More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1495 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1495  integral membrane protein MviN  100 
 
 
497 aa  975    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0967  integral membrane protein MviN  38.88 
 
 
501 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.218762  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1786  integral membrane protein MviN  30 
 
 
494 aa  203  5e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  29.59 
 
 
526 aa  201  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  31.98 
 
 
521 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  32.38 
 
 
522 aa  195  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  29.84 
 
 
508 aa  191  4e-47  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  30.33 
 
 
512 aa  190  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  35.08 
 
 
522 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  30.8 
 
 
521 aa  189  7e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  30.9 
 
 
517 aa  188  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  30.9 
 
 
517 aa  188  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  30.27 
 
 
522 aa  186  9e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  33.33 
 
 
522 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  30.99 
 
 
515 aa  185  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  31.12 
 
 
523 aa  184  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0761  integral membrane protein MviN  31.28 
 
 
495 aa  184  3e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  30.88 
 
 
523 aa  184  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  31.86 
 
 
529 aa  183  7e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  30.73 
 
 
515 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  29.67 
 
 
523 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  28.06 
 
 
511 aa  179  9e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  33.06 
 
 
522 aa  177  5e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  30.17 
 
 
511 aa  176  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  27.78 
 
 
511 aa  176  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  29.78 
 
 
521 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  29.69 
 
 
521 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  27.31 
 
 
511 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  32.77 
 
 
521 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1607  integral membrane protein MviN  32.49 
 
 
469 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.916233  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  31.7 
 
 
519 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  29.27 
 
 
512 aa  172  9e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  33.16 
 
 
516 aa  172  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  29.62 
 
 
513 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  29.45 
 
 
512 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  27.41 
 
 
522 aa  171  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  31.19 
 
 
522 aa  171  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  28.69 
 
 
512 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  28.69 
 
 
512 aa  170  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  30.17 
 
 
511 aa  169  7e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  30.17 
 
 
511 aa  169  7e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  30.17 
 
 
511 aa  169  7e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  29.22 
 
 
512 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  30.17 
 
 
511 aa  169  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  29.75 
 
 
525 aa  169  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  28.71 
 
 
517 aa  169  9e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  29.84 
 
 
517 aa  169  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  28.97 
 
 
530 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  29.93 
 
 
511 aa  169  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  29.93 
 
 
511 aa  169  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  29.93 
 
 
511 aa  169  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  29.93 
 
 
511 aa  169  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  29.93 
 
 
511 aa  169  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  29.62 
 
 
530 aa  169  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  28.7 
 
 
573 aa  169  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  30.71 
 
 
521 aa  169  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  28.16 
 
 
524 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  29.02 
 
 
495 aa  169  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1010  integral membrane protein MviN  30.36 
 
 
495 aa  169  2e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0666785  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  30.67 
 
 
511 aa  169  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0415  virulence factor  28.78 
 
 
518 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000799627  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  29.93 
 
 
524 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  29.2 
 
 
530 aa  167  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  29.93 
 
 
524 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  29.98 
 
 
498 aa  167  4e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  29.93 
 
 
524 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0703  integral membrane protein MviN  30.82 
 
 
511 aa  167  4e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.220129  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  29.93 
 
 
524 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  29.93 
 
 
524 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  29.07 
 
 
534 aa  167  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  29.52 
 
 
511 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  30.47 
 
 
519 aa  166  6.9999999999999995e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  28.35 
 
 
519 aa  166  8e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0997  integral membrane protein MviN  28.38 
 
 
531 aa  166  9e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000225654  hitchhiker  0.00636735 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  29.01 
 
 
519 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  27.31 
 
 
512 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  30.2 
 
 
511 aa  165  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  29.72 
 
 
521 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  31.28 
 
 
512 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  28.28 
 
 
511 aa  164  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  28.32 
 
 
519 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  30.91 
 
 
516 aa  163  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  28.28 
 
 
542 aa  163  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2251  membrane protein MviN  28.93 
 
 
513 aa  162  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0136199  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  30.62 
 
 
512 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  27.69 
 
 
512 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  29.34 
 
 
519 aa  161  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  27.31 
 
 
528 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1081  integral membrane protein MviN  30.21 
 
 
519 aa  160  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00472684  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004421  hypothetical protein  28.04 
 
 
520 aa  160  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000372973  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  31.53 
 
 
513 aa  160  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  28.9 
 
 
519 aa  160  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3138  integral membrane protein MviN  27.84 
 
 
519 aa  160  7e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000568418  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1590  integral membrane protein MviN  26.34 
 
 
521 aa  159  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.814029  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  27.45 
 
 
514 aa  159  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1455  integral membrane protein MviN  29.68 
 
 
517 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  28.6 
 
 
519 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3273  integral membrane protein MviN  29.02 
 
 
521 aa  159  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  27.46 
 
 
505 aa  158  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00978  hypothetical protein  30.42 
 
 
511 aa  158  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>