44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2787 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_2787  hypothetical protein  100 
 
 		 624 aa  1283    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1658  hypothetical protein  32.23 
 
 		 604 aa  271  2.9999999999999997e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2277  hypothetical protein  31.95 
 
 		 653 aa  267  5e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0611  ATPase-like protein  33.17 
 
 		 618 aa  266  8e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1625  hypothetical protein  29.15 
 
 		 783 aa  256  6e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1979  Tubulin  32.27 
 
 		 625 aa  256  1.0000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0773401 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1379  hypothetical protein  31.09 
 
 		 604 aa  255  2.0000000000000002e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2149  ATPase  30.98 
 
 		 605 aa  249  1e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  23.34 
 
 		 500 aa  55.1  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5115  hypothetical protein  31.09 
 
 		 595 aa  53.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  22.7 
 
 		 599 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  33.33 
 
 		 544 aa  51.2  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1619  hypothetical protein  38.75 
 
 		 532 aa  51.2  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1440  hypothetical protein  26.67 
 
 		 539 aa  50.4  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.828058  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0074  hypothetical protein  37.5 
 
 		 495 aa  50.8  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0871233  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3041  protein of unknown function DUF87  30.25 
 
 		 744 aa  50.4  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  25.53 
 
 		 520 aa  50.1  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  26.79 
 
 		 531 aa  49.3  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  25.29 
 
 		 546 aa  48.5  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  25.31 
 
 		 560 aa  48.5  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1515  protein of unknown function DUF87  33.66 
 
 		 530 aa  48.5  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.649754  normal  0.132485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  32.93 
 
 		 593 aa  48.1  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  20.29 
 
 		 616 aa  47.8  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  27.74 
 
 		 492 aa  47.4  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  24.03 
 
 		 496 aa  47.4  0.0009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  32.61 
 
 		 570 aa  47  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2256  hypothetical protein  24.65 
 
 		 651 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.562267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  43.42 
 
 		 569 aa  47  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  22.22 
 
 		 564 aa  46.6  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  23.2 
 
 		 559 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  38.24 
 
 		 496 aa  46.2  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  39.71 
 
 		 591 aa  45.8  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1563  ATPase-like protein  26.67 
 
 		 611 aa  46.2  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1514  ATPase-like protein  26.67 
 
 		 611 aa  46.2  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  30.82 
 
 		 427 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  35.21 
 
 		 591 aa  45.8  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  36.49 
 
 		 550 aa  45.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0937  hypothetical protein  34.78 
 
 		 540 aa  45.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0147133  normal  0.254287 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  23.56 
 
 		 569 aa  44.7  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1374  protein of unknown function DUF87  27.45 
 
 		 538 aa  43.9  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  25.31 
 
 		 508 aa  43.9  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  31.94 
 
 		 526 aa  43.9  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  18.75 
 
 		 611 aa  43.9  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  29.41 
 
 		 575 aa  43.9  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>