39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1424 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1424  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 517 aa  1059    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0313  Extracellular ligand-binding receptor  36.16 
 
 		 497 aa  250  5e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1154  extracellular ligand-binding receptor  23.93 
 
 		 449 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443442  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3970  Extracellular ligand-binding receptor  25.55 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1227  Extracellular ligand-binding receptor  23.79 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229602 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1418  extracellular ligand-binding receptor  25.89 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0603  Extracellular ligand-binding receptor  24.92 
 
 		 401 aa  62.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1861  periplasmic binding protein of ABC transporter for natural amino acids  25.91 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  26.4 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0926  extracellular ligand-binding receptor  36.04 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1977  periplasmic binding protein  23.44 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.343651  normal  0.981595 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1186  branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  24.94 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.62825  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1568  extracellular ligand-binding receptor  35.14 
 
 		 394 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93601  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2923  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  35.14 
 
 		 394 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1522  putative periplasmic ligand-binding protein  35.48 
 
 		 395 aa  53.5  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.371953 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1149  Extracellular ligand-binding receptor  24.47 
 
 		 442 aa  52.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1272  extracellular ligand-binding receptor  32.46 
 
 		 399 aa  52.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.570271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1959  extracellular ligand-binding receptor  25.53 
 
 		 418 aa  51.6  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2491  extracellular ligand-binding receptor  28.86 
 
 		 373 aa  52  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4899  Extracellular ligand-binding receptor  24.84 
 
 		 442 aa  51.2  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0661  Extracellular ligand-binding receptor  24.21 
 
 		 439 aa  50.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3932  extracellular ligand-binding receptor  33.59 
 
 		 394 aa  50.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2232  extracellular ligand-binding receptor  28.81 
 
 		 373 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2165  extracellular ligand-binding receptor  34.86 
 
 		 399 aa  48.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0398  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  25.42 
 
 		 391 aa  47.8  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000849541  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  25.95 
 
 		 419 aa  47.4  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  26.32 
 
 		 376 aa  47.4  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0165  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  27.98 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.503783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0295  extracellular ligand-binding receptor  26.95 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00215274  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0488  Legumain  22.44 
 
 		 726 aa  46.6  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2892  Extracellular ligand-binding receptor  22.73 
 
 		 439 aa  45.8  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29060  amino acid-binding protein  26.4 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.987763  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0174  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  30.36 
 
 		 449 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19527  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1976  Extracellular ligand-binding receptor  31.25 
 
 		 412 aa  45.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1582  branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.09 
 
 		 388 aa  45.1  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000809144  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0472  Extracellular ligand-binding receptor  26.01 
 
 		 373 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.538302  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50520  branched-chain amino acid transport protein BraC  24.06 
 
 		 373 aa  43.9  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592692 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1576  extracellular ligand-binding receptor  25.74 
 
 		 427 aa  43.9  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0597639  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  27.84 
 
 		 390 aa  43.5  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>