35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4434 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013745  Htur_4434  UspA domain protein  100 
 
 
154 aa  310  3.9999999999999997e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0155687  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3893  UspA domain protein  50 
 
 
161 aa  161  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4469  hypothetical protein  49.35 
 
 
154 aa  160  8.000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155394  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2441  UspA domain protein  37.01 
 
 
152 aa  105  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186084  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0044  UspA domain protein  37.42 
 
 
160 aa  95.1  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.412949  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1174  UpsA domain-containing protein  39.74 
 
 
153 aa  92.8  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.514178  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4670  hypothetical protein  32.45 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0832  UspA domain protein  39.74 
 
 
146 aa  79.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  45.45 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  48.21 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  50 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  45.45 
 
 
133 aa  53.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  43.64 
 
 
173 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  30.6 
 
 
161 aa  51.6  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3934  UspA domain protein  45.9 
 
 
144 aa  51.2  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  43.86 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  40.68 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  42.86 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  42.31 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  47.06 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  42.31 
 
 
162 aa  47.8  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  46.15 
 
 
146 aa  47.4  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  29.23 
 
 
150 aa  47  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  40.62 
 
 
154 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  41.27 
 
 
130 aa  45.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2624  UspA domain protein  39.74 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  35.19 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  48.98 
 
 
221 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  45.65 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  46.15 
 
 
143 aa  43.9  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  30.48 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  40.82 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  41.67 
 
 
131 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  26.97 
 
 
133 aa  42  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1570  UspA domain protein  46.94 
 
 
134 aa  42.4  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>