151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0493 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0493  amino acid-binding ACT domain protein  100 
 
 		 165 aa  327  4e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0896  amino acid-binding ACT domain protein  43.79 
 
 		 173 aa  128  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00320944  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3496  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.57 
 
 		 181 aa  117  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3457  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  38.29 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0527  amino acid-binding ACT domain protein  36.67 
 
 		 185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3514  amino acid-binding ACT domain-containing protein  36.84 
 
 		 186 aa  110  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.160997  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2533  glycine cleavage system regulatory protein  36.57 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4386  amino acid-binding ACT domain-containing protein  35.84 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.523733  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4055  amino acid-binding ACT domain protein  34.09 
 
 		 188 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3554  amino acid-binding ACT  32.02 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0217681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3969  amino acid-binding ACT domain protein  32.39 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100488  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4707  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.03 
 
 		 170 aa  99.8  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4333  normal  0.012003 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4273  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.82 
 
 		 179 aa  96.3  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340897  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2032  amino acid-binding ACT domain protein  33.33 
 
 		 178 aa  88.2  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0169147  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8574  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  26.99 
 
 		 165 aa  85.1  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0599  amino acid-binding ACT domain protein  27.43 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0437  ACT domain protein  27.43 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2949  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.25 
 
 		 183 aa  72  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0621  amino acid-binding ACT domain protein  25.29 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0826  amino acid-binding ACT domain protein  28.22 
 
 		 184 aa  70.5  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.892136  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0479  ACT domain-containing protein  26.59 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2199  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.22 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0596072  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92913  predicted protein  21.97 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00941527  normal  0.3672 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02371  DNA-binding transcriptional repressor, regulatory protein accessory to GcvA  28.99 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1190  amino acid-binding ACT domain protein  28.99 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02333  hypothetical protein  28.99 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3701  glycine cleavage system transcriptional repressor  28.99 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05930  ACT domain-containing regulatory protein  28.49 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000527553  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1197  glycine cleavage system transcriptional repressor  28.99 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2626  glycine cleavage system transcriptional repressor  28.99 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2611  glycine cleavage system transcriptional repressor  28.99 
 
 		 212 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2761  glycine cleavage system transcriptional repressor  28.99 
 
 		 212 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2851  glycine cleavage system transcriptional repressor  28.99 
 
 		 212 aa  64.3  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1965  ACT domain-containing protein  26.59 
 
 		 183 aa  63.9  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2724  glycine cleavage system transcriptional repressor  29.41 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2749  glycine cleavage system transcriptional repressor  29.41 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2635  glycine cleavage system transcriptional repressor  29.41 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2856  glycine cleavage system transcriptional repressor  29.41 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2683  glycine cleavage system transcriptional repressor  29.41 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0411  amino acid-binding ACT domain protein  27.44 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.404844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4699  amino acid-binding ACT  28.41 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000305264  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06310  ACT domain-containing protein  27.62 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183389  normal  0.204088 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03152  ACT domain protein  24.24 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0587  hypothetical protein  26.14 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000555119  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2075  ACT domain-containing protein  42.86 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2002  amino acid-binding ACT domain-containing protein  24.86 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5182  ACT domain-containing protein  27.17 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248291  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2479  amino acid-binding ACT domain-containing protein  25.77 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1136  glycine cleavage system transcriptional repressor  28.99 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0052  glycine cleavage system transcriptional repressor  24.28 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.824677  normal  0.630988 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1943  amino acid-binding ACT domain-containing protein  25.15 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3180  glycine cleavage system transcriptional repressor  28.4 
 
 		 183 aa  57  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0481  ACT domain protein  27.75 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000098406  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2117  hypothetical protein  40.51 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2975  glycine cleavage system transcriptional repressor  27.71 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.457313 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0332  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.01 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1847  amino acid-binding ACT domain-containing protein  22.35 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00121314  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1683  hypothetical protein  37.18 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0230  hypothetical protein  37.18 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.867874  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2118  hypothetical protein  29.63 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0918  hypothetical protein  37.18 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0844317  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0758  hypothetical protein  32.05 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.140436 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2985  amino acid-binding ACT domain protein  28.99 
 
 		 204 aa  53.9  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3703  glycine cleavage system regulatory protein-like  21.47 
 
 		 183 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1017  ACT domain-containing protein  35.37 
 
 		 95 aa  53.5  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.890596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1273  amino acid-binding ACT domain protein  25.75 
 
 		 177 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3885  ACT domain-containing protein  27.22 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3321  amino acid-binding ACT  30.12 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1071  amino acid-binding ACT domain protein  27.81 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45408  predicted protein  23.3 
 
 		 220 aa  52.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2176  amino acid-binding ACT domain-containing protein  21.76 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00808907  normal  0.900227 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2229  amino acid-binding ACT domain protein  25.88 
 
 		 181 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0964148 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0342  ACT domain-containing protein  37.84 
 
 		 90 aa  52.4  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3510  glycine cleavage system transcriptional repressor  27.49 
 
 		 228 aa  52.4  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.261645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0278  amino acid-binding ACT domain protein  25.42 
 
 		 196 aa  51.6  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.305725  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3283  hypothetical protein  32.1 
 
 		 99 aa  52  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2431  amino acid-binding ACT domain-containing protein  22.35 
 
 		 179 aa  52  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0267912  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1378  hypothetical protein  32.47 
 
 		 93 aa  51.6  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000129759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1034  hypothetical protein  37.14 
 
 		 90 aa  51.6  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1979  amino acid-binding ACT domain-containing protein  22.81 
 
 		 178 aa  51.6  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00211865  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2525  glycine cleavage system transcriptional repressor  23.84 
 
 		 177 aa  51.2  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1863  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  21.51 
 
 		 178 aa  50.8  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000211112  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1534  hypothetical protein  33.33 
 
 		 90 aa  50.8  0.000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3182  hypothetical protein  29.63 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  hitchhiker  0.00106731 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4173  formyl transferase-like  25.44 
 
 		 385 aa  50.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1734  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  21.84 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.103341  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14440  hypothetical protein  38.46 
 
 		 89 aa  50.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1246  glycine cleavage system transcriptional repressor  26.63 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03188  glycine cleavage system transcriptional repressor  24.29 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3131  glycine cleavage system transcriptional repressor  26.63 
 
 		 204 aa  50.4  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.590147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1361  glycine cleavage system transcriptional repressor  26.63 
 
 		 204 aa  50.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.243595  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18740  glycine cleavage system regulatory protein  27.33 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.960027  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1150  cellulose-binding family II protein  26.55 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.768713 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0612  hypothetical protein  28.4 
 
 		 92 aa  49.7  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287518  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0587  hypothetical protein  40.3 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1126  hypothetical protein  34.67 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000365501  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002792  glycine cleavage system transcriptional antiactivator GcvR  23.73 
 
 		 180 aa  49.7  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1251  formyl transferase domain protein  33.78 
 
 		 327 aa  48.1  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1909  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  23.35 
 
 		 175 aa  48.1  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0700677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1354  hypothetical protein  31.58 
 
 		 93 aa  48.1  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>