53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4453 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4453  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 
326 aa  657    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155685  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.63 
 
 
1343 aa  89.4  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  30.68 
 
 
1148 aa  73.2  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.27 
 
 
510 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  27.69 
 
 
958 aa  70.5  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  28.27 
 
 
1094 aa  69.7  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  31.82 
 
 
431 aa  63.2  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.62 
 
 
192 aa  61.6  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  28.71 
 
 
644 aa  61.6  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  26.13 
 
 
501 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.81 
 
 
1139 aa  60.1  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.22 
 
 
399 aa  60.1  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.48 
 
 
395 aa  59.7  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  26.81 
 
 
1224 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.69 
 
 
302 aa  58.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.65 
 
 
323 aa  55.8  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.56 
 
 
176 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  30.05 
 
 
299 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.02 
 
 
1181 aa  54.3  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.38 
 
 
251 aa  53.5  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 
180 aa  53.1  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.14 
 
 
331 aa  52.8  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.66 
 
 
321 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  29.74 
 
 
1133 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  27.03 
 
 
493 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  26.87 
 
 
886 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  25.55 
 
 
546 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  25.39 
 
 
517 aa  50.4  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2826  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.09 
 
 
157 aa  49.7  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.62 
 
 
200 aa  49.3  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  42.42 
 
 
959 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.73 
 
 
524 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.56 
 
 
313 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2470  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.92 
 
 
395 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0469  HEAT domain containing protein  34.29 
 
 
374 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.421538 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.75 
 
 
490 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3638  HEAT domain containing protein  27.92 
 
 
395 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.942525  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.66 
 
 
821 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.1 
 
 
1412 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 
1438 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.44 
 
 
321 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0133  HEAT repeat-containing PBS lyase  31 
 
 
197 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000842725  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.17 
 
 
214 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.76 
 
 
173 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1889  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.86 
 
 
331 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.826607  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.16 
 
 
157 aa  43.9  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  30.77 
 
 
199 aa  43.9  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1313  hypothetical protein  26.27 
 
 
361 aa  43.1  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0517  hypothetical protein  40.28 
 
 
124 aa  43.1  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.302016  normal  0.633318 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  27.87 
 
 
838 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  33 
 
 
232 aa  43.1  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  40 
 
 
1204 aa  42.7  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  36.46 
 
 
319 aa  42.4  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>