More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4141 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  100 
 
 
366 aa  740    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0716  glycine cleavage system T protein  56.4 
 
 
365 aa  407  1.0000000000000001e-112  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2054  glycine cleavage system T protein  54.26 
 
 
374 aa  394  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1892  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  55.77 
 
 
363 aa  388  1e-107  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1240  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  53.59 
 
 
390 aa  387  1e-106  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.199307 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0469  glycine cleavage system T protein  41.46 
 
 
371 aa  294  2e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  41.87 
 
 
365 aa  293  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.94 
 
 
360 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  40.22 
 
 
364 aa  288  9e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.54 
 
 
360 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.38 
 
 
360 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.01 
 
 
364 aa  286  5e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.11 
 
 
360 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.41 
 
 
364 aa  278  7e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  40.31 
 
 
389 aa  275  6e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.45 
 
 
363 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  40.67 
 
 
371 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.33 
 
 
368 aa  272  6e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  42.31 
 
 
366 aa  271  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.55 
 
 
364 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.87 
 
 
366 aa  270  4e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.14 
 
 
366 aa  269  5e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.14 
 
 
366 aa  269  5e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.14 
 
 
366 aa  268  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.45 
 
 
363 aa  268  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.14 
 
 
366 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.45 
 
 
363 aa  268  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.87 
 
 
366 aa  267  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.32 
 
 
372 aa  266  2.9999999999999995e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.87 
 
 
366 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.87 
 
 
366 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.87 
 
 
366 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.87 
 
 
366 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  40.27 
 
 
375 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02950  aminomethyltransferase  42.41 
 
 
388 aa  265  1e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  42.31 
 
 
371 aa  265  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  41.21 
 
 
370 aa  264  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.06 
 
 
363 aa  263  3e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.76 
 
 
364 aa  263  3e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.63 
 
 
360 aa  263  4e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  39.89 
 
 
367 aa  262  6e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.25 
 
 
374 aa  262  6e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.19 
 
 
365 aa  262  6.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40 
 
 
359 aa  262  8e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.5 
 
 
381 aa  261  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.11 
 
 
360 aa  260  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  42.5 
 
 
372 aa  260  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  39.56 
 
 
357 aa  260  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  42.66 
 
 
367 aa  260  3e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.87 
 
 
366 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.32 
 
 
376 aa  259  6e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.76 
 
 
375 aa  258  9e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.74 
 
 
441 aa  257  2e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4451  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.43 
 
 
369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.75 
 
 
430 aa  253  3e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.48 
 
 
370 aa  253  5.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.74 
 
 
365 aa  253  5.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.75 
 
 
369 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.75 
 
 
369 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0094  glycine cleavage system T protein  40.43 
 
 
401 aa  252  7e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  36.91 
 
 
365 aa  251  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0599  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.04 
 
 
362 aa  250  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.611166 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  39.13 
 
 
364 aa  249  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0765  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.21 
 
 
385 aa  249  4e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.858386  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0537  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.46 
 
 
382 aa  249  6e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21611  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.1 
 
 
372 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.532359 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  41.5 
 
 
364 aa  246  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0882  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.58 
 
 
382 aa  246  4e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.83 
 
 
372 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  38.75 
 
 
369 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1559  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.88 
 
 
362 aa  245  6.999999999999999e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3205  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.4 
 
 
363 aa  245  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000683742  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4863  glycine cleavage system T protein  38.15 
 
 
378 aa  244  1.9999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  40.21 
 
 
375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  35.89 
 
 
360 aa  243  3e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.38 
 
 
403 aa  243  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.81 
 
 
380 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.28 
 
 
362 aa  243  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  39.57 
 
 
381 aa  243  5e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  39.78 
 
 
351 aa  242  7e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  39.57 
 
 
381 aa  240  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.39 
 
 
369 aa  239  4e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  40.17 
 
 
350 aa  239  4e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  37.78 
 
 
363 aa  239  5e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  37.43 
 
 
366 aa  239  5.999999999999999e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.51 
 
 
363 aa  238  1e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  36.09 
 
 
361 aa  238  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1647  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.47 
 
 
381 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1835  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.98 
 
 
369 aa  236  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  38.96 
 
 
369 aa  236  5.0000000000000005e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3548  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.69 
 
 
374 aa  236  6e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.033061 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0132  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.63 
 
 
360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1720  glycine cleavage system T protein  39.57 
 
 
365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.845128 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12380  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.73 
 
 
377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0676633  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0049  glycine cleavage system T protein  37.67 
 
 
366 aa  233  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.866309  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1190  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.14 
 
 
360 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  36.74 
 
 
360 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.5 
 
 
365 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0117  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.63 
 
 
360 aa  232  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18781  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.86 
 
 
370 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>