64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_tLeu01 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_tLeu01  tRNA-Leu  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0031  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  103  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0030  tRNA-Leu  90.79 
 
 		 87 bp  95.6  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0016  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 87 bp  93.7  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0022  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 87 bp  87.7  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.060501 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna20  tRNA-Leu  94.64 
 
 		 87 bp  87.7  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0035  tRNA-Leu  89.33 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000157921  normal  0.648742 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0021  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0128  tRNA-Leu  88.16 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000373913 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0028  tRNA-Leu  88.16 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041219 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t094  tRNA-Leu  88.16 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0021  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0029  tRNA-Leu  88 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000207645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0044  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0118  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0049  tRNA-Leu  85.33 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.511085 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t075  tRNA-Leu  88.14 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000081141 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0026  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0032  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.571697 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0021  tRNA-Leu  88.52 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0075  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.537115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0032  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00145476  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0066  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0047  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.306057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0044  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0708961  normal  0.218252 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0016  tRNA-Leu  85.25 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57692  normal  0.238964 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0043  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0222956  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0081  tRNA-Leu  83.12 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0026  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802213  normal  0.744604 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0079  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0051  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00133482  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0074  tRNA-Leu  84.09 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.300067  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0048  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS02662  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0047  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0023  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.618598  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0023  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0188158  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0019  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000107083  hitchhiker  3.09031e-20 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0017  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000565003  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0032  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000393185  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0748  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.183194  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00479422  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0034  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159926  normal  0.424933 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0013  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356176  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0069  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000612971 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0031  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.372245 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0029  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00150369  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2245  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000124407  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2160  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000000935406  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1032  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.56958  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0030  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.624579  normal  0.3525 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1729  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.716299  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0184  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0050  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.131977 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0041  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 86 bp  44.1  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0023  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0020  tRNA-Leu  84.48 
 
 		 86 bp  44.1  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00905739 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R73  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA20  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t19  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.207136  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.201383  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t19  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 82 bp  44.1  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39518  normal  0.0378684 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>