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271044  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1656  PQQ repeat-containing protein  24.73 
 
 
363 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>