34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2194 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1662  adenine specific DNA methyltransferase  37.05 
 
 		 1005 aa  676    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2194  superfamily II DNA/RNA helicase  100 
 
 		 1021 aa  2125    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1937  superfamily II DNA/RNA helicase  49.22 
 
 		 1024 aa  1013    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00156892  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0037  helicase domain protein  35.29 
 
 		 1636 aa  542  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.527167  n/a   
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E6  superfamily II DNA/RNA helicase  34.73 
 
 		 1560 aa  533  1e-150  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0578  type III restriction enzyme, res subunit  35.08 
 
 		 1609 aa  525  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14100  predicted helicase  34.99 
 
 		 1847 aa  525  1e-147  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0102  adenine specific DNA methyltransferase, putative  33.93 
 
 		 1615 aa  524  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675246  hitchhiker  0.0000128241 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2642  type III restriction protein res subunit  35.49 
 
 		 1632 aa  516  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4323  type III restriction enzyme, res subunit  35.33 
 
 		 1613 aa  504  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3139  helicase domain-containing protein  31.79 
 
 		 576 aa  278  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0378  helicase domain-containing protein  33.96 
 
 		 475 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3143  helicase domain-containing protein  38.75 
 
 		 1063 aa  248  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.833808  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0310  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase, putative  24.32 
 
 		 1116 aa  191  5e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1765  hypothetical protein  27.24 
 
 		 1098 aa  177  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0925  adenine specific DNA methyltransferase  26.63 
 
 		 1049 aa  176  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00490448  normal  0.369503 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1196  adenine specific DNA methyltransferase  24.21 
 
 		 1059 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000965363  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0380  DEAD/DEAH box helicase-like  35.98 
 
 		 1301 aa  164  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3195  adenine specific DNA methyltransferase  25.19 
 
 		 1125 aa  155  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000607783  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0499  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase, putative  21.71 
 
 		 1047 aa  152  3e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0340  adenine specific DNA methyltransferase  22.65 
 
 		 1064 aa  144  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0570393 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1350  hypothetical protein  40.69 
 
 		 221 aa  122  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.588656  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2721  putative DNA methyltransferase  22.03 
 
 		 1121 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3803  helicase-like protein  22.81 
 
 		 1176 aa  105  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230182  hitchhiker  0.00335378 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0066  hypothetical protein  37.65 
 
 		 165 aa  100  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1102  putative DNA methyltransferase  22.46 
 
 		 1100 aa  90.9  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.822518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0964  helicase domain-containing protein  37.35 
 
 		 84 aa  67.8  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.317266  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0961  hypothetical protein  37.08 
 
 		 110 aa  59.7  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.298352  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0786  N-6 DNA methylase  31.62 
 
 		 710 aa  48.1  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.798778  normal  0.467887 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04061  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  31.3 
 
 		 703 aa  47.8  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4361  N-6 DNA methylase  24.73 
 
 		 908 aa  46.2  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0269  N-6 DNA methylase  24.35 
 
 		 519 aa  45.8  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5510  putative DNA methyltransferase  25.16 
 
 		 555 aa  45.8  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113009  normal  0.19164 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  20.85 
 
 		 673 aa  45.4  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>