More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2608 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2608  Sec-independent periplasmic protein translocase  100 
 
 		 752 aa  1477    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.161385  normal  0.756287 
 
 
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NC_013158  Huta_1033  Sec-independent periplasmic protein translocase  43.46 
 
 		 740 aa  599  1e-170  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00293211  n/a   
 
 
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NC_013202  Hmuk_0997  Sec-independent periplasmic protein translocase  42.32 
 
 		 734 aa  558  1e-157  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013922  Nmag_2050  Sec-independent periplasmic protein translocase  40.43 
 
 		 790 aa  522  1e-146  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.980125  n/a   
 
 
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NC_013743  Htur_0167  Sec-independent periplasmic protein translocase  39.47 
 
 		 788 aa  466  9.999999999999999e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
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NC_007355  Mbar_A2546  sec-independent protein translocase, protein  28.72 
 
 		 260 aa  97.8  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0790015  normal  0.700906 
 
 
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NC_014148  Plim_2680  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.69 
 
 		 389 aa  88.2  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.467706  n/a   
 
 
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NC_012039  Cla_0663  Sec-independent protein secretion pathway component TatC  34.62 
 
 		 247 aa  87  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003912  CJE0681  Sec-independent protein translocase TatC  27.02 
 
 		 245 aa  84  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0606  Sec-independent protein translocase TatC  27.02 
 
 		 245 aa  84  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  25.77 
 
 		 259 aa  82.4  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  25.77 
 
 		 259 aa  82.4  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal  1 
 
 
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NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  25.77 
 
 		 259 aa  82.4  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  25.77 
 
 		 259 aa  82.4  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  26.85 
 
 		 251 aa  82.4  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  25.77 
 
 		 259 aa  82.4  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.53 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
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NC_012917  PC1_4051  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  27.31 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009707  JJD26997_1091  Sec-independent protein translocase TatC  27.08 
 
 		 245 aa  80.5  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.379289  n/a   
 
 
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NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.28 
 
 		 324 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
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NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.84 
 
 		 468 aa  78.6  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_4242  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  27.31 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_3910  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  27.91 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1226  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.84 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039082 
 
 
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NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  34.62 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
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CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  25.38 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  25.38 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  25.38 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  25.38 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164858 
 
 
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NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  25.38 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  25.38 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  25.38 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  25.38 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142004 
 
 
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NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  25.38 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
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NC_008709  Ping_0318  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.4 
 
 		 258 aa  77  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_0253  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  26.36 
 
 		 256 aa  77  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.3231 
 
 
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NC_011126  HY04AAS1_1119  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.04 
 
 		 241 aa  76.3  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010681  Bphyt_3547  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32 
 
 		 259 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146328  hitchhiker  0.0021948 
 
 
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NC_007951  Bxe_A0411  Sec-independent protein translocase TatC  32 
 
 		 259 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.856028  normal  0.682623 
 
 
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NC_007954  Sden_0456  Sec-independent protein translocase TatC  28.33 
 
 		 261 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010085  Nmar_0774  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.87 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0166935 
 
 
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NC_011662  Tmz1t_0915  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.6 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008751  Dvul_1952  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  25.36 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal  1 
 
 
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NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  28.95 
 
 		 269 aa  73.9  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_2322  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.3 
 
 		 277 aa  73.9  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0472235  normal  0.432389 
 
 
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NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  27.04 
 
 		 266 aa  73.9  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_3226  hypothetical protein  25.37 
 
 		 257 aa  73.9  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.849662  normal  1 
 
 
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NC_013061  Phep_3820  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.94 
 
 		 297 aa  73.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00172839  normal  1 
 
 
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NC_008255  CHU_1460  Sec-independent protein translocase TatC  28.46 
 
 		 270 aa  73.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.403826  normal  0.0434954 
 
 
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NC_010622  Bphy_2746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.89 
 
 		 259 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal  1 
 
 
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NC_007643  Rru_A1771  Sec-independent protein translocase TatC  35.29 
 
 		 323 aa  72.8  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_0544  Sec-independent protein translocase TatC  29.24 
 
 		 246 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.371966  normal  1 
 
 
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NC_013512  Sdel_1453  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.82 
 
 		 253 aa  73.2  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.381621  n/a   
 
 
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NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  35.25 
 
 		 241 aa  72.8  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_3029  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.36 
 
 		 272 aa  72.8  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.244306  normal  1 
 
 
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NC_004347  SO_4204  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  30.77 
 
 		 249 aa  72  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_3940  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  25.24 
 
 		 258 aa  72  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009438  Sputcn32_0501  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.33 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_0276  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  25.24 
 
 		 258 aa  72  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014230  CA2559_12353  putative Sec-independent protein translocase component  32.31 
 
 		 281 aa  72  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.396462  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_3758  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  25.86 
 
 		 253 aa  72  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428108  n/a   
 
 
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NC_007204  Psyc_2002  Sec-independent protein translocase TatC  27.8 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.4915  normal  1 
 
 
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NC_011901  Tgr7_0221  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.77 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_0260  Sec-independent protein translocase TatC  33.85 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0872197  hitchhiker  0.00458614 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1036  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.71 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013456  VEA_001922  twin-arginine translocation protein TatC  28.64 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008322  Shewmr7_0400  Sec-independent protein translocase TatC  31.54 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3636  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  25.24 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1486  Sec-independent protein translocase TatC  32.2 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.450631  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_4215  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  23.79 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0094  Sec-independent protein translocase TatC  33.33 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0230182  n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_0426  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.14 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000454537 
 
 
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NC_011663  Sbal223_0440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.14 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.289196 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2305  Sec-independent protein translocase TatC  26.38 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.920568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3900  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.14 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0414  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.14 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2343  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.29 
 
 		 274 aa  70.5  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0131452  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1080  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.71 
 
 		 253 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.557784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3378  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  25.1 
 
 		 251 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.865812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0547  Sec-independent protein translocase TatC  29.05 
 
 		 245 aa  70.5  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0576043  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.29 
 
 		 254 aa  70.1  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.114268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3955  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  25.39 
 
 		 256 aa  70.1  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1039  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.71 
 
 		 253 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.21 
 
 		 262 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00567  Sec-independent protein translocase protein  24.53 
 
 		 249 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3556  Sec-independent protein translocase TatC  30.77 
 
 		 249 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0125  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.73 
 
 		 259 aa  68.9  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1489  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.23 
 
 		 275 aa  68.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0132  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  23.72 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  25 
 
 		 264 aa  68.9  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2427  hypothetical protein  27.4 
 
 		 250 aa  68.9  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2089  TatCD protein  28.79 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000492814  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2029  sec-independent protein translocase  28.79 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711776  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_2270  TatCD protein  28.79 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29917e-36 
 
 
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NC_008345  Sfri_0470  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.14 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4101  sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.92 
 
 		 255 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.84957 
 
 
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NC_010725  Mpop_3592  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.22 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.793751 
 
 
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NC_011989  Avi_2666  SEC-independent protein translocase protein  28.71 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341088  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_1687  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.55 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003910  CPS_3043  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  29.58 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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