More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0231 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0231  cysteine synthase B  100 
 
 		 321 aa  653    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000104682  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0839  cysteine synthase B  65.81 
 
 		 316 aa  410  1e-113  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0067092  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1677  cysteine synthase  56.85 
 
 		 317 aa  353  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0746  cysteine synthases  54.3 
 
 		 305 aa  330  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1314  cysteine synthase  53.36 
 
 		 322 aa  323  2e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2678  cysteine synthase  50.85 
 
 		 318 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3609  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  49.01 
 
 		 317 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.746552  normal  0.0138185 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0315  cysteine synthase  50.33 
 
 		 318 aa  300  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.70232  normal  0.0509531 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0720  cysteine synthase  50 
 
 		 321 aa  291  9e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0478  cysteine synthases  50.17 
 
 		 773 aa  289  3e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00249553  hitchhiker  0.000140585 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3005  cysteine synthase B  47.95 
 
 		 308 aa  278  7e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.951108  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1166  cysteine synthase  49.49 
 
 		 771 aa  271  8.000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0952  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  48.99 
 
 		 309 aa  270  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  47.46 
 
 		 302 aa  268  5.9999999999999995e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0830  cysteine synthase  51.36 
 
 		 764 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.246504 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0822  cysteine synthase  52.05 
 
 		 307 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1096  cysteine synthase  45.76 
 
 		 299 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.365638 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1024  cysteine synthase  50.85 
 
 		 305 aa  266  4e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18883  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3163  cysteine synthase  45.76 
 
 		 354 aa  266  4e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4179  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  50.17 
 
 		 313 aa  265  5.999999999999999e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.703347  normal  0.895725 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3359  cysteine synthases  47.99 
 
 		 305 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2362  cysteine synthase B  46.31 
 
 		 290 aa  257  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.688309  normal  0.140538 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1036  cysteine synthase  47.49 
 
 		 768 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.876649  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3252  cysteine synthase B  46.67 
 
 		 291 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163683 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2102  cysteine synthase B  45.15 
 
 		 296 aa  251  9.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0684  cysteine synthase B  45.61 
 
 		 294 aa  251  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1251  cysteine synthase B  47.12 
 
 		 297 aa  249  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.122681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5857  cysteine synthase B  45.61 
 
 		 290 aa  249  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1285  cysteine synthase  47.97 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1287  cysteine synthase B  47.3 
 
 		 299 aa  245  6.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.257463 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6440  cysteine synthase B  43.96 
 
 		 294 aa  245  9e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0264  cysteine synthase  47.1 
 
 		 308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.170266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2454  cysteine synthase  44.18 
 
 		 294 aa  239  5e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0944548  normal  0.580019 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2832  cysteine synthase B  44.18 
 
 		 294 aa  239  5e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37080  cysteine synthase B  46.28 
 
 		 299 aa  239  5.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1654  cysteine synthase B  45.73 
 
 		 299 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0738123  normal  0.776685 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1255  cysteine synthase B  45.73 
 
 		 312 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152363  hitchhiker  0.00382615 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4064  cysteine synthase B  45.73 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6176  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.04 
 
 		 322 aa  236  4e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0964  cysteine synthase B  45.79 
 
 		 297 aa  236  4e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2504  cysteine synthase B  46.44 
 
 		 295 aa  236  5.0000000000000005e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52210  cysteine synthase B  45.27 
 
 		 299 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.183215 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3031  cysteine synthase B  45.92 
 
 		 296 aa  235  7e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1692  cysteine synthase B  45.27 
 
 		 300 aa  235  9e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3697  cysteine synthase B  44.59 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.703798  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4578  cysteine synthase B  44.93 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1005  cysteine synthase B  44.26 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.817675  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1899  cysteine synthase B  45.39 
 
 		 295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.512952  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4219  cysteine synthase B  44.82 
 
 		 313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0547109  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3199  cysteine synthase B  44.78 
 
 		 293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.707785  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1215  cysteine synthase B  44.71 
 
 		 312 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1861  cysteine synthase B  45.61 
 
 		 295 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  44.93 
 
 		 297 aa  232  8.000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1303  cysteine synthase B  43.39 
 
 		 292 aa  230  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.498371  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1412  cysteine synthase B  43.33 
 
 		 292 aa  229  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.203131  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2765  cysteine synthase B  43.39 
 
 		 292 aa  230  3e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  hitchhiker  0.00234405 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3277  cysteine synthase B  43.48 
 
 		 293 aa  228  8e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1100  cysteine synthase B  44.07 
 
 		 297 aa  226  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2676  cysteine synthase B  41.28 
 
 		 303 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1352  cysteine synthase B  43.15 
 
 		 297 aa  225  7e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.078483  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02321  cysteine synthase B (O-acetylserine sulfhydrolase B)  42.05 
 
 		 303 aa  225  8e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1258  cysteine synthase B  42.05 
 
 		 303 aa  225  8e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111513 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2585  cysteine synthase B  41.61 
 
 		 303 aa  225  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02282  hypothetical protein  42.05 
 
 		 303 aa  225  8e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2557  cysteine synthase B  42.05 
 
 		 303 aa  225  8e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2793  cysteine synthase B  42.05 
 
 		 303 aa  225  8e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2634  cysteine synthase B  41.61 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.031236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2806  cysteine synthase B  41.28 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2560  cysteine synthase B  45.12 
 
 		 300 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2576  cysteine synthase B  42.05 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.717552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0768  cysteine synthase B  43.67 
 
 		 293 aa  224  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2700  cysteine synthase B  41.61 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.227311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3651  cysteine synthase B  42.05 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.370065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1733  cysteine synthase B  43.24 
 
 		 301 aa  223  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217633  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1240  cysteine synthase B  41.72 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0351057  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2707  cysteine synthase B  41.72 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.397465  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0508  cysteine synthase B  43.92 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  43.61 
 
 		 303 aa  223  4e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1006  cysteine synthase B  42.12 
 
 		 292 aa  223  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000380642  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0064  cysteine synthase B  42.32 
 
 		 295 aa  222  7e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0917  cysteine synthase B  43.58 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2239  cysteine synthase B  45.08 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226796 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0731  cysteine synthase B  44.11 
 
 		 311 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3188  cysteine synthase B  42.12 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.124444  normal  0.617635 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  41.86 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3291  cysteine synthase B  41.98 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00528645  normal  0.163316 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0998  cysteine synthase B  41.98 
 
 		 292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0298171  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3598  cysteine synthase B  42.41 
 
 		 288 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1306  cysteine synthase B  43.81 
 
 		 302 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000334367  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3091  cysteine synthase B  41.78 
 
 		 292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134095  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0858  cysteine synthase B  42.91 
 
 		 300 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.947605 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2947  cysteine synthase B  41.61 
 
 		 303 aa  220  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.209095  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1014  cysteine synthase B  43.92 
 
 		 300 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.440167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0576  cysteine synthase B  43.92 
 
 		 300 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353475  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1646  cysteine synthase B  43.92 
 
 		 303 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1067  cysteine synthase B  41.98 
 
 		 292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000450075  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1100  cysteine synthase B  41.98 
 
 		 292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00123647  normal  0.0556364 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1055  cysteine synthase B  43.92 
 
 		 325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2249  cysteine synthase B  44.26 
 
 		 300 aa  219  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0346  cysteine synthase B  42.91 
 
 		 318 aa  219  6e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>