More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1996 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1996  NUDIX hydrolase  100 
 
 
352 aa  716    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.42027  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  36.56 
 
 
317 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  32.3 
 
 
318 aa  149  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  32.93 
 
 
321 aa  143  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  34.57 
 
 
322 aa  137  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  32.21 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  32.32 
 
 
314 aa  134  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  34.34 
 
 
313 aa  133  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  31.9 
 
 
302 aa  130  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  33.13 
 
 
320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  32.12 
 
 
316 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  32.12 
 
 
316 aa  126  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  32.52 
 
 
315 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  30.95 
 
 
314 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  31.04 
 
 
314 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  32.82 
 
 
320 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  31.8 
 
 
313 aa  123  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0592  hypothetical protein  32.48 
 
 
316 aa  122  7e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  30.95 
 
 
310 aa  122  8e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  30.46 
 
 
325 aa  122  9e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  33.03 
 
 
312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  32.92 
 
 
319 aa  119  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  31.07 
 
 
329 aa  116  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  32.43 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  31.52 
 
 
314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  32.01 
 
 
316 aa  112  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  30.4 
 
 
315 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  32.13 
 
 
314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  31.29 
 
 
315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  30.63 
 
 
314 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  31.29 
 
 
317 aa  110  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2246  thiamine monophosphate synthase  42.86 
 
 
194 aa  99.8  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0548714 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3677  thiamine monophosphate synthase  40.48 
 
 
194 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.62971  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4514  thiamine monophosphate synthase  40.48 
 
 
194 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3850  thiamine monophosphate synthase  40.48 
 
 
194 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3747  thiamine monophosphate synthase  40.48 
 
 
194 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.907624  normal  0.127935 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5573  thiamine monophosphate synthase  40.48 
 
 
194 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173749  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1618  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.04 
 
 
199 aa  89.4  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4895  thiamine monophosphate synthase  45.98 
 
 
194 aa  89  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166292 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0210  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  35.04 
 
 
212 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0218369  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE, putative  41.82 
 
 
196 aa  87  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0319  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  42.27 
 
 
209 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1664  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  42.27 
 
 
209 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2576  thiamine monophosphate synthase  42.27 
 
 
209 aa  86.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2440  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  42.27 
 
 
209 aa  86.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363141  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1467  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  42.27 
 
 
209 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0287  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  42.27 
 
 
196 aa  86.3  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0878  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  42.27 
 
 
196 aa  86.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0984  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase protein  32.7 
 
 
198 aa  79.7  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.462651 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1604  NUDIX hydrolase  24.38 
 
 
369 aa  78.6  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000210752  hitchhiker  0.0000224711 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  25.97 
 
 
329 aa  75.5  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.7 
 
 
131 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  25.97 
 
 
329 aa  75.5  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.7 
 
 
131 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00100  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase, marked preference for dGTP  35.61 
 
 
129 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.126012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3501  mutator MutT protein  35.61 
 
 
129 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00099  hypothetical protein  35.61 
 
 
129 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3558  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.61 
 
 
129 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.016637  hitchhiker  0.00136766 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0105  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.61 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000458525  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.14 
 
 
206 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0104  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.85 
 
 
132 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000574829  normal  0.261189 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0107  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.85 
 
 
132 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000992989  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.89 
 
 
131 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0349436  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0153  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.89 
 
 
131 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471922  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0154  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.89 
 
 
131 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000120622  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0101  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.85 
 
 
129 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708829  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1686  NUDIX hydrolase  25.34 
 
 
360 aa  70.1  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.873349  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0093  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000316081  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.92 
 
 
128 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  35.16 
 
 
127 aa  67.8  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.92 
 
 
128 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.92 
 
 
128 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1173  Thiamine-phosphate diphosphorylase  30.65 
 
 
185 aa  67.8  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0645  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.09 
 
 
130 aa  67.4  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.62648  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1507  NUDIX hydrolase  25.48 
 
 
360 aa  67  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 
150 aa  67.4  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4453  mutator mutT protein  35.2 
 
 
144 aa  67  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0347377  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  40.98 
 
 
141 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  31.78 
 
 
134 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  31.78 
 
 
134 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  35.71 
 
 
128 aa  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
147 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  40.16 
 
 
142 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.54 
 
 
131 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  hitchhiker  0.00538151 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0146  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.54 
 
 
131 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.38 
 
 
134 aa  64.3  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  30.89 
 
 
135 aa  62.8  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 
129 aa  62  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  39.36 
 
 
151 aa  62.4  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2824  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
153 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852185  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0991  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  34.11 
 
 
132 aa  62.4  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  31.94 
 
 
132 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  34.13 
 
 
129 aa  62  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 
334 aa  62.4  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0645  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.91 
 
 
216 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0358  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.84 
 
 
219 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.13 
 
 
134 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  22.34 
 
 
211 aa  61.2  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000752501  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0475  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 
152 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0500  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 
152 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.43555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>