14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3240 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3240  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
425 aa  852    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.613624  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  26.42 
 
 
463 aa  76.6  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  23.57 
 
 
382 aa  67.4  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  24.37 
 
 
431 aa  59.7  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1270  Pyrrolo-quinoline quinone  27.38 
 
 
426 aa  59.7  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.48567  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2069  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  31.62 
 
 
407 aa  57  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.213316  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4195  Pyrrolo-quinoline quinone  24.27 
 
 
404 aa  56.6  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1009  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  28.18 
 
 
438 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0160  Pyrrolo-quinoline quinone  24.94 
 
 
471 aa  51.6  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0726185  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  26.42 
 
 
450 aa  52.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  23.51 
 
 
415 aa  51.2  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0582  Pyrrolo-quinoline quinone  27.66 
 
 
400 aa  48.5  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.812129  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  25.71 
 
 
901 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  30 
 
 
352 aa  43.9  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>