More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2454 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2454  carboxyl transferase  100 
 
 		 612 aa  1238    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2913  Propionyl-CoA carboxylase  72.23 
 
 		 586 aa  829    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.615692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0008  Propionyl-CoA carboxylase  72.48 
 
 		 607 aa  897    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2122  Propionyl-CoA carboxylase  69.3 
 
 		 625 aa  847    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.893863  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1836  Propionyl-CoA carboxylase  44.94 
 
 		 520 aa  477  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101625  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2445  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  45.13 
 
 		 517 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2052  Propionyl-CoA carboxylase  46.46 
 
 		 518 aa  474  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00336851  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2360  propionyl-CoA carboxylase  44.81 
 
 		 513 aa  474  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.306025  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1807  propionyl-CoA carboxylase  45.3 
 
 		 513 aa  473  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2516  carboxyl transferase domain protein  43.89 
 
 		 513 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2553  carboxyl transferase domain-containing protein  44.07 
 
 		 513 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2332  propionyl-CoA carboxylase  44.03 
 
 		 513 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2291  propionyl-CoA carboxylase  44.22 
 
 		 513 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0918842  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2807  carboxyl transferase domain protein  43.89 
 
 		 513 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000977821 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2608  carboxyl transferase domain protein  44.07 
 
 		 513 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.444131  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2565  carboxyl transferase domain protein  44.03 
 
 		 513 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.89145e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2375  carboxyl transferase domain-containing protein  44.03 
 
 		 513 aa  465  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2552  carboxyl transferase domain-containing protein  44.03 
 
 		 513 aa  465  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.953071  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2186  Propionyl-CoA carboxylase  43.65 
 
 		 523 aa  440  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2164  propionyl-CoA carboxylase  43.91 
 
 		 522 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.207678  normal  0.196324 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1346  Propionyl-CoA carboxylase  43.38 
 
 		 508 aa  431  1e-119  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2212  Propionyl-CoA carboxylase  44.36 
 
 		 513 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000980367  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6415  Propionyl-CoA carboxylase  43.52 
 
 		 506 aa  426  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2300  Sigma 54 interacting domain protein  44.55 
 
 		 513 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.535149  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0027  propionyl-CoA carboxylase  43.62 
 
 		 510 aa  424  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1646  propionyl-CoA carboxylase  44.17 
 
 		 524 aa  422  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0403  propionyl-CoA carboxylase  42.88 
 
 		 510 aa  421  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0033  propionyl-CoA carboxylase  43.02 
 
 		 510 aa  411  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08220  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  40.79 
 
 		 537 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  37.69 
 
 		 508 aa  347  4e-94  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  37.71 
 
 		 515 aa  342  1e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  37.52 
 
 		 515 aa  341  2e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1593  Propionyl-CoA carboxylase  38.06 
 
 		 525 aa  340  4e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  34.94 
 
 		 531 aa  333  4e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  36.48 
 
 		 551 aa  330  5.0000000000000004e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  35.8 
 
 		 520 aa  329  8e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  34.01 
 
 		 518 aa  325  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  35.3 
 
 		 516 aa  324  3e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  34.93 
 
 		 516 aa  323  6e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  35.1 
 
 		 516 aa  322  1.9999999999999998e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  35.25 
 
 		 531 aa  320  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  35.19 
 
 		 512 aa  318  3e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1593  carboxyl transferase  35.01 
 
 		 514 aa  317  3e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0139637  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  37.37 
 
 		 513 aa  317  4e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  37.36 
 
 		 519 aa  317  5e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  35.93 
 
 		 530 aa  317  5e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  34.5 
 
 		 524 aa  316  9e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  34.81 
 
 		 529 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  35.98 
 
 		 513 aa  316  9.999999999999999e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0201  carboxyl transferase  34.23 
 
 		 521 aa  313  3.9999999999999997e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0217258  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0317  carboxyl transferase  37.86 
 
 		 514 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  36.1 
 
 		 550 aa  313  6.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  33.15 
 
 		 512 aa  313  6.999999999999999e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2348  carboxyl transferase  33.89 
 
 		 512 aa  312  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  34.88 
 
 		 527 aa  312  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0034  carboxyl transferase  37.09 
 
 		 516 aa  312  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3083  carboxyl transferase  37.09 
 
 		 516 aa  312  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0002503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  35.77 
 
 		 516 aa  312  1e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  33.03 
 
 		 516 aa  311  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13309  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 5 accD5  37.55 
 
 		 548 aa  311  2e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  35.06 
 
 		 527 aa  311  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4774  carboxyl transferase  36.52 
 
 		 538 aa  310  4e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0947  carboxyl transferase  34.2 
 
 		 513 aa  310  4e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592853  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0335  carboxyl transferase  37.42 
 
 		 514 aa  310  5e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868559  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  33.71 
 
 		 511 aa  310  5.9999999999999995e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  33.27 
 
 		 522 aa  310  5.9999999999999995e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  36.38 
 
 		 514 aa  310  5.9999999999999995e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  33.21 
 
 		 518 aa  308  1.0000000000000001e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  35.78 
 
 		 519 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1294  carboxyl transferase  36.89 
 
 		 556 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1311  carboxyl transferase  36.89 
 
 		 556 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0791098  normal  0.306854 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  35.78 
 
 		 519 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1330  carboxyl transferase  36.89 
 
 		 556 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  34 
 
 		 517 aa  307  4.0000000000000004e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  35.78 
 
 		 519 aa  307  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  35.73 
 
 		 520 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1677  carboxyl transferase  37.12 
 
 		 542 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  33.27 
 
 		 531 aa  306  9.000000000000001e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0156  carboxyl transferase  37.14 
 
 		 513 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.344953  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  33.08 
 
 		 528 aa  304  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0999  carboxyl transferase  38.89 
 
 		 527 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  34.66 
 
 		 517 aa  304  3.0000000000000004e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  33.65 
 
 		 516 aa  303  4.0000000000000003e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  34.38 
 
 		 522 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  33.97 
 
 		 515 aa  303  8.000000000000001e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  34.01 
 
 		 522 aa  303  9e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0889  carboxyl transferase  34.03 
 
 		 564 aa  302  1e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  35.76 
 
 		 513 aa  301  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1840  carboxyl transferase  36.29 
 
 		 542 aa  301  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  32.93 
 
 		 540 aa  301  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  38.11 
 
 		 518 aa  301  2e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  34.6 
 
 		 516 aa  301  3e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  34.24 
 
 		 516 aa  301  3e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  33.86 
 
 		 530 aa  301  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  33.96 
 
 		 521 aa  300  4e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  36.98 
 
 		 537 aa  300  5e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  34.13 
 
 		 534 aa  300  7e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3025  carboxyl transferase  36.75 
 
 		 532 aa  300  7e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.432014 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  33.46 
 
 		 510 aa  300  7e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  36.64 
 
 		 527 aa  300  7e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>