More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3785 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 		 258 aa  526  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  34.92 
 
 		 236 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  36.76 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  32.17 
 
 		 238 aa  116  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  29.92 
 
 		 243 aa  116  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  33.2 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  28.23 
 
 		 241 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  34.87 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  32.79 
 
 		 250 aa  102  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  28.98 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  29.15 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  29.6 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  31.47 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  31.05 
 
 		 243 aa  99.4  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  32.31 
 
 		 237 aa  99  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  31.08 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  30.48 
 
 		 248 aa  96.3  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  27.76 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  29.08 
 
 		 243 aa  94.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  29.3 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  32.28 
 
 		 250 aa  92.8  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  27.73 
 
 		 240 aa  92  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00200  conserved hypothetical protein  30.7 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.45844 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  27.86 
 
 		 232 aa  90.1  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  26.26 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0770  glutamine amidotransferase class I  31.67 
 
 		 231 aa  88.6  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  28.5 
 
 		 246 aa  88.6  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  26.84 
 
 		 243 aa  86.7  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  35.75 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0376  glutamine amidotransferase class-I  28.9 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2020  glutamine amidotransferase class-I  28.9 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  30.15 
 
 		 232 aa  81.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2203  hypothetical protein  31.16 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1509  glutamine amidotransferase class-I  29.81 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4674  amidotransferase, putative  31.25 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.623837 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  37.41 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2529  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  25.74 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.777754 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0888  glutamine amidotransferase class-I  28.88 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  31.18 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0696  glutamine amidotransferase class-I  31.39 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  31.22 
 
 		 238 aa  78.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2694  amidotransferase  31.75 
 
 		 233 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1396  glutamine amidotransferase class-I  29.67 
 
 		 238 aa  78.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  28.63 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  31.13 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1837  glutamine amidotransferase, class I  26.01 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0599314  normal  0.354168 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  30 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  27.84 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47463  Predicted glutamine synthetase glutamine amidotransferase  32.95 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.881138 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0865  glutamine amidotransferase class-I  27.59 
 
 		 225 aa  72  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0523  glutamine amidotransferase, class I  33.1 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.947174  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1856  glutamine amidotransferase  31.48 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.991157  decreased coverage  0.0021836 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  30.46 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  33.73 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0734  glutamine amidotransferase class-I  36.36 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0721  glutamine amidotransferase class-I  37.04 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.31334 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  31.97 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3848  glutamine amidotransferase class-I  35.62 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3566  amidotransferase  28.23 
 
 		 240 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42010  amidotransferase  28.71 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0692  glutamine amidotransferase class-I  34.64 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  0.956702 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1126  glutamine amidotransferase, class I  29 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19600  GMP synthase family protein  29.55 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  34 
 
 		 245 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  30.51 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  28.5 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  27.98 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1842  amidotransferase  24.88 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3519  glutamine amidotransferase class-I  35.4 
 
 		 236 aa  65.1  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.307649 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3627  glutamine amidotransferase class-I  32.28 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3868  amidotransferase  24.88 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160036 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  34.09 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7211  putative glutamine amidotransferase, class-I  34.75 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1451  amidotransferase  24.88 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1420  amidotransferase  24.88 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2606  glutamine amidotransferase class-I  30.68 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.672568  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3722  glutamine amidotransferase class-I  27.55 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.508189 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  27.45 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3263  glutamine amidotransferase  28.67 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4169  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  37.5 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2155  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  38.02 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64084  hitchhiker  0.0020762 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3462  anthranilate synthase, component II  38.1 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.772396  normal  0.100457 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1190  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  40.95 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00563763  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14740  glutamine amidotransferase  30.77 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.216669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  26.27 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  30 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1289  glutamine amidotransferase  24.75 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0579596  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1741  amidotransferase  25.37 
 
 		 240 aa  62  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2225  putative glutamine amidotransferase class-I  24.14 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0597  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  34.44 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1011  glutamine amidotransferase  28.47 
 
 		 260 aa  62  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3605  anthranilate synthase component II  35.24 
 
 		 208 aa  62  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.240756  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1695  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  31.39 
 
 		 203 aa  62  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0254  GMP synthase, small subunit  31.71 
 
 		 188 aa  61.6  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2063  hypothetical protein  25 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0215338  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  29.61 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2587  amidotransferase  27.8 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0493752 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2324  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  34.78 
 
 		 196 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>