More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0464 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0464  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 
481 aa  966    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3886  cardiolipin synthetase 2  39.41 
 
 
478 aa  330  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2710  cardiolipin synthetase 2  37.16 
 
 
489 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583578  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4302  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.75 
 
 
491 aa  293  6e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000415539  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3949  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.15 
 
 
472 aa  283  6.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03233  cardiolipin synthase  36.94 
 
 
472 aa  277  4e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08050  cardiolipin synthetase 2  35.77 
 
 
495 aa  271  2e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283071  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0548  cardiolipin synthase  36.65 
 
 
467 aa  271  2e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3636  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.05 
 
 
479 aa  269  8e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0483  phospholipase D/transphosphatidylase  36.44 
 
 
467 aa  268  1e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3849  cardiolipin synthetase 2  35.1 
 
 
491 aa  260  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.45957  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0305  cardiolipin synthetase  32.92 
 
 
483 aa  259  9e-68  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0281725  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2320  cardiolipin synthetase  34.06 
 
 
490 aa  254  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.254629  hitchhiker  0.00334531 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3316  cardiolipin synthetase  34.39 
 
 
492 aa  247  4e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1390  cardiolipin synthetase  33.4 
 
 
492 aa  246  9e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.853337  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  32.78 
 
 
484 aa  245  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1932  cardiolipin synthetase  34.12 
 
 
532 aa  244  3e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2009  normal  0.0149178 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0571  cardiolipin synthetase  32.91 
 
 
491 aa  243  7e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4114  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.58 
 
 
467 aa  239  6.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0831123 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2290  cardiolipin synthetase  34.17 
 
 
485 aa  238  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.189738  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003804  cardiolipin synthetase  32.49 
 
 
484 aa  238  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2063  cardiolipin synthetase  31.5 
 
 
486 aa  236  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2156  cardiolipin synthetase  31.5 
 
 
486 aa  236  5.0000000000000005e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430698  normal  0.0562881 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1953  cardiolipin synthetase  31.5 
 
 
486 aa  236  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.785263  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1588  cardiolipin synthetase  31.49 
 
 
486 aa  233  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1873  cardiolipin synthetase  31.49 
 
 
486 aa  233  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.25903  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1930  cardiolipin synthetase  31.49 
 
 
486 aa  233  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.608673  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1406  cardiolipin synthetase  31.49 
 
 
486 aa  233  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.202549  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1867  cardiolipin synthetase  31.49 
 
 
486 aa  233  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02693  cardiolipin synthetase  32.33 
 
 
484 aa  231  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2189  cardiolipin synthetase  31.04 
 
 
486 aa  231  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01223  cardiolipin synthetase  32.04 
 
 
486 aa  230  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.081482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2399  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.04 
 
 
486 aa  230  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0519529  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01233  hypothetical protein  32.04 
 
 
486 aa  230  5e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0613112  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2689  cardiolipin synthetase  30.91 
 
 
486 aa  230  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.087528  hitchhiker  0.00198607 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1397  cardiolipin synthetase  32.04 
 
 
486 aa  230  5e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.620611  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1358  cardiolipin synthetase  32.04 
 
 
486 aa  230  5e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000070923  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1891  cardiolipin synthetase  32.04 
 
 
486 aa  230  5e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0254745 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2379  cardiolipin synthetase  32.04 
 
 
486 aa  230  5e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173283  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0242  phospholipase D/transphosphatidylase  30.8 
 
 
471 aa  229  6e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.733383  normal  0.348434 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1735  cardiolipin synthetase  31.84 
 
 
486 aa  229  7e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0392497  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1991  cardiolipin synthetase  30.51 
 
 
486 aa  229  8e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1948  cardiolipin synthetase  32.43 
 
 
486 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2292  cardiolipin synthetase  30.51 
 
 
486 aa  229  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1418  cardiolipin synthetase  32.04 
 
 
486 aa  229  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.183618  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2373  phospholipase D/transphosphatidylase  34.29 
 
 
479 aa  228  2e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2295  cardiolipin synthetase  30.55 
 
 
486 aa  225  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1551  cardiolipin synthetase  29.59 
 
 
547 aa  223  4.9999999999999996e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000970599  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1275  cardiolipin synthetase  30.98 
 
 
484 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2049  cardiolipin synthetase 2  33.85 
 
 
479 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0781048  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.44 
 
 
474 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2240  cardiolipin synthetase  31.36 
 
 
485 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1732  cardiolipin synthetase  29.79 
 
 
555 aa  217  4e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000620411  normal  0.647101 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  30.75 
 
 
502 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1579  cardiolipin synthetase  33 
 
 
484 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.643479  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1113  phospholipase D/transphosphatidylase  32.68 
 
 
478 aa  211  2e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.2 
 
 
472 aa  210  4e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1986  phospholipase D/transphosphatidylase  30.95 
 
 
475 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.477384  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.45 
 
 
483 aa  204  3e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.48 
 
 
474 aa  204  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.26 
 
 
477 aa  203  5e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  29.53 
 
 
502 aa  203  6e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  31.73 
 
 
480 aa  202  8e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.76 
 
 
483 aa  202  8e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0531  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.65 
 
 
474 aa  202  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.74 
 
 
478 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  32.46 
 
 
477 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  32.03 
 
 
505 aa  202  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  32.03 
 
 
505 aa  202  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  30.43 
 
 
478 aa  201  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  33.18 
 
 
502 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  31.71 
 
 
490 aa  200  5e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.89 
 
 
485 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.69 
 
 
541 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  30.69 
 
 
480 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.79 
 
 
482 aa  195  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  31.46 
 
 
476 aa  195  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.94 
 
 
476 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  30.8 
 
 
476 aa  194  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  33.64 
 
 
474 aa  193  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  30.69 
 
 
485 aa  193  6e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0946  phospholipase D/transphosphatidylase  31.14 
 
 
481 aa  193  7e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  31.74 
 
 
479 aa  192  8e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0048  cardiolipin synthetase 2  30.69 
 
 
487 aa  192  1e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.23 
 
 
374 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  29.6 
 
 
481 aa  191  2e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  28.87 
 
 
490 aa  190  4e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  27.52 
 
 
509 aa  189  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2455  phospholipase D/transphosphatidylase  28.93 
 
 
463 aa  189  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.172954 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  27.58 
 
 
509 aa  188  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  27.72 
 
 
509 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4375  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.89 
 
 
464 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4398  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.89 
 
 
464 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  27.72 
 
 
509 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  27.72 
 
 
509 aa  187  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0190  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.2 
 
 
472 aa  187  4e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.340705  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  33.25 
 
 
482 aa  187  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  31.25 
 
 
477 aa  187  5e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  29.68 
 
 
470 aa  187  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4391  phospholipase D/transphosphatidylase  30.99 
 
 
481 aa  187  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0531581  normal  0.277107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>