32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_R0032 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00145476  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0074  tRNA-Leu  91.95 
 
 		 86 bp  109  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.300067  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0023  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.618598  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0026  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  87.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0364894  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0035  tRNA-Leu  87.95 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000157921  normal  0.648742 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0029  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000207645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0044  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0066  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0822521 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0062  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000163456  normal  0.0301786 
 
 
-
 
NC_006368  lppt12  tRNA-Leu  88.33 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt12  tRNA-Leu  88.33 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2079  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000217449  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna084  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0135  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.512997 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0141  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232513 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03630  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0042  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.30317  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0108  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425396  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0862  tRNA-Leu  86.67 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1154  tRNA-Leu  86.67 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0023  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.514859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLeu01  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0035  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2315  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.627024  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0748  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0050  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.131977 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0023  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0023  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0029  tRNA-Leu  84.38 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000250179  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0016  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0063  tRNA-Leu  82.43 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000700338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0040  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>