140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1144 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1144  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 341 aa  653    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.158987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2097  protein of unknown function UPF0118  50.93 
 
 		 336 aa  281  1e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.987772  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1581  protein of unknown function UPF0118  46.93 
 
 		 341 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0769558 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3764  protein of unknown function UPF0118  41.88 
 
 		 376 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2612  protein of unknown function UPF0118  25.51 
 
 		 363 aa  96.3  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.751344  normal  0.787744 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0113  hypothetical protein  28.84 
 
 		 346 aa  92  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0968389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1366  hypothetical protein  28.88 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1711  hypothetical protein  26.76 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0751  hypothetical protein  26.29 
 
 		 336 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0191  hypothetical protein  26.24 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0245  hypothetical protein  26.37 
 
 		 336 aa  72.8  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  28 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  28.03 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  27.92 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1259  protein of unknown function UPF0118  23.81 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.324845  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0574  hypothetical protein  22.64 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.877456  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1671  hypothetical protein  27.4 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  28.74 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1639  hypothetical protein  24.38 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  26.53 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  25.87 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  26.09 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  28.02 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  27.41 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2465  protein of unknown function UPF0118  26.4 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  25.5 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2416  protein of unknown function UPF0118  28.46 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.25064  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0445  hypothetical protein  21.63 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000355219  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  25.5 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  24.79 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  26.36 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  26.79 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0262  hypothetical protein  21.89 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00766044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  31.2 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  25.22 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4237  protein of unknown function UPF0118  26.83 
 
 		 350 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  26.51 
 
 		 354 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  27.54 
 
 		 358 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  28.3 
 
 		 356 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  25.7 
 
 		 353 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  25.71 
 
 		 393 aa  53.9  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1563  hypothetical protein  32.19 
 
 		 398 aa  53.9  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  26.42 
 
 		 361 aa  53.5  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  27.23 
 
 		 346 aa  53.1  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  23.85 
 
 		 352 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  23.85 
 
 		 352 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  23.85 
 
 		 352 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  23.85 
 
 		 352 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  23.85 
 
 		 352 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  23.85 
 
 		 352 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0460  hypothetical protein  26.82 
 
 		 352 aa  52.8  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.353952  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0400  hypothetical protein  26.53 
 
 		 372 aa  52.8  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.413713  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  23.85 
 
 		 374 aa  52.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  24.45 
 
 		 356 aa  52.8  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  24.16 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  25.54 
 
 		 352 aa  52.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  28.51 
 
 		 373 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  25.6 
 
 		 349 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  24.71 
 
 		 363 aa  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  25.71 
 
 		 365 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  31.58 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  31.58 
 
 		 406 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  25.86 
 
 		 353 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  23.4 
 
 		 365 aa  50.4  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  31.25 
 
 		 363 aa  50.4  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  31.37 
 
 		 379 aa  50.4  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3672  hypothetical protein  28.9 
 
 		 396 aa  50.1  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00326083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  26.32 
 
 		 355 aa  49.7  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1658  putative inner membrane protein  34.78 
 
 		 364 aa  49.3  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3486  hypothetical protein  37.76 
 
 		 375 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1326  hypothetical protein  22.06 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0447  hypothetical protein  24.42 
 
 		 360 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3370  hypothetical protein  23.56 
 
 		 360 aa  49.3  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  27.98 
 
 		 361 aa  48.9  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3886  hypothetical protein  24.28 
 
 		 359 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4008  hypothetical protein  24.42 
 
 		 360 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3812  protein of unknown function UPF0118  24.24 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  26.93 
 
 		 355 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  27.22 
 
 		 362 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1738  putative inner membrane protein  34.41 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2597  putative inner membrane protein  34.41 
 
 		 365 aa  48.1  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1844  putative inner membrane protein  34.41 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  28.78 
 
 		 371 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  24.38 
 
 		 398 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  24.38 
 
 		 353 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  33.6 
 
 		 391 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  24.38 
 
 		 350 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0405  hypothetical protein  33.1 
 
 		 374 aa  47.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  31.09 
 
 		 371 aa  47  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3044  hypothetical protein  26.26 
 
 		 398 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  27.03 
 
 		 369 aa  47  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3181  hypothetical protein  32.31 
 
 		 419 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1921  acid membrane antigen A  26.32 
 
 		 348 aa  47  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  28.77 
 
 		 359 aa  46.6  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  22.52 
 
 		 394 aa  46.6  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  30.67 
 
 		 353 aa  46.6  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0691  hypothetical protein  25.75 
 
 		 377 aa  46.2  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.627447 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1690  putative inner membrane protein  38.75 
 
 		 370 aa  46.6  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2944  hypothetical protein  21.97 
 
 		 368 aa  46.2  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.81591  decreased coverage  0.00297728 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  26.79 
 
 		 353 aa  46.2  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>