More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2380 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  100 
 
 		 243 aa  471  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  51.57 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  51.33 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  54.63 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  48.94 
 
 		 235 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  50 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  51.13 
 
 		 240 aa  201  6e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  51.36 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  50.45 
 
 		 251 aa  198  7e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1515  cytidylate kinase  50.45 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2439  cytidylate kinase  50.45 
 
 		 251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  45.54 
 
 		 232 aa  196  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  50.45 
 
 		 232 aa  196  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  44.5 
 
 		 237 aa  195  6e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  48.82 
 
 		 226 aa  194  9e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  48.82 
 
 		 226 aa  194  9e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  45.09 
 
 		 230 aa  191  7e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  49.54 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  46.46 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  52.7 
 
 		 228 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.89 
 
 		 511 aa  187  9e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.89 
 
 		 511 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  49.09 
 
 		 222 aa  187  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  47.22 
 
 		 222 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  48.25 
 
 		 255 aa  186  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  44.49 
 
 		 227 aa  186  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  50.46 
 
 		 228 aa  185  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  50.46 
 
 		 228 aa  185  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  50.46 
 
 		 228 aa  185  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  45.41 
 
 		 229 aa  185  5e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  45.78 
 
 		 230 aa  185  6e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  48.37 
 
 		 232 aa  184  9e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  48.65 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  48.65 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  47.95 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  45.13 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  44.93 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000166074  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  48.1 
 
 		 227 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  48.4 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  45.21 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2403  cytidylate kinase  44.25 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  44.44 
 
 		 228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  46.88 
 
 		 221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  45.09 
 
 		 230 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  45.09 
 
 		 230 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  45.09 
 
 		 230 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000169082  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  45.09 
 
 		 230 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000105966  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  45.5 
 
 		 227 aa  181  7e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1735  cytidylate kinase  44.2 
 
 		 231 aa  181  7e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610181  decreased coverage  0.000087686 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2299  cytidylate kinase  44.84 
 
 		 230 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000399193  unclonable  0.0000000000955893 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  44.44 
 
 		 230 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  51.64 
 
 		 252 aa  181  9.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  44.5 
 
 		 224 aa  181  9.000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  45.25 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  45.25 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  45.25 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  45.25 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  45.25 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  45.25 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  45.25 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  44.84 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  45.25 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  45.25 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  43.78 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.68 
 
 		 527 aa  180  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  48.36 
 
 		 218 aa  180  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1026  cytidylate kinase  47.42 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000434199  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  46.64 
 
 		 229 aa  179  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  44.34 
 
 		 227 aa  179  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0930  cytidylate kinase  47.51 
 
 		 234 aa  178  5.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  47.51 
 
 		 230 aa  178  7e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06850  cytidylate kinase  51.13 
 
 		 223 aa  178  7e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.734775  normal  0.308288 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02861  cytidylate kinase  45.21 
 
 		 226 aa  178  8e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  44.8 
 
 		 227 aa  177  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0687941 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  44.8 
 
 		 227 aa  177  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  44.8 
 
 		 227 aa  177  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  44.8 
 
 		 227 aa  177  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0986  cytidylate kinase  44.8 
 
 		 227 aa  177  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  46.19 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0955  cytidylate kinase  49.76 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000242866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  42.48 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2310  cytidylate kinase  43.81 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000698578  hitchhiker  0.000000443143 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0564  cytidylate kinase  46.79 
 
 		 227 aa  176  4e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2124  cytidylate kinase  44.09 
 
 		 229 aa  175  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109139  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.61 
 
 		 483 aa  175  6e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  45.25 
 
 		 229 aa  175  7e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  46.36 
 
 		 225 aa  174  8e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  46.15 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  46.15 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1024  cytidylate kinase  50.25 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000194676  unclonable  0.0000000000298139 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0780  cytidylate kinase  47.73 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0405191  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0902  cytidylate kinase  50.25 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.210574  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  43.32 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  46.61 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1953  cytidylate kinase  44.39 
 
 		 230 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000156815  hitchhiker  0.0000548451 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.83 
 
 		 480 aa  172  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2827  cytidylate kinase  45.74 
 
 		 223 aa  172  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300632  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1734  cytidylate kinase  45.25 
 
 		 225 aa  172  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000603603  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  43.81 
 
 		 225 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>